| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1822865 = | 93 (1.050) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 5.6% | intergenic (+186/+60) | USA300HOU_1697/ackA | possible universal stress protein/acetate kinase |
| ? | CP000730 | 1822909 = | 83 (1.010) | intergenic (+230/+16) | USA300HOU_1697/ackA | possible universal stress protein/acetate kinase | |||||
CTCATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/1823013‑1822865‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tagacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTAAG > CP000730/1822909‑1823048 CTCATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGT < 2:165582/141‑1 TCATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTA < 2:526488/141‑1 TCATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGCTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTA < 2:573226/141‑1 CATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTGAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAG < 1:785033/141‑1 CATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAG < 1:54178/141‑1 CATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAG > 2:128317/1‑141 CATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAG < 1:53991/141‑1 atcCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGA < 1:1048031/138‑1 ATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGA > 1:941942/1‑141 ATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGA > 1:1017090/1‑141 ATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGA > 1:957973/1‑141 TTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGAC > 1:750456/1‑141 TCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACG > 1:696123/1‑141 ACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCT < 2:972372/141‑1 ACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCT < 1:633256/141‑1 GTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTACCTC‑‑CTACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTA < 2:374254/141‑1 CCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCAACTACA‑ATTATATGTA‑‑GTATGTATACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACAACCAAATGTAATAACATC > 2:900948/1‑141 TATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTAGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGA > 2:777578/1‑141 CCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATA > 1:151699/1‑141 CGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCTTTTTGTATTGTTTGAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATA > 2:137449/1‑141 GACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGT < 1:550169/141‑1 GACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGT > 1:545372/1‑141 GACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGT > 1:1042128/1‑141 CTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTA > 2:637287/1‑141 TAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTAAG > 1:943766/1‑141 CTCATTCACCAGTTAAAGTTGTCGTTATTCCAACAGATGAAGAAAGTATGATTGCCCGTGATGTTATGACATTCGGTGGTTTAAAATAATTTTTAAATAAATATTAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTA‑‑GGAGGTAGACGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/1823013‑1822865‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tagacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTAAG > CP000730/1822909‑1823048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |