Predicted mutation | |||||||
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RA | CP000730 | 618,558 | T→C | 6.5% | S1220S (AGT→AGC) | sdrD → | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 618,558 | 0 | T | C | 6.5% | 402.6 / 5.1 | 152 | S1220S (AGT→AGC) | sdrD | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGA > CP000730/618418‑618698 | tCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGt > 1:1226049/1‑141 (MQ=255) aGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGa < 2:931062/141‑1 (MQ=255) gattCAGATGGCGACGCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACACAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGAc < 2:1534565/138‑1 (MQ=255) gACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGtagc > 2:1560668/1‑138 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |