| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 515946 | NA (NA) | 4 (0.050) | 3/244 | NT | NA | noncoding (1241/2921 nt) | rrl1 | 23S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | = 515981 | NA (NA) | noncoding (1276/2921 nt) | rrl1 | 23S ribosomal RNA | |||||
TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/515800‑515946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctaagCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATT < CP000730/515981‑515842 gAGGAGGTGGGCGTAGAACCAGCCATCTTTTAAAGAGTGCGTAATGGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 1:217331/140‑1TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 2:256957/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 1:909569/141‑1TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 2:1010193/141‑1TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 1:51006/141‑1TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 2:1053258/1‑141TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 1:258704/1‑141 AGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGGCACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTT > 2:49796/1‑141 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GGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTC < 1:959316/141‑1 GGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTC < 2:928709/141‑1 GGATGTTGGCGTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTC < 2:107199/141‑1 GATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCT < 1:520279/141‑1 GATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCT < 2:842444/141‑1 GATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCT < 1:106351/141‑1 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CTAAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGC > 1:622582/1‑141 TAAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCT < 1:468966/141‑1 TAAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCT < 1:674334/141‑1 AAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAACGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTA < 1:381787/141‑1 AAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTA > 1:403447/1‑141 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTAT > 2:344349/1‑141 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TAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/515800‑515946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctaagCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATT < CP000730/515981‑515842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |