| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1567465 | 104 (1.140) | 7 (0.090) | 6/268 | 10.0 | 6.6% | intergenic (‑325/+39) | dosC/yddW | diguanylate cyclase, cold‑ and stationary phase‑induced oxygen‑dependent biofilm regulator/liprotein, glycosyl hydrolase homolog |
| ? | NC_000913 | = 1567472 | 105 (1.280) | intergenic (‑332/+32) | dosC/yddW | diguanylate cyclase, cold‑ and stationary phase‑induced oxygen‑dependent biofilm regulator/liprotein, glycosyl hydrolase homolog | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATAGCCCATCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1567304‑1567465‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtaacaagccggtgCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCGCTGTCAC < NC_000913/1567472‑1567328 tTAGCACATCTTAATTATTTTTCGGTGAAAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATAATCATACATTTTTATTAGTGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGG < 1:1229433/148‑1ATAGCCCATCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGG < 1:467976/149‑1 CCCATCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAATTGTGGTTAATTTGACTTAATTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGTTAAa > 1:258578/1‑148 CCATCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTAATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTTACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACA > 1:701574/1‑149 cagCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAA < 2:104076/146‑1 ATCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAG > 2:1414275/1‑149 TCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGC < 2:472869/149‑1 AATTATTTTTCTGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGT < 1:178751/149‑1 AATTATTTTTCTGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGT < 1:349036/149‑1 AATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGT < 1:1323841/149‑1 AATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGATAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGT < 1:1313764/149‑1 AATTATTTTTCGGTGACACCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTAATAGGGATTTATGGCTGTTTAACTACGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGT < 2:365694/149‑1 TTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGGTTAACTAAGTGGGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTAC < 1:545844/149‑1 TTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTGTGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACC < 1:200640/149‑1 tACAGCTAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGG < 2:435459/148‑1 ACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGC < 1:318736/149‑1 ACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGC < 2:267328/149‑1 GGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGTATAGATTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAA < 1:1416754/149‑1 TTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCAT > 2:456430/1‑149 TAACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATT > 1:1382429/1‑149 ACAAGCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACGAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCG > 2:389374/1‑149 GCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCGCTGT > 2:1157798/1‑149 GCCGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCGCTGT < 2:62265/149‑1 CGGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCGCTGTCA < 2:223194/149‑1 GGTGCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCGCTGTCAC < 2:672496/149‑1 ATAGCCCATCGTAATTATTTTTCGGTGACAGCGAATATCGTATGGTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTGACTTAAGTAAGCATGATTATTAGTGGGATAGTTTAAGAGGGTAACAAGCCGGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1567304‑1567465‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtaacaagccggtgCTTTACCCACCGGCTTGTTACCCTCTTAAACTATCCCACTAATAATCATGCTTACTTAAGTCAAATTAACCACACTTAGTTAAACAGCCATAAATCCCTAATAAAAATGTATGAATATGAAAAACCATACGATATTCGCTGTCAC < NC_000913/1567472‑1567328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |