| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2982463 | 97 (1.070) | 8 (0.090) | 7/280 | 9.8 | 8.1% | intergenic (‑281/+34) | araE/kduD | arabinose transporter/2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate 5‑dehydrogenase; KDG oxidoreductase; 20‑ketosteroid reductase |
| ? | NC_000913 | = 2982467 | 91 (1.060) | intergenic (‑285/+30) | araE/kduD | arabinose transporter/2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate 5‑dehydrogenase; KDG oxidoreductase; 20‑ketosteroid reductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2982309‑2982463‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accctgccGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATGAACTTTATGAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGGTGGTTAATAATAATCTCAATAATTCAACTTAA < NC_000913/2982467‑2982320 CAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTTATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAAC < 2:451836/149‑1CAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAAC < 1:564612/149‑1CAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAAC < 1:787508/149‑1 AATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACC > 2:53403/1‑149 AATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACC > 2:538128/1‑149 TTTCAAATTAAGTTGAATTATTGATATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATATAGTTCATTAATTGATTATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTG < 1:102685/149‑1 TTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTATAGGTATAAAAAACCCTG > 1:229670/1‑149 TTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATATTTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGC > 2:372246/1‑149 tAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTTATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCAGGGT < 2:759301/148‑1 TTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACATCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCAGGGTTTT < 2:1234769/149‑1 TATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACATCAGATAATATTCATAAAGTTCTTTAATTGATAATTAATTTGGATTTTTTCATAACCATTATAAGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCATTGTTTTT < 1:165963/149‑1 TATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCAGGGTTTTT < 2:434000/149‑1 tAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATTGCAGGGTTTTTTATA < 2:482593/148‑1 ACCACCTAAATTTACACCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAAATGATAAATAATATGGATAATTTCATAACCATGATATGGATTATGAAGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATC < 1:628169/149‑1 AAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGA < 1:990096/149‑1 AATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAA < 2:1392935/149‑1 ACCCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATGAACTTTATGAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGGTGGTTAATAATAATCTCAATAATTC < 2:302300/149‑1 CCCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATGAACTTTATGAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGGTGGTTAATAATAATCTCAATAATTCA < 1:640353/149‑1 cattCCGCATGGCAGGGTTTTTTAAACCTGTAGAACATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATTAACATTATGAATATTATCTGCTCTAAAATTAGCTGGTTAATAATAATCTCAATAATACAA > 2:791802/5‑149 CCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCTATTTATGAACTTTATTAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGGTGGTTAATAATAATCTCAATAATTCAA > 2:1263395/1‑149 CCTGCCGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATGAACTTTATGAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGTGGTTTAATAAAAATATCAATAATACAA > 2:1011482/1‑149 CGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATGAACTTTATGAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGGTGGTTAATAATAATCTCAATAATTCAACTTAA < 2:1316814/149‑1 CAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2982309‑2982463‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accctgccGCATGGCAGGGTTTTTTATACCTGTAGATCATCATAATCCATATCATGGTTATGAAATAATCCATATTAATTATCAATTAATGAACTTTATGAATTTTATCTGCTGTAAAATTAGGTGGTTAATAATAATCTCAATAATTCAACTTAA < NC_000913/2982467‑2982320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |