Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 2,448,498 | 0 | C | T | 7.5% | 492.9 / 21.2 | 160 | intergenic (‑257/+20) | hipO/hutI | M20D subfamily peptidase/imidazolonepropionase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/71); new base T (8/4); total (85/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.81e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
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2:800548/141‑1 (MQ=255) gCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTGCATCCCAAATTAc < 1:42720/141‑1 (MQ=255) cTTAGAGCTTTCTAATTATCTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGAcc < 1:1195850/57‑1 (MQ=255) | AGACAGTTGTTTAATAATATCGTAACACTGTTGTCAAACTATTCTAACTTTTATAATTGAGACTCTATACAAAAACGTGTTCTCGAATATACTTGTTTTTACAAACCACAAAAAGCTCTAAACATTAGTTTAAACCAATGCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTGCATCCCAAATTAC > CP000730/2448358‑2448637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |