| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 515946 | NA (NA) | 4 (0.030) | 3/240 | NT | NA | noncoding (1241/2921 nt) | rrl1 | 23S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | = 515981 | NA (NA) | noncoding (1276/2921 nt) | rrl1 | 23S ribosomal RNA | |||||
TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/515800‑515946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctaagCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATT < CP000730/515981‑515842 TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACCATGGTAGGAGAGCGT > 2:436983/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 2:1524599/141‑1TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 2:1553714/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 1:373461/141‑1TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 2:879217/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 1:121260/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 2:9253/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATACCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAACGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACCATGGAAGGAGAGCGT > 2:152903/1‑141 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |