| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,920,410 | C→A | 5.7% | V306L (GTG→TTG) | menC ← | possible o‑succinylbenzoic acid (OSB) synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,920,410 | 0 | C | A | 5.7% | 243.1 / 3.1 | 70 | V306L (GTG→TTG) | menC | possible o‑succinylbenzoic acid (OSB) synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/34); new base A (2/2); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.42e-01 | |||||||||||
TCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATGACTTTTCA > CP000730/1920273‑1920547 | tCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATc < 1:357841/141‑1 (MQ=255) cGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCtt < 2:588262/141‑1 (MQ=255) gTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTg > 2:70972/1‑141 (MQ=255) gTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTg > 1:4321/1‑141 (MQ=255) ttAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCAAATCTTGt > 1:563364/1‑141 (MQ=255) ttAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCATGAATGCGCCACCAAATCTTGt > 1:5746/1‑141 (MQ=255) tAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGtt < 1:268622/141‑1 (MQ=255) aaaaaGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑aa < 2:587354/141‑1 (MQ=255) aaaaaGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑aa < 1:305565/141‑1 (MQ=255) aCAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAaataat > 1:368323/1‑141 (MQ=255) aCAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAaataat < 2:241213/141‑1 (MQ=255) aaGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAAtaataa < 2:476848/141‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAAcc < 1:224708/141‑1 (MQ=255) gcaagcaagcaTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACctgct > 2:546356/1‑141 (MQ=255) aagcaagcaTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTgg < 1:436244/141‑1 (MQ=255) atgcaTTCACATAATCATTCCCATTAATACGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGTCTGAATGCGCCACCCCATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATACCCTGCTGGTGTa < 2:392155/139‑1 (MQ=255) aagcaTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTa < 2:169385/141‑1 (MQ=255) agcaTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTaa < 1:398828/141‑1 (MQ=255) caTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCAAATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACa < 2:563364/141‑1 (MQ=255) caTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCAAATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACa < 2:5746/141‑1 (MQ=255) ttCACATAAACATAACCCTTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTTTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACAtc < 1:39413/141‑1 (MQ=255) ataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAAt < 2:359683/141‑1 (MQ=255) taaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGCCTCCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATc > 1:329787/1‑141 (MQ=255) taaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTGAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCACCTGGATAATc > 1:157031/1‑141 (MQ=255) taaCCATTAATATGGCTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATc > 2:239946/1‑141 (MQ=255) aCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCAc > 2:149048/1‑141 (MQ=255) aCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCAGGAGTAACAACTAATGGATaacggc < 2:187054/141‑5 (MQ=255) atGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGag < 1:326052/141‑1 (MQ=255) tGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGagc < 1:154578/141‑1 (MQ=255) tGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGagcaagc < 1:518980/141‑1 (MQ=255) aaTTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATc > 1:128749/1‑141 (MQ=255) aaTTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATc > 1:485203/1‑141 (MQ=255) aTTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCg < 2:702375/141‑1 (MQ=255) aTTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCg < 1:707850/141‑1 (MQ=255) aTTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCg > 1:139243/1‑141 (MQ=255) ttGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGc < 2:409331/141‑1 (MQ=255) ttGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGc < 2:528323/141‑1 (MQ=255) tataTCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTaaa < 1:467958/141‑1 (MQ=255) tCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAg < 2:166722/141‑1 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 1:9827/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 2:121017/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAACAGCgac > 2:650002/1‑139 (MQ=255) ggggggCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTaaa > 1:618001/1‑141 (MQ=255) gggCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCa > 1:635095/1‑141 (MQ=255) cgactcgaatttCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCatat > 1:485319/12‑141 (MQ=255) gAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCGGAATTCGCCGCCGCATCTGGTTC‑‑‑AAAATAATAACCGGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATAtt < 1:239946/141‑1 (MQ=255) aaaTTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTACAATAGCGGCTTAAACCATATTc > 1:507064/1‑141 (MQ=255) aTTCGAGTCGCCCCTCTTATAATATGCCTGAATGCGCCACAACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACGTGCTGGTGTAACATATCCTGGATAATCACCTATACGTGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATCTTCGt < 2:311638/141‑1 (MQ=255) tCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGATTTAGTAACCACATCTTGATC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAACGGCTTAAACCATATTCATAc > 1:631620/1‑141 (MQ=255) tCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTAc < 2:610735/141‑1 (MQ=255) gAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACAt > 2:523495/1‑141 (MQ=255) cGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATgccg > 1:19096/1‑141 (MQ=255) gCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATgccgc > 1:76791/1‑141 (MQ=255) gCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATgccgc > 1:378925/1‑141 (MQ=255) tttAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAAcc < 2:485030/141‑1 (MQ=255) ttAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCa > 1:184489/1‑141 (MQ=255) ttAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCGCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCa < 2:466928/141‑1 (MQ=255) atatGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACtt > 1:268155/1‑141 (MQ=255) atatGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACtt < 1:184510/141‑1 (MQ=255) atatGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACtt > 2:70114/1‑141 (MQ=255) atGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACtttt > 2:262/1‑141 (MQ=255) gCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAg < 2:635431/97‑1 (MQ=255) gCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAg > 1:635431/1‑97 (MQ=255) aaTGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCAt > 2:166068/1‑141 (MQ=255) aaTGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCAt > 1:258488/1‑141 (MQ=255) aTGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATg > 2:254452/1‑141 (MQ=255) tGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATGa < 2:439605/141‑1 (MQ=255) cgcCACCACATCTTGTTCAAAAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATg < 2:374486/141‑1 (MQ=255) cgcCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATGACt < 2:53022/141‑1 (MQ=255) ccaccaCATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATGACttt > 1:388296/1‑141 (MQ=255) ccacATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATGACTTTTCa < 2:34211/141‑1 (MQ=255) | TCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGAGTCGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTC‑‑‑AAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATAACCACTTTTGCACCATGACTTTTCA > CP000730/1920273‑1920547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |