Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	2127089	2127148	60	3 [1]	[1] 2	USA300HOU_2008/int	hypothetical bacteriophage protein/bacteriophage integrase

AGAAAAGTTTTACCCCAAAAAATTAAAAATCCAGTAATAGATTCTTCGGATATTATGTTACTGATAAATAGAATTAATAATAATATATTGCAGATTCCTGATATAAGATGATATAATTTTAATATATTAAAGGTTTATCCTTTAAAACACGTATATATTCGTTA  >  CP000730/2126948‑2127111                                                                                                                                             |                        aGAAAAGTTTTACCCCAAAAAATTAAAAATCCAGTAATAGATTCTTCGGATATTATGTTACTGATAAATAGAATTAATAATAATATATTGCAGATTCCTGATATAAGTTGATATAATTTTAATATATTAAAGGTTTATCCt                         <  1:45255/141‑1 (MQ=255) aGAAAAGTTTTACCCCAAAAAATTAAAAATCCAGTAATAGATTCTTCGGATATTATGTTACTGATAAATAGAATTAATAATAATATATTGCAGATTCCTGATATAAGATGATATAATTTTAATATATTAAAGGTTTATCCt                         <  1:80503/141‑1 (MQ=255)                        tAAAAATCCAGTAATAGATTCTTCGGATATTATGTTACTGATAAATAGAATTAATAATAATATATTGCAGATTCCTGATATAAGATGATATAATTTTAATATATTAAAGGTTTATCCTTTAAAACACGTATATATTCGTTa  <  1:78501/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                                             |                        AGAAAAGTTTTACCCCAAAAAATTAAAAATCCAGTAATAGATTCTTCGGATATTATGTTACTGATAAATAGAATTAATAATAATATATTGCAGATTCCTGATATAAGATGATATAATTTTAATATATTAAAGGTTTATCCTTTAAAACACGTATATATTCGTTA  >  CP000730/2126948‑2127111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑