| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 893176 = | 88 (0.990) | 7 (0.090) | 6/234 | NT | 8.6% | intergenic (+177/‑73) | USA300HOU_0846/metN | possible thioredoxin/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| ? | CP000730 | 893212 = | 69 (0.860) | intergenic (+213/‑37) | USA300HOU_0846/metN | possible thioredoxin/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein | |||||
ATAAATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/893327‑893176‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attgagaaagcaTTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGATCGAT > CP000730/893212‑893346 ATAAATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAA < 1:1044391/141‑1ATAAATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAA > 1:820358/1‑141 TAAATTAACGTGATCTNCAGCAAGGACTTNTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAATAAT > 1:656069/1‑141 TAAATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTTTGTTATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAAT > 1:185328/1‑141 TAAATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAAT > 2:63423/1‑141 AATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTG < 2:854456/141‑1 ATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGA > 2:836918/1‑141 TTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAG < 2:14767/141‑1 TTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAG > 2:147125/1‑141 TAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGA < 2:206767/141‑1 CGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAG > 2:508386/1‑141 GTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGC > 2:303320/1‑141 TGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTAAAAAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCA < 2:472295/141‑1 GCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATTTTTCTATCGATATTGAGAAAGCATTTTTTATT < 2:486902/141‑1 ATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATTTTTCTATCGATATTGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACAC < 1:254613/141‑1 tTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACG < 2:359283/140‑1 CAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATT > 1:873429/1‑141 AATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCATTTTTTATTTTTTTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGAAAACGTTAATTT > 2:464819/1‑141 AATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTCAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTT > 1:247765/1‑141 AGAAAAATTGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCG > 1:510828/1‑141 TTGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGA > 2:1067242/1‑141 TGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAATAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGAT < 2:575752/141‑1 TGAGAAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGAT > 1:93218/1‑141 AAAGCATTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGATCGAT > 1:235425/1‑141 ATAAATTAACGTGATCTACAGCAAGGACTTCTTTATTTTTAGTCCGATATTCTTTAACAACTTCTTTTAATTCAATCACGTTGATTCCTCCCTGTGTTGCTTAATAAAATAAAAAATGCTTTCTCAATATCGATAGAAAAATTGAGAAAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/893327‑893176‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attgagaaagcaTTTTTTATTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGATCGAT > CP000730/893212‑893346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |