New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 2676550 | 84 (0.960) | 4 (0.050) +TTAG |
4/248 | NT | 4.7% | intergenic (‑22/+25) | ilvB2/cidB | pyruvate oxidase/hypothetical membrane protein |
? | CP000730 | 2676551 = | 84 (0.950) | intergenic (‑23/+24) | ilvB2/cidB | pyruvate oxidase/hypothetical membrane protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGTACGTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGCTTTAGCTGT > CP000730/2676412‑2676691 | tGTACGTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTg > 2:446057/1‑141 (MQ=255) cgtaaactatcgacaactgcgtcgattgagtctcctggaataccatacaagtgatctatatcccatgcttgtaatgctttaactaatgcttcatttgcttttatttttgccattattactaatagcctccctttcttagtg > 2:193398‑M2/140‑141 (MQ=255) gTACGTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGt > 1:432480/1‑141 (MQ=255) cGTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTAGTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTa > 1:11009/1‑141 (MQ=255) gTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTAt < 2:22820/141‑1 (MQ=255) tAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATc > 1:202872/1‑141 (MQ=255) aaaCTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCa < 2:55688/141‑1 (MQ=255) tATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCAtttt > 2:936984/1‑141 (MQ=255) tATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCAtttt < 2:632338/141‑1 (MQ=255) tATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCAtttt > 2:529898/1‑141 (MQ=255) cGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTCTaaa > 1:140066/1‑141 (MQ=255) gACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAat > 2:455233/1‑141 (MQ=255) acgcagtagTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTCTCATTTTAAata > 1:573617/9‑141 (MQ=255) cgattgagtctcctggaataccatacaagtgatctatatcccatgcttgtaatgctttaactaatgcttcatttgcttttatttttgccattattactaatagcctccctttcttagTGTCTATCATTTTAAATATCTaaa > 1:164988‑M2/118‑141 (MQ=255) tCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTa > 2:556350/1‑141 (MQ=255) agctaagtgTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTa < 2:965805/133‑1 (MQ=255) cGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTaa < 1:446057/141‑1 (MQ=255) ttGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAg > 1:294498/1‑141 (MQ=255) tGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGa < 2:367591/141‑1 (MQ=255) ccTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAAtaataa < 2:401019/141‑1 (MQ=255) ccTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTATATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAAtaataa > 1:699649/1‑141 (MQ=255) tGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATaaaa < 1:196985/141‑1 (MQ=255) ataccatacaagtgatctatatcccatgcttgtaatgctttaactaatgcttcatttgcttttatttttgccattattactaatagcctccctttcttagTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATaaaa < 1:443276‑M2/41‑1 (MQ=255) aTACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTCTTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATATAATACTAAAATTAg > 2:840342/1‑141 (MQ=255) aTACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAg > 1:750630/1‑141 (MQ=255) aCCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGaa > 2:302847/1‑141 (MQ=255) ccATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAAc > 1:306233/1‑141 (MQ=255) cATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACa > 1:688940/1‑141 (MQ=255) cATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACa > 2:12939/1‑141 (MQ=255) aTACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAg > 1:834856/1‑141 (MQ=255) aCAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGt < 1:307350/141‑1 (MQ=255) tGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTaa < 2:459940/141‑1 (MQ=255) gATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAac > 1:77207/1‑141 (MQ=255) aTCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTTCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAACTTAGAACAGGTATTAaca > 2:38009/1‑141 (MQ=255) aTCTATATCCCATGATTGTAATGCTTTAACTAATGCATCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAAGAAATAaca > 2:288938/1‑141 (MQ=255) tatCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCGTTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGaa > 1:821505/1‑141 (MQ=255) ccATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAAGACtcagataa > 2:742525/1‑134 (MQ=255) aTGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACtaata > 1:474262/1‑141 (MQ=255) tGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACtaataa < 1:722946/141‑1 (MQ=255) gCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAAc < 2:658106/141‑1 (MQ=255) gCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTAGTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAAc > 1:783751/1‑141 (MQ=255) cTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACt < 1:142157/141‑1 (MQ=255) tgctctaacgaatgcttcatttgcttttattgtggccattattactaatagtctccctgtcttagTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCa < 1:321992‑M2/76‑1 (MQ=255) gTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTTTTTTTTTTTCTAATAGACACCCTTTCAGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATCATATACTTAGAACAGGCCTTAACACTGAACTAATAACTGCa > 2:1066621/1‑141 (MQ=255) gTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCa > 1:112129/1‑141 (MQ=255) tAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAGCTAATAACTGCAg < 1:28553/141‑1 (MQ=255) tAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAg < 1:339144/141‑1 (MQ=255) aaTGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGt < 1:207699/141‑1 (MQ=255) aaTGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGt < 1:276110/141‑1 (MQ=255) aaTGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGt < 2:527828/141‑1 (MQ=255) gCTTTATCTAATGCTTCATTTGCGTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTCCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTACTAACTGCAGTTaa < 2:967188/141‑1 (MQ=255) cTTTAACTAATGCTTCATTTCCTTTTATTTTTTTCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTaaa > 2:1087348/1‑141 (MQ=255) tttAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCCGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAAcaagtgctccta > 2:535976/1‑130 (MQ=255) tAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAatc > 2:894941/1‑141 (MQ=255) aaCTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAatca > 1:614952/1‑141 (MQ=255) aaCTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTCTAAAGATCTAAATTAATAGAAGAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAatca > 1:487144/1‑141 (MQ=255) aCTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAatcat < 1:622785/141‑1 (MQ=255) tAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATcc < 2:163539/141‑1 (MQ=255) tAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATcc > 1:991823/1‑141 (MQ=255) aTGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCa > 2:353709/1‑141 (MQ=255) tGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCaa > 2:161738/1‑141 (MQ=255) aTTTGCTTTTATTTTTTTCTTTATTTCTAATAGCCTCCCGCTCTGGCTATCATTTTCAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTCGAACAGGAATTAACACTGAACTAATAACTGTAGTTAAAATCATCCCAATTGaaa > 2:880353/1‑140 (MQ=255) ttATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCa > 2:455106/1‑141 (MQ=255) aTTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCAcc < 2:74885/141‑1 (MQ=255) aTTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCAcc > 1:403362/1‑141 (MQ=255) ttttttTCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTTAATTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCg > 2:12461/1‑141 (MQ=255) tttttGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCg > 1:352775/1‑141 (MQ=255) tttGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGa < 2:920973/141‑1 (MQ=255) tGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGAtt < 1:440499/141‑1 (MQ=255) gCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTc < 1:1701/141‑1 (MQ=255) gCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCACAATTGAACCAAATGCACCGGAATc > 1:684211/1‑141 (MQ=255) cATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCaa > 2:755726/1‑141 (MQ=255) ttattaCTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAata > 1:495685/1‑141 (MQ=255) tattaCTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTACTAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAatat < 1:298964/141‑1 (MQ=255) tattaCTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAatat > 2:650734/1‑141 (MQ=255) tattaCTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAatat < 2:776845/141‑1 (MQ=255) aCTAATAGCCTCCCTTTCCGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCAt > 2:880989/1‑141 (MQ=255) cTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCAtt > 2:653202/1‑141 (MQ=255) cTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCAtt > 1:610808/1‑141 (MQ=255) tAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCAttt > 1:428318/1‑141 (MQ=255) tAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCAttt < 1:1087348/141‑1 (MQ=255) tAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCAttt < 2:764165/141‑1 (MQ=255) tAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAAAATCCAttt > 2:324690/1‑141 (MQ=255) aaTAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTc > 2:853473/1‑141 (MQ=255) aTAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCt > 1:862111/1‑141 (MQ=255) ccctttcttagTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGt > 1:825013‑M2/12‑141 (MQ=255) cTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGc < 1:453251/141‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGc < 1:1003266/141‑1 (MQ=255) tCCCTATCTGTATATCATTTTAAACATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAACTCATCCACCTTGAACTAAATGCACCGGCTTCAATATCCATTTCTAGTGcc < 2:1083476/141‑2 (MQ=255) cccTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGCtt > 2:750034/1‑141 (MQ=255) cccTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGCtt < 1:925974/141‑1 (MQ=255) cTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGCTTTAGCtg > 2:668256/1‑141 (MQ=255) tGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGCTTTAGCtgt < 2:432480/141‑1 (MQ=255) | TGTACGTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCATTATTACTAATAGCCTCCCTTTCTGTCTATCATTTTAAATATCTAAATTAATAGAATAATAAAATTAGAACAGGTATTAACACTGAACTAATAACTGCAGTTAAAATCATCCCAATTGAACTAAATGCACCGGATTCAATATCCATTTCTAGTGCTTTAGCTGT > CP000730/2676412‑2676691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |