| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | 2053094 = | 80 (0.900) | 6 (0.070) | 5/242 | NT | 7.9% | intergenic (‑113/+59) | pcrB/yerC | PcrB family protein/possible Trp repressor |
| ? | CP000730 | 2053141 = | 64 (0.770) | intergenic (‑160/+12) | pcrB/yerC | PcrB family protein/possible Trp repressor | |||||
ACATACATATGATTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATCGTTGCATA > CP000730/2053002‑2053281 | acatacatATGATTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTTTTTTTTTTTCAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATTACCATTGTTTAt > 2:781154/1‑141 (MQ=255) tttttttattattatAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCTTGAATAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATc > 2:833845/7‑141 (MQ=255) catacataTGATTATAGTGATTGGAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATc < 1:555590/141‑1 (MQ=255) catacataTGATTATAGCATTTCTAAATGTTGTGTTTTTAATACTTAATATTAAATTTAAGGTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTTCCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATc < 1:585472/141‑1 (MQ=255) gtgaagcgttcattacaatggggtaatgatgcttatacaatgattttaaatcgaacgaatattgaaacaaatggataataaatgaacgataaacaatggttatatatctgaactaataaagtagataatccttgtttATCg > 2:159054‑M2/138‑141 (MQ=255) atacataTGATTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCg > 1:28604/1‑141 (MQ=255) cataTGATTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTc < 1:672870/141‑1 (MQ=255) gATTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATtta < 1:737739/141‑1 (MQ=255) tcctttcactggtgtaatattgcttatacaatgattttagatcgtatgaatattgaaacaaatgaataataaatgagcgatAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATttat > 2:549953‑M1/82‑141 (MQ=255) aTTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTACTATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATttat > 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aGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCGGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTc > 2:699620/1‑141 (MQ=255) aGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTc < 1:239988/141‑1 (MQ=255) gCATTTTTGAGTTTAGAGAGCTAAAGACTTAATATAAGATTTAAGTTCTTTTACTCTTTAATTTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATATATCTTATTAGTTCATATAGATAACCATTGTTTATTGTTCATTTnttattaa > 2:816511/1‑139 (MQ=255) gCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCTTTTTAATACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCa > 2:109217/1‑141 (MQ=255) cATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCAt < 1:517192/141‑1 (MQ=255) aTTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCAtt < 1:280480/141‑1 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2:34515/1‑141 (MQ=255) tGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAg > 1:340356/1‑141 (MQ=255) gCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGa > 1:25152/1‑141 (MQ=255) agatagatAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGAtt < 2:91114/141‑1 (MQ=255) agatagatAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGAtt > 2:718559/1‑141 (MQ=255) gttgattatcattttttATCGTTCATTTATTATTCTTTTGTCTTAATAGTCATACGATGCAAAATCATTGTATACGCATCATTCCCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCt < 1:159054‑M2/124‑1 (MQ=255) atagataACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCt < 2:949423/141‑1 (MQ=255) agataACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTg < 2:422075/141‑1 (MQ=255) gataACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGt < 1:981809/141‑1 (MQ=255) aaCCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCa > 2:848315/1‑141 (MQ=255) cattgtttATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATc > 1:271566‑M2/9‑141 (MQ=255) gtttATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTGCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATCGTTg > 1:319290‑M2/5‑141 (MQ=255) tATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATCGTTGCAt < 1:421888‑M2/140‑1 (MQ=255) tATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATCGTTGCAt < 1:1080317‑M2/140‑1 (MQ=255) aTCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATCGTTGCATa > 2:964829/1‑141 (MQ=255) | ACATACATATGATTATAGCATTTTTAAGTGTCGAGTTCTAAAGACTTAATATGAAATTTAAGTTCTTTTACTCTGTAAATTTTTTCGTGAAAAAACAATGATTATCTACCTTATTAGTGCAGATAGATAACCATTGTTTATCGTTCATTTATTATTCATTTGTTTCAATATTCATACGATCTAAAATCATTGTATAAGCATCATTACCCCATTGTAATGAACGCTTCACTCTAGAAATCGTTGCAGTCGATGCTCCAGATTCTTGTTCAATCGTTGCATA > CP000730/2053002‑2053281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |