New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP000730 | 2757647 = | 106 (1.200) | 4 (0.050) | 4/246 | NT | 3.8% | coding (1735/1851 nt) | nrdD | anaerobic ribonucleotide reductase large subunit |
? | CP000730 | 2757704 = | 101 (1.200) | coding (1678/1851 nt) | nrdD | anaerobic ribonucleotide reductase large subunit | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CGCAAATTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGCAATTTCGGATACTCACAAT > CP000730/2757566‑2757844 | cgcAAATTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCtt > 2:454820/1‑141 (MQ=255) gcAAATTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTc < 2:427748/141‑1 (MQ=255) aaaTTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCaa < 2:795597/141‑1 (MQ=255) aaTTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCaaa < 2:9325/141‑1 (MQ=255) aaTTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCaaa > 2:665015/1‑141 (MQ=255) cTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCACAAtctc > 2:527576/1‑141 (MQ=255) cTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAAtctc > 1:580795/1‑141 (MQ=255) cTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAAtctc > 2:527519/1‑141 (MQ=255) cTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAAtctc > 1:692915/1‑141 (MQ=255) cTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAAtctc < 1:331382/141‑1 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1:409399/1‑141 (MQ=255) ttAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGc < 2:692915/141‑1 (MQ=255) aaaTCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGCaa < 1:601778/141‑1 (MQ=255) aaaTCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGCaa < 2:315956/141‑1 (MQ=255) aaTCCTTTTTCAGTTTCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGCAAt > 2:426593/1‑141 (MQ=255) ccTTTTTCAGTTGCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGCAATTTc < 2:415480/141‑1 (MQ=255) 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1:460911/1‑141 (MQ=255) | CGCAAATTTCTTTATGACGGCCTTTAATTACTGGACGTTGAACTGGATTGCCTAGGTAACCACATGTTCGTTTAACGACATCAACTGTTTTAGGATTATCATTGCCACAGTTCGGGCATTTAAATCCTTTTTCAGTTGCTTCAAAATCTCCATCGTAATCACATTCATAACAATGATCAATCGGAATATTTGTACCTAAGTAACCAACTTTGTCATAAGAGTAGTCCCATACCGCTTCTAGTGCTTTCAAATTGTGTTGCAATTTCGGATACTCACAAT > CP000730/2757566‑2757844 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |