| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 3,440,071 | Δ20 bp | coding (940‑959/990 nt) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3440071 | 3440090 | 20 | 98 [0] | [0] 98 | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3440070 | 0 (0.000) | 97 (1.260) | 53/488 | 0.2 | 100% | coding (960/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| ? | NC_000913 | 3440091 = | 0 (0.000) | coding (939/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit | |||||
CGGGCGAATGCCAGACGACGATTAGCAACGCTATCAGTCTTGGCAAGAGTAATCAGCGGCTCAACTACGCGGCGCAGCTCTTTCGCTTTAGGCAGAGTCGTCTTGATGATTTCATGACGAACCAGTGAACCTGCCATATTGCGGAACATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTT > NC_000913/3439794‑3440367 | cgatctcggtatcacgagtacgggcgaatgccagacgacgattagcaacgctatcagtcttggcaagagtaatcagcggctcaactacgcggcgcagctctttcgctttaggcagagtcgtcttgatgatttcatgacgaaccagtgaacctgccatattgcggaacatagcctggcgatggctgctgttgcggttcagttgacgaccactcttacgatggcgcatgaccttatccttctcagtaaaaccttaacctgtgatccggttactcgtcagcgatgcttgccggtggccagAGAc < 1:397273‑M2/4‑1 (MQ=255) atcacgagtacgtgcgaatgccagacgacgattagcaacgctatcagtcttggcaagagtaatcagcggctcaactacgcggcgcagctctttcgctttaggcagagtcgtcttgatgatttcatgacgaaccagtgaacctgccatattgcggaacatagcctggcgatggctgctgttgcggttcagttgacgaccactcttacgatggcgcatgaccttatccttctcagtaaaaccttaacctgtgatccggttactcgtcagcgatgcttgccggtggccagAGACAGTCCACggg < 1:274203‑M2/14‑1 (MQ=255) cgggcgaatgccagacgacgattagcgacgctatcagtctgtgcaagagtaatcagcggctcaactacgcggcgcagctctttcgctttaggcagagtcgtcttgatgatttcatgacgaaccagtgaacctgccatattgcggaacatagcctggcgatggctgctgttgcggttcagttgacgaccactcttacgatggcgcatgaccttatccttctcagtaaaaccttaacctgtgatccggttactcgtcagcgatgcttgccggtggccagAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCAc < 1:603421‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgccagacgacgattagcaacgctatcagtcttggcacgagtaatcagcggctcaactacgcggcgcagctctttcgctttaggcagagtcgtcttgatgatttcatgacgaaccagtgaacctgccatattgcggaacatagcctggcgatggctgctgttgcggttcagttgacgaccactcttacgatggcgcatgaccttatccttctcagtaaaaccttaacctgtgatccggttactcgtcagcgatgcttgccggtggccagAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTa > 1:95834‑M2/271‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |