| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,319,376 | A→G | 7.5% | I504V (ATA→GTA) | miaB → | 2‑methylthioadenine synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,319,376 | 0 | A | G | 7.5% | 223.4 / 7.9 | 80 | I504V (ATA→GTA) | miaB | 2‑methylthioadenine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/34); new base G (2/4); total (42/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
GTAAAAAAGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGCACAGATT > CP000730/1319236‑1319513 | gtaAAAAAGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTta < 2:80523/141‑1 (MQ=255)gtaAAAAAGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTta > 2:804174/1‑141 (MQ=255) taAAAAAGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTtat > 2:353031/1‑141 (MQ=255) taAAAAAGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTtat < 1:682623/141‑1 (MQ=255) aaaaaGATGATCAGGTTCTTACTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATaa > 1:193474/1‑141 (MQ=255) aaaaGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATaaa < 1:244927/141‑1 (MQ=255) aaGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAgg < 1:980298/141‑1 (MQ=255) aGATTATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGa < 1:761694/141‑1 (MQ=255) aGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGa < 2:1008511/141‑1 (MQ=255) aGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGa < 2:600727/141‑1 (MQ=255) atgatCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAg < 1:360342/141‑1 (MQ=255) atgaGGTTCTTGCTGGATACACTGATAAAAATACGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGCTTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTACGTGGCAGTTTTATAAAGGAAGTag > 2:539793/4‑141 (MQ=255) tCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTATTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTaga > 2:951486/1‑141 (MQ=255) tCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTaga > 2:762771/1‑141 (MQ=255) cAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCACCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTGTAAAGGAAGTagag < 1:79350/141‑1 (MQ=255) gTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCg > 1:412653/1‑141 (MQ=255) gTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCg < 1:714684/141‑1 (MQ=255) gTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCg < 2:510407/141‑1 (MQ=255) tacTTGCTGGCTACCCTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTGCAACGCGCCTAAAGGAATGATTGGTAAACCAGTGGAAGTACGAAGAGATGAAGCTAATCAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCgg < 1:586059/139‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCACCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTGTAAAGGAAGTAGAGCCGGaa < 1:370962/141‑1 (MQ=255) cTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATgg > 1:49060/1‑141 (MQ=255) ggatACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTg < 2:956104/138‑1 (MQ=255) ggCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTg > 2:496520/1‑141 (MQ=255) ggCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTg > 2:154607/1‑141 (MQ=255) gCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCACCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTGTAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGa < 1:350889/141‑1 (MQ=255) cTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGAt < 2:400854/141‑1 (MQ=255) acacTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTc > 2:407773/1‑141 (MQ=255) tAAGCTTGTTAATTGCAAAGCGCCTAACGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACAAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTataa < 1:309551/141‑1 (MQ=255) tAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTataa > 2:544610/1‑141 (MQ=255) aGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTataata > 1:767455/1‑141 (MQ=255) aGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTataata > 1:181428/1‑141 (MQ=255) aGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGa > 1:620435/1‑141 (MQ=255) aGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGa > 1:14245/1‑141 (MQ=255) tAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGa < 1:936790/141‑1 (MQ=255) aaTTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGCACCTAAACAGTATGCATTAAATGGCAGTCTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGAc < 1:757945/141‑1 (MQ=255) tccaaGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATACAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACgtgt < 2:505966/138‑1 (MQ=255) tCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACgtgt < 2:498977/141‑1 (MQ=255) cAAAGCGACTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGTAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGtt < 2:998486/141‑1 (MQ=255) aaaGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTg > 2:109726/1‑141 (MQ=255) aaGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGa > 2:1039715/1‑141 (MQ=255) aaGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGa > 2:421261/1‑141 (MQ=255) gcaccTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTGTAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGaaa < 2:315119/138‑2 (MQ=255) cgcCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAAcc > 2:461850/1‑141 (MQ=255) gcCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCa > 2:363625/1‑141 (MQ=255) cTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAg < 1:464863/141‑1 (MQ=255) cTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAg > 1:60790/1‑141 (MQ=255) tAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGc < 1:965944/141‑1 (MQ=255) aaaGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCg > 1:822711/1‑141 (MQ=255) aGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGa < 2:520086/141‑1 (MQ=255) gAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGat < 1:1013493/141‑1 (MQ=255) tGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGataata > 2:491875/1‑141 (MQ=255) gATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAatat > 1:735240/1‑141 (MQ=255) aTTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTGTAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAAACAAGCGGATAATAtt > 1:418326/1‑141 (MQ=255) tAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCaaa < 2:761034/141‑1 (MQ=255) aGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAAt < 1:501735/141‑1 (MQ=255) tGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTa > 2:349476/1‑141 (MQ=255) ggAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTaa > 2:371557/1‑141 (MQ=255) aGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTaaaaa > 2:1022211/1‑141 (MQ=255) gTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAAt < 1:1071865/141‑1 (MQ=255) aCGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTAATAAAAAGAAAGTATTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAAGGGGGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAGCCAAGCGTATAATATTGAAAAAAAAAAAAAAAAttt < 2:842821/141‑1 (MQ=255) cGAATAGATTAAGCTAAAAAGTATTCATTAAATGGCAGGTTTAGAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTAAACCAAGCGGATAATAATGCAAATAAAATTAAAAATTTg > 2:298358/1‑141 (MQ=255) aaTAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAAT‑AAATTAAAAATTTGGAt > 2:478574/1‑141 (MQ=255) aTAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAAAAAAAATAAAAATTTGGAt < 2:84533/141‑1 (MQ=255) tAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATa > 2:516028/1‑141 (MQ=255) gATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACt > 2:530657/1‑141 (MQ=255) aTGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTa < 2:757790/141‑1 (MQ=255) aaGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCa > 1:198634/1‑141 (MQ=255) cAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTGTAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAAACAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACatat > 2:755838/1‑141 (MQ=255) cAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACatat > 2:391919/1‑141 (MQ=255) cAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACataa > 1:513138/1‑140 (MQ=255) tATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATcaa < 1:849460/141‑1 (MQ=255) gaTTCATTAGATGGCAGTTTTATGAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAGCCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAAGTTGGATACTATCAAAACATATcaa < 2:756427/140‑1 (MQ=255) aTTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATcaac < 2:904103/141‑1 (MQ=255) ttCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATcaaca > 2:22550/1‑141 (MQ=255) tCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATcaacaa > 1:420083/1‑141 (MQ=255) aTTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAAt < 1:851220/141‑1 (MQ=255) ttAAATGGCAGGTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTAGAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAAtt > 2:377869/1‑141 (MQ=255) aTGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAg < 1:459968/141‑1 (MQ=255) tGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGc > 2:163650/1‑141 (MQ=255) tGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGc < 2:205590/141‑1 (MQ=255) cAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGcaca > 1:303952/1‑141 (MQ=255) aGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGCACAg > 2:327915/1‑141 (MQ=255) aGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGCACAg > 2:717502/1‑141 (MQ=255) tttATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGCACAGAtt < 2:487096/141‑1 (MQ=255) | GTAAAAAAGATGATCAGGTTCTTGCTGGCTACACTGATAAAAATAAGCTAGTTAATTTCAAAGCGCCTAAAGAAATGATTGGTAAACTAGTGGAAGTACGAATAGATGAAGCTAAACAGTATTCATTAAATGGCAGTTTTATAAAGGAAGTAGAGCCGGAAATGGTGATTCAATAAATGTATAATAAAGATGACGTGTTGAACCAAGCGGATAATATTGCAAATAAAATTAAAAATTTGGATACTATCAAAACATATCAACAAATTGAAGCACAGATT > CP000730/1319236‑1319513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |