| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 512,004 | T→C | 8.0% | intergenic (+72/‑789) | recR → / → rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 512,004 | 0 | T | C | 8.0% | 320.7 / 15.6 | 112 | intergenic (+72/‑789) | recR/rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/60); new base C (3/6); total (46/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GGTGGCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAATAGTAATGATGTGAATTG > CP000730/511864‑512144 | ggTGGCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCttttt > 1:15414/1‑141 (MQ=255)ggTGGCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCttttt > 2:569185/1‑141 (MQ=255)ggTGGCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCttttt > 2:525612/1‑141 (MQ=255) gTGGCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTt > 1:261335‑M2/1‑140 (MQ=255) ggCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTtta > 2:616641‑M2/1‑138 (MQ=255) agagTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtgg < 2:1138017/141‑1 (MQ=255) agagTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtgg > 2:634221/1‑141 (MQ=255) gagTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TGATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggt < 2:827391/141‑1 (MQ=255) gagTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggt < 1:776590/141‑1 (MQ=255) gagTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggt < 1:1518345/141‑1 (MQ=255) gagTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAACCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggt > 1:1255354/1‑141 (MQ=255) aagTATGCTGACGTAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAAAAATGTAATGTCTTCTATTACACATTTTTGATTTTAATACTATAGAAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggt < 2:861974/140‑1 (MQ=255) gTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATggtgtggtgt > 2:607357/1‑141 (MQ=255) tGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGAt > 1:516212/1‑141 (MQ=255) gCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATg > 2:1573510/1‑141 (MQ=255) gCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAAAAAAGCCACAATGATTA‑CACTGTGACTTTTCttactatagtattaaaat > 2:1545418‑M2/1‑123 (MQ=255) aaGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTactact < 2:1334649/141‑1 (MQ=255) aGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGGACTACtt > 2:89980/1‑141 (MQ=255) aGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGGAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGCTTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACtt < 1:1159006/141‑1 (MQ=255) gTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt > 2:205543/1‑141 (MQ=255) aaCATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCCTCTATTAAACATTTTTTTTTTTTTTACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTA‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACtttct > 2:806312/1‑139 (MQ=255) ttATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGc < 2:254640/141‑1 (MQ=255) tATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCg < 2:888663/141‑1 (MQ=255) aTCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCgg < 1:943832/141‑1 (MQ=255) aTCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCgg < 1:159391/141‑1 (MQ=255) aTCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCgg < 2:522532/141‑1 (MQ=255) aTCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCgg < 2:1500945/141‑1 (MQ=255) tCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATTCTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGgt < 1:619498/141‑1 (MQ=255) tCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGgt > 1:1625795/1‑141 (MQ=255) tCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGgt < 2:537176/141‑1 (MQ=255) cTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGTAAAGACACAGTG‑TTATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGgtg > 1:1313315/1‑141 (MQ=255) gCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCg < 2:1109057/141‑1 (MQ=255) gCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCg < 1:277373/141‑1 (MQ=255) gCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAAAAAAGCCACAATG‑ATTACACTGTGACTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacatt > 1:419078‑M2/1‑99 (MQ=255) gCAAGCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCg < 1:766318/141‑1 (MQ=255) aaTCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggt < 1:221388/141‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtg < 1:878113/141‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtg < 1:700365/141‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtg > 1:806338/1‑141 (MQ=255) tCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtgg < 1:229422/141‑1 (MQ=255) tCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtgg > 1:1218240/1‑141 (MQ=255) cGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtggt > 2:178023/1‑141 (MQ=255) gCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTa > 1:171425/1‑141 (MQ=255) gCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTa < 2:1335741/141‑1 (MQ=255) ggTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATgg > 2:876847/1‑141 (MQ=255) tAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGtt < 2:1087083/141‑1 (MQ=255) tAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGtt > 1:133458/1‑141 (MQ=255) gAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTa > 2:1168435/1‑141 (MQ=255) aaCAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCAGTGTGGCGGTGGTATGGTTTAc < 1:1183889/141‑1 (MQ=255) gAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTGTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAg < 2:1530799/141‑1 (MQ=255) aaaTGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGt > 2:1435676/1‑141 (MQ=255) aaaTGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGt < 2:739015/141‑1 (MQ=255) aaaTGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAAACATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGt > 1:425770/1‑141 (MQ=255) aaaTGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATAATATAGAAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGt < 2:1146300/141‑1 (MQ=255) gtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTa < 2:516212/141‑1 (MQ=255) gtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTa < 1:211867/141‑1 (MQ=255) aatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACt < 1:642889/141‑1 (MQ=255) aatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACt < 1:927772/141‑1 (MQ=255) atgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTg < 2:299458/141‑1 (MQ=255) gtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAg < 1:791366/141‑1 (MQ=255) cttctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAggg > 2:1104871/1‑141 (MQ=255) ttctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGa < 2:1079726/141‑1 (MQ=255) ctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATg < 2:598978/141‑1 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATggg < 1:743146/141‑1 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATggg > 1:1390025/1‑141 (MQ=255) ttAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGCGGGCTGGGt < 2:738285/141‑1 (MQ=255) ttAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGt < 2:15414/141‑1 (MQ=255) cATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATTGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTTCCTAGTTTTACTGAGGGATGTGTAATCt > 2:630164/1‑141 (MQ=255) tttttGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCttt > 1:303261/1‑141 (MQ=255) tttGATTTTAATACTATAGTAAGAAAGGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAg < 2:1307924/141‑1 (MQ=255) ttGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAgg < 2:527767/141‑1 (MQ=255) tGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGa > 1:72408/1‑141 (MQ=255) ttttttttttcTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGTGGTGTGGCTGTGTTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATTGGTAATCTTTAGGaa > 2:1511692/11‑141 (MQ=255) gATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGaa < 2:686126/141‑1 (MQ=255) ttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGaagcaa > 1:855574/1‑141 (MQ=255) aTACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGcc > 1:716509/1‑141 (MQ=255) aCTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCgt < 1:1162808/141‑1 (MQ=255) aCTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCgt < 1:521865/141‑1 (MQ=255) aaGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTtgtg > 1:1357276/1‑141 (MQ=255) gAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGAt < 2:350676/141‑1 (MQ=255) aaaaGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGAtt > 1:424586/1‑141 (MQ=255) aaaaGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGAtt < 1:751241/141‑1 (MQ=255) aGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGt < 1:1279484/141‑1 (MQ=255) aGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGt < 1:819771/141‑1 (MQ=255) aGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGt > 1:1587090/1‑141 (MQ=255) tCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTa < 1:1012947/141‑1 (MQ=255) tCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgattgctttagataatgttacttcgtcagcatactctaaatcgccacctaccga < 2:742232‑M2/141‑116 (MQ=255) tCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgattgctttagataatgttacttcgtcagcatactctaaatcgccacctaccga < 2:289402‑M2/141‑116 (MQ=255) tCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgattgctttagataatgttacttcgtcagcatactctaaatcgccacctaccga < 2:865227‑M2/141‑116 (MQ=255) cacaGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTTTGTTTTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTAc > 2:820449/1‑141 (MQ=255) cacaGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTAc > 2:112595/1‑141 (MQ=255) caGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgattgctttagataatgttacttcgtcagcatactctaaatcgccacctaccgataa < 2:890835‑M2/141‑119 (MQ=255) caGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgattgctttagataatgttacttcgtcagcatactctaaatcgccacctaccgataa < 2:246203‑M2/141‑119 (MQ=255) aGTG‑TAATCATTGTGGGTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTc > 1:478633/1‑141 (MQ=255) g‑tAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTaa < 1:407397/141‑1 (MQ=255) tAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAAt < 1:65685/141‑1 (MQ=255) tgtgGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAATAGTAatg < 1:1168435/141‑1 (MQ=255) ggCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAATAGTAatgatg < 2:1390025/141‑1 (MQ=255) gCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAATAGTAATGAtgt > 1:1109217/1‑141 (MQ=255) tttATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAATAGTAATGATGTGAATTg > 1:979718/1‑141 (MQ=255) | GGTGGCGATTTAGAGTATGCTGACGAAGTAACATTATCTAAAGCAATCGCAGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTG‑TAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAAGCAAGCCGTTGGTTGTGATTTGTTACTTCTAATAGTAATGATGTGAATTG > CP000730/511864‑512144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |