| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4093097 | 210 (0.860) | 6 (0.030) | 4/266 | NT | 2.9% | intergenic (‑274/+27) | frvA/rhaM | putative enzyme IIA component of PTS/L‑rhamnose mutarotase |
| ? | NC_000913 | = 4093109 | 208 (0.890) | intergenic (‑286/+15) | frvA/rhaM | putative enzyme IIA component of PTS/L‑rhamnose mutarotase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4092943‑4093097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtgccAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAAT < NC_000913/4093109‑4092962 AGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATT < 1:41753/150‑1AGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATT > 1:1161277/1‑150 TAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGT < 2:726431/150‑1 ATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGC < 1:1758418/150‑1 ATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGC < 1:1758467/150‑1 CACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTTATTTACTCACAATGTATAAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAATATATTGTGCagg > 2:2127884/1‑147 AATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAA < 2:3402697/150‑1 TAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATAATGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATA < 2:3215138/150‑1 TAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATAATGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATA < 2:3215049/150‑1 TAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATAATGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATA < 1:3021263/150‑1 GGTTATTCTTTATTTTTGTTATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATTTTTAATTTTTAAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCAGAGATGCCCCCGGCAAAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAA < 1:2273213/150‑1 aCAGGGCAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTACATTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCC < 2:3085602/149‑1 TGTGCCAGAGTTGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACTTATTACATCTCCCGGTAAGTTATTTTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACATTAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTT < 1:2094585/150‑1 TGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTT < 1:3315339/150‑1 TGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTT < 2:1589363/150‑1 TGTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTT < 1:1696124/150‑1 GTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACCTTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTA < 2:328802/150‑1 GTGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTA < 2:3185110/150‑1 gGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAA < 1:3167024/149‑1 TGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAA < 1:3638812/150‑1 TGCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAA < 1:534819/150‑1 GCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAA < 1:3015770/150‑1 GCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAA < 1:2811340/150‑1 GCCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAA < 2:3224305/150‑1 CCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTCATGATTCAGGTGGTTTATTTAAAT > 1:2641612/1‑150 CCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAAT > 1:2597799/1‑150 CCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAAT > 1:125097/1‑150 CCAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAAT > 1:124679/1‑150 AGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4092943‑4093097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtgccAGAGATGCCTCCGGCACAATATTTTAAATTTCGATTTGAAAAATTAAACATATTACATCTCCCGGTAAGTTATATTTCCCTGATACATTGTGAGTAAATCACAAAAATAATGAATAACCCATTAATGATTCATGTGGTTTATTTAAAT < NC_000913/4093109‑4092962 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |