| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 478,757 | 0 | T | C | 5.4% | 283.1 / 5.1 | 93 | intergenic (‑140/+24) | ylaB/ylaC | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase/DUF1449 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/36); new base C (3/2); total (55/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.46e-01 | |||||||||||
ACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAGATGG > NC_000913/478616‑478905 | aCCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCt > 1:731666/1‑149 (MQ=255)aCCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAAAGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCt > 1:666683/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTATCCTTATTAACACAGTGTATGGAAAGTATATCTGATTGTGGATAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTGATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTg < 2:592261/149‑1 (MQ=255) ccAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTg < 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atCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTa < 1:616375/149‑1 (MQ=255) atCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTa < 2:465727/149‑1 (MQ=255) ccTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGAGTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGATACGATCTTTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAc > 2:768307/1‑149 (MQ=255) ttattaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAccc < 1:216342/149‑1 (MQ=255) ttattaACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGATGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTTGAAACGATAATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAAccc > 1:659242/1‑149 (MQ=255) 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aCCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACAcgcg > 2:429906/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGCCGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCgg > 2:1019716/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGTAAAGCTCTGCGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCgg > 1:127504/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga < 1:254031/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga > 1:976475/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGga > 2:106499/1‑149 (MQ=255) gcgcAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGagag < 2:466987/149‑1 (MQ=255) cAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTc < 2:731666/149‑1 (MQ=255) agagCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCa < 1:736601/149‑1 (MQ=255) tttACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAGATg < 1:1107656/149‑1 (MQ=255) ttACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGATCACCTTTACGGACGATCATTTTTAGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACCCGCGGAGAGTTCAAGATgg > 1:1099877/1‑149 (MQ=255) | ACCAGCATATCCTTATTAACACAGTGTAGGGAAAGTATATCTGATTGTGGAAAAAGGCTGGCTGGAGATAAGGAGGTAGAGCTGGTATTTCATGAAGTGATGGGTGGAAACGATCATTGTCATTTGACCAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAGATGG > NC_000913/478616‑478905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |