| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,182,264 | A→T | 6.3% | intergenic (‑283/‑81) | USA300HOU_t0016 ← / → USA300HOU_1112 | tRNA‑Arg/antibacterial protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,182,264 | 0 | A | T | 6.3% | 317.5 / 6.9 | 105 | intergenic (‑283/‑81) | USA300HOU_t0016/USA300HOU_1112 | tRNA‑Arg/antibacterial protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/53); new base T (2/5); total (47/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATTAATAATGATGGC > CP000730/1182124‑1182404 | cTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGa < 2:321588/141‑1 (MQ=255) ttAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGAt < 1:1057742/141‑1 (MQ=255) gtgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGa < 1:993138/141‑1 (MQ=255) gtgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGa < 1:970337/141‑1 (MQ=255) gtgaaaTACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTGAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGCATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGTTAAGCGAAt < 2:946124/138‑1 (MQ=255) gtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAAt < 1:699586/141‑1 (MQ=255) gtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAAt < 2:717401/141‑1 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATa < 1:56516/141‑1 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATa > 2:1025844/1‑141 (MQ=255) tAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATaa < 2:490784/141‑1 (MQ=255) tAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATaa < 2:1082721/141‑1 (MQ=255) aaaTACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAAc < 1:464293/141‑1 (MQ=255) aaaTACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAAc < 1:18122/141‑1 (MQ=255) aTACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAAGAACAt > 1:908355/1‑141 (MQ=255) aGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCg > 1:970933/1‑141 (MQ=255) gTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCgg < 2:13002/141‑1 (MQ=255) ttttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGt < 2:232127/141‑1 (MQ=255) tttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTg > 2:10530/1‑141 (MQ=255) gAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGAtt < 1:125526/141‑1 (MQ=255) gAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGCATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGTTAAGCGAATAACATTTCGGTGAtt < 1:775736/141‑1 (MQ=255) gCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTaaa < 2:82087/141‑1 (MQ=255) caaaaCTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTaaaa > 2:12553/4‑141 (MQ=255) tAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGc < 1:896485/141‑1 (MQ=255) cTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGATAAGTACATTATAAGATGTTGAGCGGATAAACAAACTAATTGTATCCAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACCTTTCGGTGATTTAAAACCTAc > 1:283357/1‑141 (MQ=255) tGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACATTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTTTATCAAATTTATTTTAAAATATCAACAACAAAACTTTGAGCGAATATCGTTTCGGTGATTTAAAAGCTCCg < 2:769121/141‑1 (MQ=255) gTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTACTTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGc > 2:151351/1‑141 (MQ=255) gTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGc < 1:45698/141‑1 (MQ=255) tATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCa > 2:1021057/1‑141 (MQ=255) aTTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTGGTGCTGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATCAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCAc < 2:502482/141‑1 (MQ=255) tctcTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACCAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGt < 2:226741/141‑1 (MQ=255) tctcTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGt > 2:375226/1‑141 (MQ=255) tctTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTa > 1:191822/1‑141 (MQ=255) tttAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTGAGGGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGATGATTTAAAAGCTACGCACGGTTTTGTTATc > 2:103034/1‑141 (MQ=255) tttAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATGTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATc < 2:574735/141‑1 (MQ=255) ttAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCt > 1:24578/1‑141 (MQ=255) tAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCtt > 1:687061/1‑141 (MQ=255) tAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCtt < 2:695196/141‑1 (MQ=255) tAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCtt > 1:800298/1‑141 (MQ=255) aaaaTACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTc < 1:65098/141‑1 (MQ=255) aTACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaa < 1:306392/141‑1 (MQ=255) cAGTTAAGTATAGTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTAGGTGATTTAAAAGCTACGCTCGTTTTTGTTATCTTCaaattt < 2:40848/141‑1 (MQ=255) cAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAGCTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaattt > 1:575182/1‑141 (MQ=255) cAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaattt > 1:300142/1‑141 (MQ=255) cAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaattt > 2:549057/1‑141 (MQ=255) cAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaattt > 2:371798/1‑141 (MQ=255) aGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATGAAAAAAACAACAAGATAAGAGGATATTACATCGGTGTGTTAAAAGGTAAGCACGTTTTTGTTATCTTCaaattta > 1:702677/1‑141 (MQ=255) aaGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaatttaaatt > 2:630142/1‑141 (MQ=255) aaGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCaaatttaaatt > 1:238206/1‑141 (MQ=255) cATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAg > 2:384729/1‑141 (MQ=255) ttATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGa > 2:897747/1‑141 (MQ=255) ataAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAgt > 2:412724/1‑141 (MQ=255) aagaggtagaaagCGGATAATCATACTTATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAgt > 2:54549/13‑141 (MQ=255) taAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAgtg < 1:184958/141‑1 (MQ=255) taAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAgtg < 1:943545/141‑1 (MQ=255) aaGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAgtgt < 2:820458/141‑1 (MQ=255) aaGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAgtgt > 1:719253/1‑141 (MQ=255) gATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGttt < 2:309463/141‑1 (MQ=255) tgttgtGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTc > 1:789554/1‑141 (MQ=255) tgttgtGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTc < 2:612020/141‑1 (MQ=255) tgtgCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAAt < 1:363973/141‑1 (MQ=255) gtgCGGATAAACAAACTACTTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTCTTTGTCATCTTCAAATTTACATTCTAAGGCGTGTTTTccacg > 1:4753/1‑137 (MQ=255) gtgCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATg > 1:128886/1‑141 (MQ=255) tgCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGCGTTTTCAATgg > 2:762497/1‑141 (MQ=255) tgCGGATAAAAAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATgg < 2:956829/141‑1 (MQ=255) tgCAGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATgg < 2:474269/141‑1 (MQ=255) gCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGa > 2:711507/1‑141 (MQ=255) cGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGaa < 1:106948/141‑1 (MQ=255) cGGATAAACAAACTAATTGCATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGTTAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGaa > 2:379831/1‑141 (MQ=255) gATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAgg < 1:570604/141‑1 (MQ=255) gATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAgg < 1:570621/141‑1 (MQ=255) gATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAgg < 1:673901/141‑1 (MQ=255) aaTAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAgg < 2:719474/140‑1 (MQ=255) aacaaacTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACAGTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGttta < 2:845581/141‑1 (MQ=255) cTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAAc > 2:865787/1‑141 (MQ=255) cTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAAc < 2:330065/141‑1 (MQ=255) atGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCATATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCaa < 2:337344/140‑1 (MQ=255) gTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAAtt > 1:1010079/1‑141 (MQ=255) gTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAAtt > 1:340214/1‑141 (MQ=255) gTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAAtt < 1:610710/141‑1 (MQ=255) gTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAAtt > 2:1044309/1‑141 (MQ=255) aTCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTaa > 1:998246/1‑141 (MQ=255) aTCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTaa > 2:673457/1‑141 (MQ=255) cAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGTTAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAg < 1:379831/141‑1 (MQ=255) cAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGTTAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAg < 1:405234/141‑1 (MQ=255) atttatttTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATa > 1:72735/1‑141 (MQ=255) atttatttTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATa > 2:573025/1‑141 (MQ=255) ttatttTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCATATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATAcc < 2:229052/141‑1 (MQ=255) tAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACt < 2:633742/141‑1 (MQ=255) aaaTAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTGACTgc < 2:869538/141‑1 (MQ=255) aTAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTgcag < 2:273073/141‑1 (MQ=255) tAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTgcagc < 1:691690/141‑1 (MQ=255) aacaacaacAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTgcagca < 1:685279/141‑1 (MQ=255) aacaacaacAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTgcagca < 1:267897/141‑1 (MQ=255) acaacaacaAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTCACTGCAGaaa > 1:470853/1‑141 (MQ=255) acaacaacaAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCaa > 1:255367/1‑141 (MQ=255) acaacaaAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATta < 2:1016856/141‑1 (MQ=255) acaacaaAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATta < 2:1016830/141‑1 (MQ=255) acaacaaAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATta > 2:335148/1‑141 (MQ=255) aacaaAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATtaat < 2:575182/141‑1 (MQ=255) aTAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATTAATAATGATGgc > 2:195421/1‑141 (MQ=255) | CTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAACAAAACGATAAGCGAATAACATTTCGGTGATTTAAAAGCTACGCACGTTTTTGTTATCTTCAAATTTAAATTTTAAGGAGTGTTTTCAATGGAAGGTTTATTTAACGCAATTAAAGATACCGTAACTGCAGCAATTAATAATGATGGC > CP000730/1182124‑1182404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |