| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,471,252 | T→C | N89S (AAC→AGC) | yfdK ← | CPS‑53 (KpLE1) prophage; conserved protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,471,252 | 0 | T | C | 98.7% | 301.4 / ‑4.1 | 80 | N89S (AAC→AGC) | yfdK | CPS‑53 (KpLE1) prophage; conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (51/27); total (53/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
GGCGCACTGGAAGTATCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTA > NC_000913/2471120‑2471384 | ggCGCACTGGAAGTATCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTg > 1:1121322/1‑140 (MQ=255)ggCGCACTGGAAGTATCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTg > 2:1085033/1‑140 (MQ=255)ggCGCACTGGAAGTATCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTg > 1:1124520/1‑140 (MQ=255) aCTGGAAGTATCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTaa > 2:196173/1‑140 (MQ=255) tCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTATTCAATtgctg > 2:1559736/1‑140 (MQ=255) tCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATtgctg > 2:920270/1‑140 (MQ=255) tCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATtgctg > 2:1046909/1‑140 (MQ=255) tCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTATACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAAACAAGtgctg > 2:636972/1‑140 (MQ=255) tCGACCAGATCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACATTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGGTCATATATTCGCTGGCCTGATTAATCAATtgctg > 2:754710/1‑140 (MQ=39) gACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTgctgct > 2:1325389/1‑140 (MQ=255) gACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTgctgct > 1:98478/1‑140 (MQ=255) gACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTgctgct > 1:98377/1‑140 (MQ=255) ccAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCttt < 2:1745178/140‑1 (MQ=255) ccAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCttt > 1:1391640/1‑140 (MQ=255) cTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCa > 2:1176794/1‑140 (MQ=255) cTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCAATGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCa > 2:326452/1‑140 (MQ=255) tCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTTGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTgc > 2:1531676/1‑140 (MQ=255) tCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTgc > 1:1039983/1‑140 (MQ=255) tCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCAGTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTgc > 1:1029187/1‑140 (MQ=255) tCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATAGCGCCAGTTCCTCACATTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACAGTTCATAAAATCGCTGGCCTGATAAATCAAATGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTgc > 2:767107/1‑140 (MQ=255) ccAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTgca < 1:547198/140‑1 (MQ=255) aaTCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATc < 1:589637/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTg < 2:972188/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTg < 2:1150327/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTg < 1:971330/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTg < 1:970893/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTg < 1:1395720/140‑1 (MQ=255) gCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTcc > 2:643506/1‑140 (MQ=255) ccACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt > 1:1540514/1‑140 (MQ=255) ccACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt < 1:625202/140‑1 (MQ=255) ccACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt > 2:1709627/1‑140 (MQ=255) ccACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt < 2:488364/140‑1 (MQ=255) ccACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt < 1:186141/140‑1 (MQ=255) ccACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt > 1:1692495/1‑140 (MQ=255) ccACAAATTATAGTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCt < 1:1670467/140‑1 (MQ=255) cacaAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTc > 1:795274/1‑140 (MQ=255) cacaAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTc > 2:1088244/1‑140 (MQ=255) ttATATTGCGCCTGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATTATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATgtgt < 2:1222514/140‑1 (MQ=255) ttATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATgtgt < 2:1222569/140‑1 (MQ=255) ttATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATgtgt < 2:1222564/140‑1 (MQ=255) atTGCGCCAGTTCCTCACCATTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTAAAGGTCATATAAACGATGGCCTGATTAAACAATAGCAGCTTTTACAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggt > 2:1229507/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtgg > 2:351445/1‑140 (MQ=255) cgcCAGTTCCTCCCCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtg < 1:883945/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtg < 1:1379513/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtg < 1:1381637/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCAGTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtg > 2:599347/1‑140 (MQ=255) cgcAAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTAATGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATAGCTGGTTTATCAGTTCTGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtg > 2:657994/1‑140 (MQ=255) ccAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGa > 2:1189277/1‑140 (MQ=255) ccTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCa < 1:858954/140‑1 (MQ=255) cACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGAc > 1:1226281/1‑140 (MQ=255) ttCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGc > 2:1547549/1‑140 (MQ=255) ttCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGc > 2:1547647/1‑140 (MQ=255) gacCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGaaaa < 1:337799/140‑1 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAAc > 1:205949/1‑140 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAAc > 1:119204/1‑140 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAAc > 1:119129/1‑140 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAAc > 1:1412763/1‑140 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAAc > 1:1744954/1‑140 (MQ=255) aTAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCAtt < 1:1500237/140‑1 (MQ=255) aTAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCAtt < 1:297462/140‑1 (MQ=255) cTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCa > 1:1124385/1‑140 (MQ=255) cTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTATCCa > 2:914955/1‑140 (MQ=255) cTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAAACAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTAAGACCATGCAGGAAAACCATTTTATCCa > 1:1124105/1‑140 (MQ=255) ttACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGc > 1:554672/1‑140 (MQ=255) cAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATa < 1:1481070/140‑1 (MQ=255) cAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATa < 1:1666988/140‑1 (MQ=255) cccATTGTTTACTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACgg > 1:694447/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCtt > 1:192461/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTACTCATGTGTTGGTGTTGGAATTTCAGACCATGCAGGAACACCATTTTCTCCAGCGATACGGAATTATCCtt > 2:477828/1‑140 (MQ=255) tGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTc > 2:1729546/1‑140 (MQ=255) tGTTCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTc > 2:721841/1‑140 (MQ=255) ttCATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcgg > 1:1517136/1‑140 (MQ=255) cATATAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggcg > 1:1223732/1‑140 (MQ=255) atatACTCGCTGGCCTGGTTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTGCTCTTGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGTAAACCATTTTCTCCAGCGAGACGGATTTTTCCTATcggcgg > 2:1492491/1‑140 (MQ=255) atatAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggcgg > 2:1706488/1‑140 (MQ=255) ataaAATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTATCAGTACGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGATGGAGGTGGAATATCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTACAGCGAAACTGATTTTTCCTTAaggcgg > 2:49336/1‑140 (MQ=255) ataATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTa < 2:555689/140‑1 (MQ=255) ataATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTa < 2:648576/140‑1 (MQ=255) ataATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTa > 2:660660/1‑140 (MQ=255) ataATCGCTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTa < 2:1213844/140‑1 (MQ=255) | GGCGCACTGGAAGTATCGACCAGCTCCAGTGCGTCCAGATAATCCAGCCACAAATTATATTGCGCCAGTTCCTCACCTTTCAGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTA > NC_000913/2471120‑2471384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |