| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,179,611 | Δ1 bp :: IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 17.0% | intergenic (+15/‑128) | tolC → / → ygiB | transport channel/DUF1190 family protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 31 (0.140) | 23/270 | NT | 15.1% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3179611 = | 167 (0.770) | intergenic (+15/‑133) | tolC/ygiB | transport channel/DUF1190 family protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 37 (0.160) | 25/270 | NT | 17.6% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3179616 | 166 (0.760) | intergenic (+20/‑128) | tolC/ygiB | transport channel/DUF1190 family protein | |||||
CTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2515474‑2515616‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAAC < NC_000913/3179616‑3179468 CTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGC > 2:2430313/1‑150 GGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCC > 2:1304331/1‑150 GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCA > 2:3739742/1‑150 GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCA > 2:2897687/1‑150 GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCAACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCA > 2:2897762/1‑150 TTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTA > 1:1880516/1‑150 TTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTA > 1:1271204/1‑150 AAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGT < 1:791825/150‑1 ACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGT > 1:1984697/1‑150 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCGGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTG > 1:1350166/1‑150 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTG > 1:775364/1‑150 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTG > 1:598766/1‑150 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTG > 1:3172787/1‑150 TTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGC > 1:2755484/1‑150 TTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGC < 1:3484728/150‑1 AAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGATACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGA > 2:1049724/1‑150 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGAT > 1:143091/1‑150 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTG < 1:3749193/150‑1 GGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGA < 2:2358813/150‑1 GCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAA < 2:790005/150‑1 GCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAA < 2:3589912/150‑1 TTAACGAGGCACCGAGGCTTCGCATTCTTCAGTTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGT < 1:2589329/150‑1 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTG > 1:670727/1‑150 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTG > 1:670816/1‑150 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGGTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTG > 1:670797/1‑150 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTTGTGCGTGCGTATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCG < 1:596676/150‑1 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCG < 2:2529104/150‑1 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGG > 2:173702/1‑150 AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGG < 2:789558/150‑1 AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGG < 2:789582/150‑1 TCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCAT > 1:3095642/1‑150 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAAC < 1:3739742/150‑1 TTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCA > 1:2469979/1‑150 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAG < 1:447275/150‑1 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTTTGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCA < 1:3748904/150‑1 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCA < 1:2436843/150‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTC < 1:1662084/150‑1 GGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAA < 2:1259562/150‑1 GGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAA > 1:1078361/1‑150 GGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAA < 1:3756939/150‑1 GGCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAA > 1:1078728/1‑150 GCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAAC > 1:2667045/1‑150 GCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAAC > 1:1904585/1‑150 CTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2515474‑2515616‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCGAAGCCCCGTCGTCGTCATCAGTTACGGAAAGGGTTATGACCGTTACTGGTGGTAGTGCGTGCGGATGTTTGCTGAACGACTGGTGCCGGGCTATCAGGCGCATAACCATCAGCAATAGCATTCTGTTCCGGCGTTTGCGGTGCAAC < NC_000913/3179616‑3179468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |