| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,160,733 | C→T | G20S (GGC→AGC) | sthA ← | pyridine nucleotide transhydrogenase, soluble |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,160,733 | 0 | C | T | 99.4% | 550.9 / NA | 156 | G20S (GGC→AGC) | sthA | pyridine nucleotide transhydrogenase, soluble |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (68/87); total (69/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GAGCGTTTCCCTGCAATATTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCCAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATAACGCTCGATAACTGCGACGCGCGCACCTTGCTTAACCAGGCCCATTGCAGCGCCTTCGCCGCCGGGGCCGGAACCTATTACTATGGCATCGTAATCGTAGGAATGTGGCATGGTAGGGCTTACCTGTTCTTATACATAAAAGCAACAGAATGGTAACATTTTATCGCGGGTAAGCCAATTGATCCCCGTCATTTATCTGGCTATATCCTGAGCGGCCTTTGCTTTGTCTGTTTCTTACTTTTGCCCTGACGTTTTATTGGATTTTTATCGACGATACTCTCCGTTTAAGCGGCAGGTTTCCGCTGTACGTAAAAGAACCGGCCAAAGAATTGCAGTAAATATGTTTTATTG > NC_000913/4160439‑4161030 | cTGCAATATTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCAAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATAACGCTCGATAACTGCGACGCGCGCCCCTTGCTTAACCAAGCCCATTGCAGCGCTTTCGCCGCCGGGGCCg > 2:1669/1‑301 (MQ=255) atatTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCCAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATACCGCTCGATAAATCCGACGCGCGCACCTTGATTAACCAGGCCCATTGCAGCGCTTTCGCCTCCGGGGCCgtacc > 2:23152/1‑296 (MQ=255) atatTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCCAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATAACGCTCGATAACTGCGACGCGCGCACCTTGCTTAACCAGGCCCATTGCAGCGCTTTCGCCGCCGGGGCCGGAAc > 2:779300/1‑300 (MQ=255) atTTCACAGTGATTACGTTCGTAAAATCCCTGACGCATGCGCGTTTGTTGATTAATCACGTTATCGGCATGGTTAAGGATATCGGCAAAAGAAGAGCGGAGCAGTCGGGAATGGTCGCTGTAAAGTGGGTTTTGATTGAATTCTATAATGCGGCTGACGGCGTGACGGAGAGCTTTCGACGGGATGGTGCCCCAGTGGGTGCAACCGCCGCCAACATTTTGATAACGCTCGATAACTGCGACGCGCGCACCTTGCTTAACCAGGCCCATTGCAGCGCTTTCGCCGCCGGGGCCGGAACCTa > 2:721185/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |