| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,817,774 | 0 | A | T | 6.2% | 548.4 / 7.2 | 166 | intergenic (‑271/+10) | yqaB/argQ | fructose‑1‑P and 6‑phosphogluconate phosphatase/tRNA‑Arg |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/83); new base T (8/4); total (79/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TTTGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAG > NC_000913/2817626‑2817920 | tttgttggAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAGTGACGTTCGCCCTTCGGGGCGTTGGTGGGGGAACGTTATCGTTGGTGGTGGCTGGGGTTTATAGCGGTATGTGTTGGATTCCTTGTTTGGTGTTGGTTag > 2:1017999/7‑149 (MQ=255) ttGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACg < 2:509880/150‑1 (MQ=255) aGGAAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGgaga < 1:1413503/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |