| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2904164 | 287 (1.760) | 5 (0.040) | 5/216 | NT | 2.3% | intergenic (+790/+583) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| ? | NC_000913 | 2904287 = | 197 (1.560) | intergenic (+913/+460) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2903986‑2904164‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcggtttatccccgctggcgcggggaacacgAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA > NC_000913/2904287‑2904433 TTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTC > 1:1326989/1‑150TTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTC > 1:448576/1‑150 TGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCGATTCG > 2:2671822/1‑150 TGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGGAGGCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGGTTTCGCACAGCTCTGGACTATGGCTCTTCG > 2:1762239/1‑150 AAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTTTGTACGGAAAGCTATGGACAAGTGCTAGGCGGTTT > 2:186672/1‑150 AAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCACATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTT > 2:2010325/1‑150 AAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTT > 1:2230370/1‑150 AAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTT > 1:2230303/1‑150 AAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTT > 2:579503/1‑150 AGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTAT > 1:1177240/1‑150 AGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCGATTCGGTTTAT > 1:1495254/1‑150 AGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTAACCCCGCTGGCGCGGGGAACCCCTGTTTTCGCAAATCTCTGGACTATTGCTATTCGGTTTAT > 1:2514766/1‑150 AGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCC > 2:304860/1‑150 AGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGATCAGGTATATCCACGCTGGCGCGGGGAACACGTGTATACGAAAATCTATGGACTATTTCTGTTCGTTTTATCC > 2:2135583/1‑150 ACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCT > 2:1372426/1‑150 CGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTG > 1:2108352/1‑150 CGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTG > 1:2108438/1‑150 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GGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAAGACGCTAACACAGGTTTATCCCCGCTGTCGCGGG > 2:741328/1‑150 CCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGG < 1:2511829/74‑1 CCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGG > 2:2511829/1‑74 GTTGTCGAAAATCTCTGGACTAGTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTT < 1:774782/150‑1 GGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGC < 1:223661/150‑1 ctcTTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGATATGCTGGTGAGCGTTTTTGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGG < 2:442906/147‑1 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CACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTA > 2:292883/1‑150 CACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTAGTCTTAATTA > 1:1340534/1‑150 ACGAACTGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCACACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 2:1555911/150‑1 ACGAAATTCTGGTTAGAGTTTATGGCTAAAAATGAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 2:2486088/150‑1 ACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 2:2624804/150‑1 ACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 1:2063817/150‑1 ACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 1:2063646/150‑1 ACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 1:2012370/150‑1 ACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 2:2624801/150‑1 ACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 2:2112447/150‑1 ACGAAATGCGGGTGAGCGTTTATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGTTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA < 2:2486094/150‑1 TTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2903986‑2904164‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcggtttatccccgctggcgcggggaacacgAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAA > NC_000913/2904287‑2904433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |