| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2628271 = | 86 (0.970) | 4 (0.050) | 4/242 | NT | 4.8% | intergenic (+141/+70) | sarU/galU | staphylococcal accessory regulator U/UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| ? | CP000730 | 2628335 = | 79 (0.950) | intergenic (+205/+6) | sarU/galU | staphylococcal accessory regulator U/UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGAAGTCATATGC > CP000730/2628195‑2628475 | aataaaAATACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCttt > 1:15893/1‑141 (MQ=255)aataaaAATACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCttt < 1:981631/141‑1 (MQ=255) aatatgcattgaaagatgacagtatgcgagaagaattaacacgatttattaaagcattaggtttataacattaaAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTa > 2:114594‑M1/75‑141 (MQ=255) atatgcattgaaagatgacagtatgcgagaagaattaacacgatttattaaagcattaggtttataacattaaAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTaa > 1:707239‑M1/74‑141 (MQ=255) aaaaTACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAAt > 2:646060/1‑141 (MQ=255) aaaaTACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAAt < 2:868487/141‑1 (MQ=255) aaaTACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATg > 2:854712/1‑141 (MQ=255) aTACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGtt > 2:641932/1‑141 (MQ=255) aCATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAACTTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTtat > 2:283202/1‑141 (MQ=255) aTTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAAcc < 2:938537/141‑1 (MQ=255) aCTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAAt > 2:847292/1‑141 (MQ=255) ctttctttTGTTTTTTTTTTTTTTTAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTTCTGTGTATCATGTTTTTAATGTTATAAACCTAAta > 2:308716/1‑140 (MQ=255) tttctttTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGCTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGc > 2:1085133/1‑141 (MQ=255) ttttGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTta < 2:1006795/141‑1 (MQ=255) tttGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTtaa < 1:156147/141‑1 (MQ=255) tGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTtaata < 2:600521/141‑1 (MQ=255) tttttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATaaa > 2:403333/1‑141 (MQ=255) tttttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATaaa < 1:317689/141‑1 (MQ=255) tttttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGAAACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCTAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATaaa > 1:795843/1‑141 (MQ=255) tttttATATTATTTAAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCCATTTTATTGAGCATCCTGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGATTTCATaaa > 2:516792/1‑141 (MQ=255) tttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACGGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCGTTAATaaagc < 2:372165/141‑3 (MQ=255) tataTTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTta > 1:987143/1‑116 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCCTTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTTCTGCTTTAATAAATtgtg > 2:778111/1‑141 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtg > 1:746576/1‑141 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtg > 2:853140/1‑141 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtg > 1:212758/1‑141 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtg > 2:182061/1‑141 (MQ=255) tattatTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtgt < 1:255373/141‑1 (MQ=255) ttattTCAATACCCTACTATATATCAGAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTa < 2:861470/141‑1 (MQ=255) attTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAt < 2:600762/141‑1 (MQ=255) tCAATCCCCTAATATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttct < 2:918140/141‑1 (MQ=255) tCAATACCCTACTATATATCTCATCACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttct < 2:487369/141‑1 (MQ=255) tCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttct < 1:4690/141‑1 (MQ=255) tCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCCTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttct > 1:394381/1‑141 (MQ=255) cAATACCCTACTATATNTCACAACACATANATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttctt > 1:684931/1‑141 (MQ=255) aaTACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttcttc > 1:289630/1‑141 (MQ=255) aTACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATtcttct < 2:854125/141‑1 (MQ=255) cccTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGc > 2:72012/1‑141 (MQ=255) cccTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGc > 2:422211/1‑141 (MQ=255) ccTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCa > 1:447653/1‑141 (MQ=255) actaTATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATAc > 1:813504/1‑141 (MQ=255) ctaTATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACt < 2:145559/141‑1 (MQ=255) ctaTATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACt < 2:839065/141‑1 (MQ=255) tatataTCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTg < 2:458151/141‑1 (MQ=255) tatatCACTACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTc < 2:603781/141‑1 (MQ=255) tatatCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCAATCAAGTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCGTTTAATGTTATAACCCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCCGCTCGCATCCTGTc < 2:790403/141‑1 (MQ=255) atatCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCa < 1:693672/141‑1 (MQ=255) cacaACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCtt > 1:840277/1‑141 (MQ=255) acacATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTTTAAACCTAATGCTTTAATAAATCTTTTTAATTCTTCTCGTATACTGTCATTTTTCaa > 2:161465/1‑141 (MQ=255) aTAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCa < 2:287549/141‑1 (MQ=255) tAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCat > 1:1045860/1‑141 (MQ=255) ttaaaagcatgatactcagtaaaattggaacacgaaatggtgaactaaattgaatgagtgtcatgcttTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCatat > 1:707239‑M2/69‑141 (MQ=255) taaaagcatgatactcagtaaaattggaacacgaaatggtgaactaaattgaatgagtgtcatgcttTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATAtt > 2:114594‑M2/68‑141 (MQ=255) aTTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATAtt > 1:957855/1‑141 (MQ=255) tAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCt < 2:220739/141‑1 (MQ=255) tAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCt < 1:1069370/141‑1 (MQ=255) AGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACAGAGTATCATGATTTTCCTGTAATACACGTATTGCGTTAATAATGCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCtac > 1:1029197‑M1/1‑140 (MQ=255) gcatgatactcagtaaaattggaacacgaaatggtgaactaaattgaatgagtgtcatgcttTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATg > 1:717757‑M2/63‑141 (MQ=255) GCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATg < 2:948472‑M1/141‑1 (MQ=255) GCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATg < 2:810222‑M1/141‑1 (MQ=255) caggagacTCAAGCAATATAGTTCACCATGTCGTGATCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTGTAATAAATCGTGTGAATTCTTCGCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATgg < 2:158239/135‑1 (MQ=255) aattacacTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGAGTTAATCTTCCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATgg < 1:1063127/137‑1 (MQ=255) CATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATgg < 1:56300‑M1/141‑1 (MQ=255) atgatactcagtaaaattggaacacgaaatggtgaactaaattgaatgagtgtcatgcttTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGt > 1:968702‑M2/61‑141 (MQ=255) ACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGt < 1:573416‑M1/141‑1 (MQ=255) cacTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGtt < 1:208427/141‑1 (MQ=255) cATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTaa > 1:27322/1‑141 (MQ=255) aTTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAAc < 2:945206/141‑1 (MQ=255) aTTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGc < 2:962588/141‑1 (MQ=255) aTTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGc > 2:1004524/1‑141 (MQ=255) tttAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGcc < 2:925911/141‑1 (MQ=255) aGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTaa < 1:576394/141‑1 (MQ=255) aGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTaa < 1:576128/141‑1 (MQ=255) gTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGCAGCCTAAt > 1:597344/1‑141 (MQ=255) cACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAAtttt > 1:907176/1‑141 (MQ=255) ttCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCa > 1:321214/1‑141 (MQ=255) cGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAAc > 1:144874/1‑141 (MQ=255) gtgtTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTTTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACg > 2:1035617/1‑141 (MQ=255) gtgtTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACg > 1:349106/1‑141 (MQ=255) tgtTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGt < 1:224645/141‑1 (MQ=255) tgtTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGt > 1:7836/1‑141 (MQ=255) tgtTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGt > 1:1086368/1‑141 (MQ=255) gtTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTc > 1:652797/1‑141 (MQ=255) ccAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATa > 1:870400/1‑141 (MQ=255) aaTTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAAc < 1:978869/141‑1 (MQ=255) tttATTGAGTATCATGCTTTTAATATTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAACGCATATTCTATTGTTGTTTTGACAAATCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGtt < 2:587931/141‑1 (MQ=255) ttACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTc < 2:107706/141‑1 (MQ=255) ttACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTc < 2:15893/141‑1 (MQ=255) ttACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTc < 1:983196/141‑1 (MQ=255) tACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTcc < 1:1029864/141‑2 (MQ=255) tACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCg > 1:104937/1‑141 (MQ=255) tcTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGc < 2:399563/140‑1 (MQ=255) gAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCtt > 2:630689/1‑141 (MQ=255) aGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTc < 2:893859/141‑1 (MQ=255) aGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTc > 1:44103/1‑141 (MQ=255) aTCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGaa < 2:911381/141‑1 (MQ=255) atgcttTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGAAGTc < 2:370755‑M2/135‑1 (MQ=255) tTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGAAGTCATATg < 2:25465‑M2/140‑1 (MQ=255) ttAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGAAGTCATATGc < 2:309476/141‑1 (MQ=255) ttAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGAAGTCATATGc < 2:860768/141‑1 (MQ=255) | AATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTGTTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCTATGGTAGTTTTAACGAAGCCTAATTTTTCTCCAACGTCATAACGTTCGCCTTCGAAGTCATATGC > CP000730/2628195‑2628475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |