| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 922,773 | 0 | G | A | 5.9% | 317.0 / 5.1 | 101 | E159K (GAA→AAA) | yunD | bifunctional 5‑nucleotidase/2,3‑cyclic phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/52); new base A (3/3); total (46/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TAATATCGTTTCTTCTTATATTAAGGACATAGACGGTGTGAAAATACTATTCGTTGCAGCGACAGCACCTTTTACCCCATTTTATCGTGCACTAAATTGGATTGTTACCGATCCACTTGAATCTATAAAAGAAGAAATTGAACTTCAACGAGGTAAATTTGATGTATTAATCGTGCTAAGTCATTGTGGCATTTTCTTCGATGAAACATTATGCCAAGAATTGCCTGAAATTGATGTCATTTTTGGTAGTCATACGCATCATTATTTTGAACATGGTGAA > CP000730/922634‑922913 | taataTCGTTTCTTCTTATATTAAGGACATAGACGGTGTGAAAATACTATTCGTTGCAGCGACAGCACCTTTTACCCCATTTTATCGTGCACTAAATTGGATTGTTACCGATCCACTTGAATCTATAAAAGAAGAAATTGa < 1:99907/141‑1 (MQ=255)taataTCGTTTCTTCTTATATTAAGGACATAGACGGTGTGAAAATACTATTCGTTGCAGCGACAGCACCTTTTACCCCATTTTATCGTGCACTAAATTGGATTGTTACCGATCCACTTGAATCTATAAAAGAAGAAATTGa < 2:832345/141‑1 (MQ=255)taataTCGTTTCTTCTTATATTAAGGACATAGACGGTGTGAAAATACTATTCGTTGCAGCGACAGCACCTTTTACCCCATTTTATCGTGCACTAAATTGGATTGTTACCGATCCACTTGAATCTATAAAAGAAGAAATTGa < 1:99884/141‑1 (MQ=255) aataTCGTTTCTTCTTATATTAAGGACATAGACGGTGTGAAAATACTATTCGTTGCAGCGACAGCACCTTTTACCCCAGTTTATCGTGCAGTAAATTGGATTGTTACCGATCCACTTGAATCTATAAAAGAAGAAATTGaa < 2:432526/141‑1 (MQ=255) 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TAATATCGTTTCTTCTTATATTAAGGACATAGACGGTGTGAAAATACTATTCGTTGCAGCGACAGCACCTTTTACCCCATTTTATCGTGCACTAAATTGGATTGTTACCGATCCACTTGAATCTATAAAAGAAGAAATTGAACTTCAACGAGGTAAATTTGATGTATTAATCGTGCTAAGTCATTGTGGCATTTTCTTCGATGAAACATTATGCCAAGAATTGCCTGAAATTGATGTCATTTTTGGTAGTCATACGCATCATTATTTTGAACATGGTGAA > CP000730/922634‑922913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |