Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 639,562 | 0 | T | G | 5.4% | 967.0 / 11.2 | 301 | intergenic (+54/‑191) | ahpC/ahpF | alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit/alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (100/177); new base G (21/2); total (122/179) | |||||||||||
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Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
TACGTAGCTTCTCACCCAGGTGAAGTTTGCCCGGCTAAATGGAAAGAAGGTGAAGCAACTCTGGCTCCGTCTCTGGACCTGGTTGGTAAAATCTAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAG > NC_000913/639413‑639711 | tACGTAGCTTCTCACGCAGGTGAAGTTTGCCAGGCTAAATGGAAAGAAGGTGAAGCAACTCTGGCTCCGTCTCTGGACCTGGTTGGTAAAATCTAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGt < 1:4983650/150‑1 (MQ=255) tACGTAGCTTCTCACCCAGGTGAAGTTTGCCCGGCTAAATGGAAAGAAGGTGAAGCAACTCTGGCTCCGTCTCTGGACCTGGTTGGTAAAATCTAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGt < 1:4009806/150‑1 (MQ=255) tAGCTTCTCACCCAGGTGAAGTTTGCCCGGCTAAATGGAAAGAAGGTGAAGCAACTCTGGCTCCGTCTCTGGACCTGGTTGGTAAAATCTAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCact > 1:2441524/1‑150 (MQ=255) 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gcgTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCatga < 2:1731891/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCatgat < 2:4904244/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTTGCCGCCTTGCTCTGAGGGGAAATACTTCGGAAATTCACCTATTTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCGCCGCACCatgatg < 1:3046457/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGc < 1:2718430/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGc > 1:1576838/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCaa < 1:31818/150‑1 (MQ=255) gCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTGACGTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCGTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGACATTCACCTAAGTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGAGGCAAg < 2:246525/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCt < 1:1225472/150‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATcc < 1:2399811/150‑1 (MQ=255) cTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAg > 1:2923523/1‑150 (MQ=255) aCCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGACATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCAGGATGCAAGCTGCATCCAGGtc > 2:180142/1‑149 (MQ=255) aCCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCACGCTGCTTCCAGGTa > 1:611244/1‑150 (MQ=255) aCCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTa > 1:3738187/1‑150 (MQ=255) aCCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTa > 2:701067/1‑150 (MQ=255) ccccGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAg > 2:2696202/1‑150 (MQ=255) cccGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGc < 2:3368769/150‑1 (MQ=255) ccGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGcc < 2:1291403/150‑1 (MQ=255) | TACGTAGCTTCTCACCCAGGTGAAGTTTGCCCGGCTAAATGGAAAGAAGGTGAAGCAACTCTGGCTCCGTCTCTGGACCTGGTTGGTAAAATCTAAATTTCCTTCGTCTTTCACGCCATAGCGGCGTTGGCGTCGCCCGCTCACCCCGGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCCGGGGATTCACAGGCTAGCCGCCTTGCTCTGACGCGAAATACTTCGGAAATTCACCTAATTCTTCGGGTGCTGCGGCACCCGATTTTCTTCCCCGCACCATGATGCAAGCTGCATCCAGGTAGCCGCAG > NC_000913/639413‑639711 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |