| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,147,021 | T→C | M174V (ATG→GTG) | alkA ← | 3‑methyl‑adenine DNA glycosylase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,147,021 | 0 | T | C | 95.2% | 298.0 / 3.6 | 83 | M174V (ATG→GTG) | alkA | 3‑methyl‑adenine DNA glycosylase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base C (33/46); total (35/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
CAGCGCCCGATACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCATACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCGCC > NC_000913/2146888‑2147157 | cAGCGCCCGATACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTaa < 2:166140/140‑1 (MQ=255)cAGCGCCCGATACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTaa < 1:92556/140‑1 (MQ=255)cAGCGCCCGAGACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTaa < 1:407822/140‑1 (MQ=255) gATATCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATTAATGAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTa < 2:1290305/140‑1 (MQ=255) gATACCCTGAAAAGTTTGCAGCGTTTACATCGCCAGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCATCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTa < 2:533423/140‑1 (MQ=255) gATACCCGGAAATGTTTGAAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTa < 2:1700169/140‑1 (MQ=255) gATACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTa < 1:813995/140‑1 (MQ=255) tACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCATACCTAACGCTTTTAAt > 1:47034/1‑140 (MQ=255) gAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGc > 2:753271/1‑140 (MQ=255) gAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAAAGCCTGc > 2:753279/1‑140 (MQ=255) gAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCAGTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCAATAGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTACAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGc > 2:753273/1‑140 (MQ=255) aGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGt < 1:770958/140‑1 (MQ=255) aGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGATCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGt < 2:894349/140‑1 (MQ=255) gCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCATACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTg > 1:455214/1‑140 (MQ=255) gCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTg > 2:1111347/1‑140 (MQ=255) cTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAg > 1:1080243/1‑140 (MQ=255) cTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCg > 1:1715659/1‑140 (MQ=255) cacaTCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCg < 2:177693/140‑1 (MQ=255) cacaTCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCg < 2:177564/140‑1 (MQ=255) aTCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGa < 2:673106/140‑1 (MQ=255) aTCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGa < 1:212218/140‑1 (MQ=255) aTCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGa < 1:213228/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAg < 2:208058/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAg < 2:1029774/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAg < 2:1293060/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAg < 2:741793/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAg < 1:1143841/140‑1 (MQ=255) cGCCCGGTATTGACATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAg < 2:207905/140‑1 (MQ=255) cccGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCa > 2:241824/1‑140 (MQ=255) cccGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCa > 1:1756489/1‑140 (MQ=255) cccGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCa > 1:634877/1‑140 (MQ=255) aTTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGAtata < 1:1146174/140‑1 (MQ=255) aTTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGAtata < 1:1286832/140‑1 (MQ=255) tGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACt > 1:136024/1‑140 (MQ=255) tGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACt > 1:136105/1‑140 (MQ=255) tCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTcc > 1:160257/1‑140 (MQ=255) tCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCAAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTTCCAGCCGCTGAGGCGTCGGTAAGCAGATATACTcc > 1:1596844/1‑140 (MQ=255) cATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCg > 2:677620/1‑140 (MQ=255) tGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGTGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGaa > 1:1694135/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGACGCAGATATACTCCGGaaa > 2:1483546/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGaaa > 1:1297067/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGaaa > 1:578085/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGaaa > 1:577893/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTAAATGCCTGCGGGTCTGCTGCAGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGaaa > 1:942861/1‑140 (MQ=255) ggTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAatcat > 1:1552896/1‑140 (MQ=255) ggTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAatcat > 1:1223465/1‑140 (MQ=255) ggTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAatcat > 1:1552889/1‑140 (MQ=255) cccTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAg > 1:1538827/1‑140 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCATACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 1:1145004/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCATACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 1:269282/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTACTGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 2:176486/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 2:634877/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 2:1062810/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 2:718816/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 2:719100/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 1:828480/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 1:794683/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGtt < 1:734093/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTAAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCCtt < 2:1065824/140‑1 (MQ=255) gcgcCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCg < 2:507824/140‑1 (MQ=255) gcgcCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATAATCCAGCCGTTCg > 2:428209/1‑140 (MQ=255) cATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATaa > 2:129705/1‑140 (MQ=255) tttGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTCACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAg < 2:922510/140‑1 (MQ=255) tttGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAg < 2:1756489/140‑1 (MQ=255) tttGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCCAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAACTCATCCAGCCGTTCGCCATaacg < 2:1243300/140‑3 (MQ=255) gCCAGATGACTCAGCGCCTCTGCCCTTTTCAACGGCACACCTAACGCTTGTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCGGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCtg < 2:1392262/140‑1 (MQ=255) gCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCtg < 1:1570469/140‑1 (MQ=255) gCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCtg < 1:1686522/140‑1 (MQ=255) gCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCtg < 2:1520263/140‑1 (MQ=255) gCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCtg < 2:1578830/140‑1 (MQ=255) aGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGc < 2:909368/140‑1 (MQ=255) gttGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGATCTCCATAAAGCTGTGcc > 2:878154/3‑140 (MQ=255) tCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTg > 1:134411/1‑140 (MQ=255) tCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTg > 1:138226/1‑140 (MQ=255) ctGCCCGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAAt > 1:685336/1‑140 (MQ=255) cccGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAAtttt > 1:271604/1‑140 (MQ=255) cccGTTTCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAAtttt > 1:195655/1‑140 (MQ=255) ttCAACGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTgccgc > 1:1060584/1‑140 (MQ=255) cGGCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCg < 2:911962/140‑1 (MQ=255) gCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCTCTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCGcc < 2:1167654/140‑1 (MQ=255) gCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCGcc < 2:1167626/140‑1 (MQ=255) gCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCGcc < 1:365756/140‑1 (MQ=255) gCACACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCGcc < 1:365677/140‑1 (MQ=255) | CAGCGCCCGATACCCGGAAAAGTTTGCAGCGTTTTCATCGCCTGCTCCACATCGCCCGGTATTGTCATTGGTAAGGTGCCCTCCAGCGCCGCATTTGCCAGATGAATCAGCGCCTCTGCCCGTTTCAACGGCATACCTAACGCTTTTAATGCCTGCGGGTCTGCTGCTGCCAGCCGCTGAGGCGTCGGGAAGCAGATATACTCCGGAAAATCATCCAGCCGTTCGCCATAAAGCTGTGCCACTCTGGCGGTCAATTTTGCCGCCATCGCC > NC_000913/2146888‑2147157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |