Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 2,744,213 | 0 | T | A | 6.5% | 542.4 / 20.5 | 165 | intergenic (+150/+43) | fdaB/mqo2 | fructose‑bisphosphate aldolase/malate dehydrogenase (acceptor) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/74); new base A (7/4); total (87/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCTTTAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTATGA > CP000730/2744073‑2744351 | tAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCttt < 2:616176/141‑1 (MQ=255) tAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCttt < 1:125706/141‑1 (MQ=255) aCTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAACTGAGAAATCTTAAAg < 1:1208673/141‑1 (MQ=255) ttttttGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCTTTAAGAttt > 1:1442138/1‑141 (MQ=255) 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cTTTAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatg > 1:632356/1‑141 (MQ=255) cTTTAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatg < 1:1389569/141‑1 (MQ=255) tttAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatgt > 2:1395251/1‑140 (MQ=255) tttAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatga > 1:392786/1‑141 (MQ=255) tttAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatga < 1:965091/141‑1 (MQ=255) | TAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCTTTAAGATTTCTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTATGA > CP000730/2744073‑2744351 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |