| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,304,798 | 0 | T | A | 7.0% | 508.2 / 6.2 | 215 | intergenic (+405/+310) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (92/94); new base A (15/3); total (115/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTT > NC_000913/2304650‑2304947 | tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGa < 2:3548628/150‑1 (MQ=37) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGc < 1:384141/150‑1 (MQ=12) ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGcc > 1:1065326/1‑150 (MQ=37) 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cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGAGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCgg > 2:4281427/1‑150 (MQ=21) gTTACGCCGCATCCGACATCCAACGACCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTAGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGtt > 1:2091250/1‑150 (MQ=17) ttACGCCGCATCCGACATCATACGACCGAGCCTGTTGCCTGATGCGACGCTGGAGGGTCTTATGAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTGCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTg < 2:1685791/150‑1 (MQ=11) aCGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:3025181/66‑1 (MQ=35) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc > 1:1936481/1‑51 (MQ=35) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCGTATCAGGCCGACCCCGCTGTGGAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCGGCTAAGGCGGGGACGCCGCCGCCGCCCGCGCACGCCCCCGCCGGTGGccggg > 1:1450069/1‑147 (MQ=11) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGGCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGTAGTGCTCCACCCCGGAGGGCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAGCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCTgt > 1:4388766/1‑149 (MQ=11) cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGAt > 2:417290/1‑150 (MQ=32) agcATGCGACATACACGGTGCGAGCCGGTTGCGTGATGCGAATCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGAt < 2:2630014/149‑1 (MQ=11) tCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTTTCAGGCCTACACCGCGGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGa > 1:613396/1‑150 (MQ=12) tCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGCGACGGCGGTTACGCCGCAGCCGACCGCTAACGCCCCCGCCGGTTGCCTGAGGCGa > 2:3722778/1‑150 (MQ=11) tCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCGGATGCGACGCAGGCGCGGCGTATCAGGCCGACACCGCTGGGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTACGCCGCCTCCGACAGCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCTGATGCgc > 1:1215984/1‑149 (MQ=11) cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACg > 2:3873054/1‑150 (MQ=17) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 1:2918100/1‑150 (MQ=32) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 1:2918051/1‑150 (MQ=32) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCCCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTTGGTCGGATAAGGCCGTTACGCCGAAACCGACATCTAACGCCCACGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 1:3255264/1‑150 (MQ=11) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGATACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGATGCCTGATGCGACGCTGgcgc > 2:1984633/1‑150 (MQ=12) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc > 1:2766522/1‑150 (MQ=32) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc > 2:786733/1‑150 (MQ=32) tCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACTCCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCtt < 2:4947901/150‑1 (MQ=11) | GGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTT > NC_000913/2304650‑2304947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |