| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 433,119 | 0 | T | G | 5.1% | 261.4 / 6.1 | 90 | intergenic (‑528/+449) | tcyP/USA300HOU_0408 | possible DAACS family dicarboxylate/amino acid:sodium (Na+) or proton (H+) symporter/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/56); new base G (3/2); total (32/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
GCTATGGCGGTTTGATAAAAATTGCTAACCTCATATTTATTGAATGAAAAGATAATAAATGATCAACCTTGAAAAGACGTTTCGAACAAACACGTTGTAAAAAATTCTGTCGAATCAAAATTAGCATCTTTTGAGTGTTCGTGTGTGCAGGTGGTAGTTCAAAAGCTACCGTAAACAAATATTTTTGTTTGAGCAAAAAGGCGTTTGTAGTAAATGTGAATATGAGTGTGCACTTGTGCGATTCGTCAGTTACTAACACAGCCAAACATTTAAATT > CP000730/432984‑433259 | gCTATGGCGGTTTGATAAAAATTGCTAACCTCATATTTATTGAATGAAAAGATAATAAATGATCAACCTTGAAAAGACGTTTCGAACAAACACGTTGTAAAAAATTCTGTCGAATCAAAATTAGCATCTTTTGAGTGTTCg < 1:650502/141‑1 (MQ=255) cTATGGCGGTTTGATAAAAATTGCTAACCTCATATTTATTGAATGAAAAGATAATAAATGATCAACCTTGAAAAGACGTTTCGAACAAACACGTTGTAAAAAATTCTGTCGAATCAAAATTAGCATCTTTTGAGTGTTCgt > 1:398873/1‑141 (MQ=255) tATGGCGGTTTGATAAAAATTGCTAACCTCATATTTATTGAATGAAAAGATAATAAATGATCAACCTTGAAAAGACGTTTCGAACAAACACGTTGTAAAAAATTCTGTCGAATCAAAATTAGCATCTTTTGAGTGTTCgtg < 2:957922/141‑1 (MQ=255) aTGGCGGTTTGATAAAAATTGCTAACCTCATATTTATTGAATGAAAAGATAATAAATGATCAACCTTGAAAAGACGTTTCGAACAAACACGTTGTAAAAAATTCTGTCGAATCAAAATTAGCATCTTTTGAGTGTTCgtgt > 2:236773/1‑141 (MQ=255) 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aGTGTTCGTGTGTGCAGGTGGTAGTTCAAAAGCTACCGTAAACAAATATTTTTGTTTGAGCAAAAAGGCGTTTGTAGTAAATGTGAATATGAGTGTGCACTTGTGCGATTCGTCAGTTACTAACACAGCCAAACATTTaaa < 2:398873/141‑1 (MQ=255) gtgtTCGTGTGTGCAGGTGGTAGTTCAAAAGCTACCGTAAACAAATATTTTTGTTTGAGCAAAAAGGCGTTTGTAGTAAATGTGAATATGAGTGTGCACTTGTGCGATTCGTCAGTTACTAACACAGCCAAACATTTAAAt < 1:884929/141‑1 (MQ=255) tgtTCGTGTGTGCAGGTGGTAGTTCAAAAGCTACCGTAAACAAATATTTTTGTTTGAGCAAAAAGGCGTTTGTAGTAAATGTGAATATGAGTGTGCACTTGTGCGATTCGTCAGTTACTAACACAGCCAAACATTTAAAtt < 1:335217/141‑1 (MQ=255) | GCTATGGCGGTTTGATAAAAATTGCTAACCTCATATTTATTGAATGAAAAGATAATAAATGATCAACCTTGAAAAGACGTTTCGAACAAACACGTTGTAAAAAATTCTGTCGAATCAAAATTAGCATCTTTTGAGTGTTCGTGTGTGCAGGTGGTAGTTCAAAAGCTACCGTAAACAAATATTTTTGTTTGAGCAAAAAGGCGTTTGTAGTAAATGTGAATATGAGTGTGCACTTGTGCGATTCGTCAGTTACTAACACAGCCAAACATTTAAATT > CP000730/432984‑433259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |