| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 604,295 | T→C | 6.7% | intergenic (+88/‑126) | araB → / → USA300HOU_0546 | ribulokinase/possible UDP‑glucose 4‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 604,295 | 0 | T | C | 6.7% | 254.1 / 7.2 | 90 | intergenic (+88/‑126) | araB/USA300HOU_0546 | ribulokinase/possible UDP‑glucose 4‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/43); new base C (3/3); total (44/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 | |||||||||||
CTAATATAATGAAAGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGAAAAAAATTAT > CP000730/604164‑604434 | cTAATATAATGAAAGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAac > 1:1002919/1‑141 (MQ=255) tataATGAAAGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAacatgt < 2:1031377/141‑1 (MQ=255) tataATGAAAGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAacatgt < 2:210335/141‑1 (MQ=255) taATGAAAGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATGTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAacatgtac < 1:853509/141‑1 (MQ=255) gAAAGATATCCAGAGTTAAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAacatgtacatgt > 2:136274/1‑141 (MQ=255) aaaaGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAacatgtacatgt < 1:814822/140‑1 (MQ=255) aaGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCa < 1:607402/141‑1 (MQ=255) aaGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCa > 1:634085/1‑141 (MQ=255) aaGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCa < 1:2035/141‑1 (MQ=255) aaGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCa < 2:831063/141‑1 (MQ=255) aGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCat > 1:383185/1‑141 (MQ=255) aGATATCCAGAGTTTAAGAGCTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATATACGCTATGAATTACTAAAATTAATGAATAGAACTAGAAATTCCATTTAAAAAAATATCAGAAACATGTACATGTCat > 2:136588/1‑141 (MQ=255) tCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAACATCAGCAACATGTACATGTCAtatata > 1:49801/1‑141 (MQ=255) cAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACa > 2:178592/1‑141 (MQ=255) ttAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAACATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAg > 2:736308/1‑141 (MQ=255) tAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAACATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAgc < 2:14674/141‑1 (MQ=255) aaGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGTATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAgcg > 2:898599/1‑141 (MQ=255) gagTTAAGGGATAAGAAATTTAATTTGACAGTAAGTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGCATTTCCAATTACAGATATATCAGCAACATGTACGTGTCATATATACAAGAAAGCGCt < 2:279363/141‑1 (MQ=255) agTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCtt < 2:806249/141‑1 (MQ=255) gTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCttt < 2:1026400/141‑1 (MQ=255) gAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTttat > 2:68895/1‑141 (MQ=255) gggATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTttatat > 2:574097/1‑141 (MQ=255) gATAAATAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATTAATTAATACAATTAGAAGTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATTTACATGTCATATCTACAAGAAAGCGCTTttatatta < 2:557526/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATaa < 1:922304/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATaa > 2:196329/1‑141 (MQ=255) aaaTTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAatta > 1:574455/1‑141 (MQ=255) aaaTTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAatta > 1:134000/1‑141 (MQ=255) atttaatttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAattatt > 1:63021/1‑141 (MQ=255) tttaatttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAAttatta < 2:537417/141‑1 (MQ=255) ttaatttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATtattat > 1:830610/1‑141 (MQ=255) ttaatttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATtattat < 1:943306/141‑1 (MQ=255) ttaatttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAACATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATtattat < 1:421391/141‑1 (MQ=255) atttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaa > 2:547693/1‑141 (MQ=255) atttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaa > 2:930953/1‑141 (MQ=255) tttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATATTTATTATGaaa > 2:309643/1‑141 (MQ=255) tttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaaa < 2:161610/141‑1 (MQ=255) tttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaaa > 2:287874/1‑141 (MQ=255) tttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaaa > 1:862319/1‑141 (MQ=255) ttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATTTATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaaaa < 2:934962/141‑1 (MQ=255) ttGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGaaaa < 1:899099/141‑1 (MQ=255) gACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATg > 1:101099/1‑141 (MQ=255) tAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAatat < 1:551953/141‑1 (MQ=255) aaTTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAAtatt < 1:896757/141‑1 (MQ=255) aaTTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAAtatt > 1:165652/1‑141 (MQ=255) aaTTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAAtatt > 1:761205/1‑141 (MQ=255) tAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATg > 1:116127/1‑141 (MQ=255) aGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAGTTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTATATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATgg < 2:861027/141‑2 (MQ=255) aGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGt > 1:310456/1‑141 (MQ=255) cAATATTAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACATCTCGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGGAAGCGCATGTATATTATAACTATTATGATCATGAATATTATGTcc < 2:165986/141‑1 (MQ=255) cAATAATAAACGATATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTcc < 2:934179/141‑1 (MQ=255) aataatAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCg < 1:693366/141‑1 (MQ=255) ataataAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGc > 2:645453/1‑141 (MQ=255) ataataAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGc > 2:274549/1‑141 (MQ=255) ataataAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGc > 2:274544/1‑141 (MQ=255) taataaACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCt > 1:57087/1‑141 (MQ=255) taataaACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCt < 2:913340/141‑1 (MQ=255) taataaACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCt < 2:199979/141‑1 (MQ=255) aaataaACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCt < 2:782662/140‑1 (MQ=255) aaaCGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCAGCTtgtg > 1:446170/1‑141 (MQ=255) aCGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCATCATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGAt < 2:574455/141‑1 (MQ=255) cGCTAT‑AATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATgg > 1:74471/1‑141 (MQ=255) gCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAACATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGACgg > 1:895829/1‑141 (MQ=255) tataAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGAc < 2:1002919/141‑1 (MQ=255) ataAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTccatcacaagcggaca < 2:334490/141‑15 (MQ=255) aaTTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACtata < 2:266647/141‑1 (MQ=255) ttACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGc < 2:1006574/141‑1 (MQ=255) tAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCtata < 1:1000370/141‑1 (MQ=255) cAATTAATACAACTATAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATagaag < 2:888601/141‑1 (MQ=255) cAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAACATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGACGGACTATAGCTATATagaag < 1:736308/141‑1 (MQ=255) ttAATACGACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAgaga > 1:860197/1‑141 (MQ=255) ttAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAgaga > 2:485833/1‑141 (MQ=255) ttAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAgaga > 1:888949/1‑141 (MQ=255) aaTACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACa > 1:333846/1‑141 (MQ=255) aaCTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAATGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGTCAAAGga < 2:310374/141‑1 (MQ=255) aaCTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGga < 1:168964/141‑1 (MQ=255) aaCTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGga > 2:833550/1‑141 (MQ=255) aaCTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGga < 1:447161/141‑1 (MQ=255) cTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGgaga > 1:599455/1‑141 (MQ=255) aGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGata > 2:513520/1‑141 (MQ=255) ttCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCt > 1:328564/1‑141 (MQ=255) cATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATg < 2:414220/141‑1 (MQ=255) cATTTAAAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATAAACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATg < 1:67323/141‑1 (MQ=255) aTTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGa > 1:211987/1‑141 (MQ=255) aTTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGa < 2:399584/141‑1 (MQ=255) aTTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGa < 1:79873/141‑1 (MQ=255) tttACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGaa > 2:406810/1‑141 (MQ=255) cAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGaaaaaa < 1:404646/141‑1 (MQ=255) cAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGaaaaaa > 1:872365/1‑141 (MQ=255) aaaTATCAGCATCATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGTTATTTCTATGAAAAAAAtt < 2:754059/141‑1 (MQ=255) aaaTATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGAAAAAAAtt < 1:639266/141‑1 (MQ=255) atatCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGAAAAAAATTAt > 1:154164/1‑141 (MQ=255) | CTAATATAATGAAAGATATCCAGAGTTTAAGAGTTGAGGGATAAAAAATTTAATTTGACAGTAATTAGCAATAATAAACGCTATAAATTACTAAAATCAATTAATACAACTAGAATTTCCATTTACAGAAATATCAGCAACATGTACATGTCATATATACAAGAAAGCGCTTTTATATTATAATTATTATGAAAATGAATATTATGTCCGCTTGTGATGGACTATAGCTATATAGAAGAGACAAAGGAGATATTTCTATGAAAAAAATTAT > CP000730/604164‑604434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |