Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,291,513 | T→C | 6.4% | M1A (GTG→GCG) † | nrfE → | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,291,513 | 0 | T | C | 6.4% | 215.6 / 4.0 | 77 | M1A (GTG→GCG) † | nrfE | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/32); new base C (2/3); total (42/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.81e-01 |
CCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTC > NC_000913/4291365‑4291660 | ccAGTCTGGTCGGCGTGTTGAGGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACgt < 1:790929/149‑1 (MQ=255) tCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTACATTCTCTACGCCGTACAGTTGACGGGGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTg < 2:107327/149‑1 (MQ=255) ggTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGGGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGAcc < 1:62218/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGGGTAAGCCAGAAATGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTGGGGGGCAACACGTTGAccc < 2:1169583/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACACGTTGAccc < 1:150607/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGAcccc > 2:498767/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCGGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCg < 1:1064259/149‑1 (MQ=255) gCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGtt > 2:840760/1‑149 (MQ=255) gCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGtt < 1:514607/149‑1 (MQ=255) tgtTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGAc < 1:1105591/149‑1 (MQ=255) gtTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACg > 2:305467/1‑149 (MQ=255) ttGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACgg > 2:448264/1‑149 (MQ=255) ttGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACgg > 1:382477/1‑149 (MQ=255) tGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTGCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGc < 2:1031019/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCtt > 2:279414/1‑149 (MQ=255) ctgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTcg > 1:139914/1‑149 (MQ=255) ctgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTcg > 1:422125/1‑149 (MQ=255) tgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGAGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCCTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGCCCCCGTTGACGGCCTTcgc > 1:64779/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTcgcg > 2:621401/1‑149 (MQ=255) cgcTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCgg < 1:970713/149‑1 (MQ=255) cgcTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCgg < 1:958653/149‑1 (MQ=255) ctgtttctttcTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCGAGAAACGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGACGTCGGTTTGCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGa < 1:777553/146‑1 (MQ=255) ccgatataTTCTCTACGCCGGCCAGTTGTCGGTGGCGTAAGCCAGTAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGa < 2:931888/142‑1 (MQ=255) tttttCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTTTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAg > 1:990900/1‑149 (MQ=255) tttttCATTCGCTACGCCGTACAGTTGACGGGGGCGTAAGCCAGAAAAGTGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAg < 1:526375/149‑1 (MQ=255) tttttAATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGCACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGTTCAAAGTCTTGACCCCGTTCACGGCCTTCGCGGGAg > 1:876015/1‑149 (MQ=255) ttttCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGt > 1:1107930/1‑149 (MQ=255) tttCAATCTCTTCGCCGGACAGTTGACGGGGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGCCGTCGGTGTGCTGGCGTTGTTGTGACGTCGCGGGGGCAACGCGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTg < 1:38956/149‑1 (MQ=255) aTTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGTGAGTGCGGt > 2:640825/1‑149 (MQ=255) ttCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAgagatcgg > 1:931888/1‑142 (MQ=255) ttCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGtt < 2:986599/149‑1 (MQ=255) cGCCGGACAGTTGACGGTGTCGGAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGGTGTTGTTAAGTCTCGGGGGCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTgg < 1:915703/149‑1 (MQ=255) cGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGcat > 1:612095/1‑147 (MQ=255) cGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCt > 1:702150/1‑149 (MQ=255) gACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCATTCCTGAAGTCAGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCTGGGTCAACTTGTTGACACCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGATGGCCTGc > 2:649266/1‑149 (MQ=255) cAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTGTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGGTGTTGTTAAGTCTCGCGGTCAACGTGTTGACCCGGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCa < 2:483658/149‑1 (MQ=255) aGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCat < 2:422125/149‑1 (MQ=255) gACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCatgatg > 1:280111/1‑149 (MQ=255) gACGGTGGCGGAAGCCAGCAAAGAGGTGGTTTCGGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCatgatg < 1:900195/149‑1 (MQ=255) aCGGTGGCGTAAGCCAGAAACGAGGGGGGTTCTGGACGTATTCCTTCCGGAAGTCGGGTTTCTGGCGTTGTTGTTACGTCTCGGGGGCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGc < 1:642946/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGa > 1:924144/1‑149 (MQ=255) gTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGTTGGTTTCTGGACGAATTCATTCCTGTAGTCGGTGTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGGCAACGTGTGGACCCCGTTGACGGACTGCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGAc < 1:1082287/149‑1 (MQ=255) gTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACt > 1:1138322/1‑149 (MQ=255) ccAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCAt > 1:323360/1‑149 (MQ=255) ggtTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGGCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTGTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGgcg < 2:439340/149‑1 (MQ=255) ttCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCCTTCTGGCGCAg > 1:755847/1‑149 (MQ=255) tGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTGAGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCACTGATGCGAAGAACTTGAAGAGTGATTCTGGCGCAGTTc > 2:864356/1‑149 (MQ=255) ttccttccTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAAAGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCTGCATTCTTGCTCAGTTCGCGCTCct > 1:401854/1‑149 (MQ=255) ccttcctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTACGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCctgc < 1:879262/149‑1 (MQ=255) cctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGACATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTgctgct > 1:555947/1‑149 (MQ=255) ctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCCTTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTc > 2:1054337/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCttt > 1:1031217/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTGTAGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGAACCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCTCTTGCATCGGCTTTCTGGCGGAGTTCGCGCTCCTTCTGCTAGCCTTAGGCGTACTg > 1:1112254/1‑149 (MQ=255) gCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTGGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGGGCGGGTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGAc < 1:135549/149‑1 (MQ=255) gttgttgttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGCCCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGt > 1:942429/1‑149 (MQ=255) gttgttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTAtt < 2:702150/149‑1 (MQ=255) gttgttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTAtt > 1:31408/1‑149 (MQ=255) gttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCTTTCTTGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGtt < 1:84952/149‑1 (MQ=255) ttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCAGTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTGTGGCGTACTGACGTATTGttt > 2:495425/1‑149 (MQ=255) tAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGGGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGtttt < 1:640825/149‑1 (MQ=255) aGTCTCGGGGTCCACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGAGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATAGGAAATCTGTCGCAGTTCGCGCTCCGGCTGCTCGCCTGTGGCGAACTTACGTATAGTTTtct > 1:727989/1‑149 (MQ=255) aGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTtct < 2:1107930/149‑1 (MQ=255) gTCTCGGGGTAAACGTGTTGACCCCGGTGTCGGCCTACGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTtctc < 1:670601/149‑1 (MQ=255) tctcGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCtca > 2:253995/1‑149 (MQ=255) tctcGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCtca > 2:352282/1‑149 (MQ=255) caacGGGGTCAACACGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCtca > 2:318153/4‑149 (MQ=255) acGGGGTCAACACGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTCGCGTACTGACGTATTGTTTTCtcatc > 1:59981/2‑149 (MQ=255) gggTCAACGTGTTGACCGCGTTGACGGCCTTCGAGGGAGGGCGGTTGCGCTGGCCTGACATGATGCGACTCTCTTGCATCGTCATTATGGCGCATTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTATGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGc < 2:255650/149‑1 (MQ=255) gggTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGc < 1:649266/149‑1 (MQ=255) ggTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCg < 2:382477/149‑1 (MQ=255) gTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTtct < 1:1158237/140‑1 (MQ=255) gTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTtct > 2:1158237/1‑140 (MQ=255) gTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGa > 2:200040/1‑149 (MQ=255) tCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCTGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGAt < 2:611296/149‑1 (MQ=255) aaCGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCGCTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGCttt > 1:949976/1‑149 (MQ=255) aaCGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGAttt > 1:850657/1‑149 (MQ=255) aaCGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACGGACGTATTGTTTTCTCATCCGCGAgtt > 1:1174891/1‑149 (MQ=255) aCGTGTGGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTtc < 1:279414/149‑1 (MQ=255) gtgtTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGAGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTtctc > 1:732622/1‑149 (MQ=255) | CCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTC > NC_000913/4291365‑4291660 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |