| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,615,309 | A→T | 6.4% | intergenic (‑39/+10) | xerD ← / ← fur | integrase/recombinase XerD/Fur family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,615,309 | 0 | A | T | 6.4% | 244.5 / 7.7 | 78 | intergenic (‑39/+10) | xerD/fur | integrase/recombinase XerD/Fur family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/28); new base T (3/2); total (48/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
TTGATACTTTTTCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCGATT > CP000730/1615169‑1615445 | ttGATACTTTTTCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTa < 2:755269/141‑1 (MQ=255)ttGATACTTTTTCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTa < 1:621293/141‑1 (MQ=255)ttGATACTTTTACAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGAATTATAACTTAGTCCTTTTTAAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATATTTTCCACAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTa < 2:765858/141‑1 (MQ=255) aCTTTTTCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCaa < 2:407118/141‑1 (MQ=255) aCTTTTTCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCaa < 1:974470/141‑1 (MQ=255) tttttCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGTAGGTTAAATTAACCTTCGctttt < 1:326991/141‑5 (MQ=255) tttttCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGTAGGTTAAATTAACCTTCGctttt < 1:327071/141‑5 (MQ=255) tCAAATCACGTTTATAAGAACCAATTGAGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAACCGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCACTAAAAAAAGCGAAGGTTCATTTAACCTACGCAATTTACt < 2:107184/141‑1 (MQ=255) tCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACt < 2:519610/141‑1 (MQ=255) aaTCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATc > 2:368025/1‑141 (MQ=255) aaTCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATc > 1:513002/1‑141 (MQ=255) aTCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTCTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATCGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATcc < 2:1072756/141‑1 (MQ=255) tCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATcct > 1:393123/1‑141 (MQ=255) cACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATcctt > 1:1052434/1‑141 (MQ=255) cTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTatttattaaatttg > 2:80877/1‑128 (MQ=255) cTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATcctttacct > 1:663145/1‑141 (MQ=255) ataAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATcctttaccttt > 1:50721/1‑141 (MQ=255) aGCACCAAGTGTGTTCGAACTTGGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGc < 2:1080048/141‑1 (MQ=255) cACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCtt < 1:481356/141‑1 (MQ=255) ccAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTgg > 1:759120/1‑141 (MQ=255) ccAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTgg > 1:441928/1‑141 (MQ=255) cAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGc < 2:107621/141‑1 (MQ=255) cAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGc < 1:156246/141‑1 (MQ=255) tgtgTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGt > 1:491792/1‑141 (MQ=255) tgtTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAAGGTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGttt > 1:342490/1‑141 (MQ=255) gtTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTc > 2:495142/1‑141 (MQ=255) ttAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTca < 1:402990/141‑1 (MQ=255) aGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTcaca < 1:83780/141‑1 (MQ=255) aGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCATGTTTCACACACACCa < 2:767269/141‑1 (MQ=255) cTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGa < 2:634852/141‑1 (MQ=255) tttCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAg > 1:622086/1‑141 (MQ=255) cAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTa < 1:309200/141‑1 (MQ=255) aaTTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTaa > 1:190549/1‑141 (MQ=255) tttGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAAc > 2:205463/1‑141 (MQ=255) tttGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTCGCACGTTTCACACACCCCATGGAAAGTTAAAc > 2:567532/1‑141 (MQ=255) tGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACga > 2:1035876/1‑141 (MQ=255) atatTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAAtttt < 2:783893/141‑1 (MQ=255) tatTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTa > 1:419139/1‑141 (MQ=255) atTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTaa > 1:1055293/1‑141 (MQ=255) atTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTaa > 2:916568/1‑141 (MQ=255) ttcttcAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTaaa > 2:453519/1‑141 (MQ=255) cttcAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAAt > 2:431087/1‑141 (MQ=255) tcAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTg > 1:839824/1‑141 (MQ=255) tGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCAtt > 1:222461/1‑141 (MQ=255) gTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCAttt > 2:870673/1‑141 (MQ=255) gTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACC‑TTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCAtttt < 2:513002/141‑1 (MQ=255) tttCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCAtttt > 1:116833/1‑141 (MQ=255) tttCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCAtttt > 1:36288/1‑141 (MQ=255) ccATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCaa > 1:24035/1‑141 (MQ=255) ccATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCaa > 2:926889/1‑141 (MQ=255) cATAACCACACCTCTACACAAAGCGGAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAAc < 2:342015/141‑1 (MQ=255) cATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAAc > 2:1007676/1‑141 (MQ=255) tAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTc < 1:872659/141‑1 (MQ=255) acacCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGAttt < 2:740135/141‑1 (MQ=255) cacCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAGCTCGAtttt < 1:953871/141‑1 (MQ=255) cacCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGAtttt < 2:912390/141‑1 (MQ=255) acCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTc < 2:692295/141‑1 (MQ=255) tctAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACt < 1:355657/130‑1 (MQ=255) tctAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACt > 2:355657/1‑130 (MQ=255) tctAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAAc < 1:1044979/141‑1 (MQ=255) ctAAACAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACt < 1:908555/141‑1 (MQ=255) aaaaaaaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTc < 1:295381/141‑1 (MQ=255) aaaaaaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCACCTCGATTTTCAACTTCt > 1:363160/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCt > 1:544423/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCt > 1:737503/1‑141 (MQ=255) aaaaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTgg > 2:763573/1‑141 (MQ=255) aaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTa > 2:722374/1‑141 (MQ=255) aaGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTa > 1:614851/1‑141 (MQ=255) gCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAAc > 2:623644/1‑141 (MQ=255) cGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACa < 1:828997/141‑1 (MQ=255) taGGTTAAATTAACCTTCGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACaaa > 1:681737/2‑141 (MQ=255) aaGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACaaa > 1:601829/1‑141 (MQ=255) ggTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATc > 2:234170/1‑141 (MQ=255) aaattAACCTTCGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCa > 1:360778/4‑141 (MQ=255) aaTTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCATCTTCTGTTAACAAATCTTCa > 2:860915/1‑141 (MQ=255) aTTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCAt < 2:739027/141‑1 (MQ=255) ttAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCg > 1:212891/1‑141 (MQ=255) aCCTTCGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCGAtt > 1:149688/1‑141 (MQ=255) aCCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCGAtt > 1:612963/1‑141 (MQ=255) aCCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCGAtt > 1:1080806/1‑141 (MQ=255) aCCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCGAtt > 2:956849/1‑141 (MQ=255) | TTGATACTTTTTCAAATCACGTCTATAAGCACCAATTGTGTTAGAACTTAGTCCTTTTTCAATTTGTATAAAACGCAAATATTCTTCAATAATTGTTTCCATAACCACACCTCTAAAAAAAGCGAAGGTTAATTTAACCTACGCAATTTACTATCCTTTACCTTTAGCTTGGCACGTTTCACACACACCATGGAAAGTTAAACGATGATCTAAAATTTTAAAATTGAACTCATTTTCAACTCGATTTTCAACTTCTGGTAACAAATCTTCATCGATT > CP000730/1615169‑1615445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |