| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 840,445 | C→G | 5.3% | A226A (GCC→GCG) | uvrA → | excision endonuclease subunit UvrA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 840,445 | 0 | C | G | 5.3% | 314.8 / 6.6 | 93 | A226A (GCC→GCG) | uvrA | excision endonuclease subunit UvrA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/45); new base G (2/3); total (45/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGAATCGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTCCTT > CP000730/840305‑840584 | aGAATCGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGcc > 1:620005/1‑141 (MQ=255)aGAATCGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGcc > 1:891407/1‑141 (MQ=255) gAATCGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCt < 1:901727/141‑1 (MQ=255) aTCGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTa < 1:253708/141‑1 (MQ=255) cGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTaga > 1:689322/1‑141 (MQ=255) cGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTaga > 2:286436/1‑141 (MQ=255) cGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTaga > 1:398631/1‑141 (MQ=255) gATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTagag > 1:664778/1‑141 (MQ=255) gATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAAGCAGACAATAGAAGTTTTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTagag < 1:644265/141‑1 (MQ=255) aTGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGc < 1:742248/141‑1 (MQ=255) aTGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGc > 2:490298/1‑141 (MQ=255) aaaTTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAg < 1:1243/141‑1 (MQ=255) ttgttgATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAg > 2:345809/1‑141 (MQ=255) gttgATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGa < 1:429927/141‑1 (MQ=255) tgATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACa > 1:402714/1‑141 (MQ=255) gATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACaa > 2:526388/1‑141 (MQ=255) aTGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAAt < 1:167141/141‑1 (MQ=255) tGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAAtt < 2:758719/141‑1 (MQ=255) tGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAAtt < 1:968961/141‑1 (MQ=255) gTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTa < 1:548614/141‑1 (MQ=255) gTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTa < 2:493567/141‑1 (MQ=255) tAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCGTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTaa < 2:780439/141‑1 (MQ=255) aaaTGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAAc > 2:558447/1‑141 (MQ=255) aaaTGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTCCAGAAGGACAATTAAc > 2:317989/1‑141 (MQ=255) tgTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGa < 2:772806/141‑1 (MQ=255) gTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGAt < 1:471059/141‑1 (MQ=255) aCCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGt > 2:898944/1‑141 (MQ=255) aCCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTCCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGt < 1:783801/141‑1 (MQ=255) aCCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTCGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATgc < 1:1031057/141‑2 (MQ=255) ccTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTc > 1:509105/1‑141 (MQ=255) ccTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTc < 2:664778/141‑1 (MQ=255) ctgcTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCa < 2:86035/138‑1 (MQ=255) aCTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCAtt < 2:161938/141‑1 (MQ=255) ttAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTCGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTCACAGTCGATGTCATTGAc > 2:71772/1‑141 (MQ=255) tAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACg > 2:208134/1‑141 (MQ=255) aTAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACgggg > 2:561160/1‑141 (MQ=255) aTAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACgggg < 1:850784/141‑1 (MQ=255) aTAAGAAAAAAAAAAATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCATAAGGACAATTAACAGNCGATGTCATTGACgggg < 1:733693/141‑1 (MQ=255) tAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGa > 2:970949/1‑141 (MQ=255) tAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGa < 2:145553/141‑1 (MQ=255) tAAGAACAAGAACCATACAATAGAAGTTGTGGTAGACCGAGTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGa < 1:762028/141‑1 (MQ=255) aGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAg < 2:1068383/141‑1 (MQ=255) aGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAg > 2:822383/1‑141 (MQ=255) aGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAg < 1:597298/141‑1 (MQ=255) aCAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGAcc < 1:712744/141‑1 (MQ=255) aaGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCtt < 2:891407/141‑1 (MQ=255) aTCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGt < 2:1045658/141‑1 (MQ=255) cATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACTACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGttt > 1:520473/1‑141 (MQ=255) cATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGttt > 2:844526/1‑141 (MQ=255) cATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGttt > 1:71532/1‑141 (MQ=255) aTACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGtttt < 2:818949/141‑1 (MQ=255) aCAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCa > 2:928707/1‑141 (MQ=255) cAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAg < 2:707630/141‑1 (MQ=255) cAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAg > 2:488653/1‑141 (MQ=255) aGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCa > 2:810671/1‑141 (MQ=255) tgttgtAGACCGATTAGTTGTTAAAGTTGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCGTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTTGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGc > 2:245527/1‑141 (MQ=255) tgttgtAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCGTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTTGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGc > 1:327365/1‑141 (MQ=255) tgttgtAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCGTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTTGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGc < 1:938114/141‑1 (MQ=255) tgtAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTg > 2:846793/1‑141 (MQ=255) gtAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGt < 2:982579/141‑1 (MQ=255) gtAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGt < 1:319460/141‑1 (MQ=255) gtAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGt > 2:578618/1‑141 (MQ=255) ttAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAAAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATAtgt < 1:549376/141‑1 (MQ=255) ttgttAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGAt < 1:1023545/141‑1 (MQ=255) tAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTc < 1:667043/141‑1 (MQ=255) aTGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCg > 1:772520/1‑141 (MQ=255) tGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCgg > 2:79912/1‑141 (MQ=255) gAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGgag > 2:165516/1‑141 (MQ=255) aaaCACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAg < 2:22851/141‑1 (MQ=255) acacGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGaa > 2:165764/1‑141 (MQ=255) cGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCa > 1:368884/1‑141 (MQ=255) cGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCa < 1:25612/141‑1 (MQ=255) gACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCaa < 1:618443/141‑1 (MQ=255) gACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCaa < 1:372022/141‑1 (MQ=255) gACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCaa < 1:235440/141‑1 (MQ=255) aCTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAg < 1:745572/141‑1 (MQ=255) cTAGCTGACTCTATAGAAACTGCGTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTTGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGa < 2:140928/141‑1 (MQ=255) cTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGa > 1:189104/1‑141 (MQ=255) tAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGaa > 1:184358/1‑141 (MQ=255) aGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAAt > 1:797427/1‑141 (MQ=255) gCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGCAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCATATATGTGGATTATCAATCGGAGAGGTAGAACCAAGAATg > 2:16085/1‑141 (MQ=255) gCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATg < 2:937583/141‑1 (MQ=255) gCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATg > 2:292728/1‑141 (MQ=255) tGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGtt < 1:86587/141‑1 (MQ=255) tGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGtt < 1:86947/141‑1 (MQ=255) tctATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGc > 2:184285/1‑141 (MQ=255) tctATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGCGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGc > 1:801627/1‑141 (MQ=255) aGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTaa > 2:915500/1‑141 (MQ=255) gAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAAc > 1:921713/1‑141 (MQ=255) aCTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGt > 1:33277/1‑141 (MQ=255) aCTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGt > 2:357970/1‑141 (MQ=255) aCTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGt < 2:231474/141‑1 (MQ=255) tGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTcc < 2:948869/141‑1 (MQ=255) gCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTCCt > 2:407541/1‑141 (MQ=255) gCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTCCt > 2:623401/1‑141 (MQ=255) ccTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTCCtt > 2:64855/1‑141 (MQ=255) ccTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTCCtt > 2:315984/1‑141 (MQ=255) | AGAATCGATGGCGAAATTGTTGATGTAAATGATGTACCTACTTTAGATAAGAACAAGAATCATACAATAGAAGTTGTTGTAGACCGATTAGTTGTTAAAGATGGAATTGAAACACGACTAGCTGACTCTATAGAAACTGCCTTAGAGCTTTCAGAAGGACAATTAACAGTCGATGTCATTGACGGGGAAGACCTTAAGTTTTCAGAAAGCCATGCTTGTCCTATATGTGGATTTTCAATCGGAGAGTTAGAACCAAGAATGTTTAGCTTTAACAGTCCTT > CP000730/840305‑840584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |