| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,749,170 | T→A | 5.1% | V93V (GTA→GTT) | secDF ← | RND superfamily resistance‑nodulation‑cell division protein:proton (H+) antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,749,170 | 0 | T | A | 5.1% | 241.2 / 4.9 | 79 | V93V (GTA→GTT) | secDF | RND superfamily resistance‑nodulation‑cell division protein:proton (H+) antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/27); new base A (2/2); total (50/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
TAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTG > CP000730/1749031‑1749310 | tAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTa > 2:825166/1‑141 (MQ=255)tAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTa > 2:402253/1‑141 (MQ=255) aTTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGAGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTActc > 2:316844/1‑141 (MQ=255) cTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTaa < 1:495664/141‑1 (MQ=255) ggCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTAtt < 2:331746/141‑1 (MQ=255) cAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAACTCTATTAg > 2:888523/1‑141 (MQ=255) aGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTCTTAgg > 2:304788/1‑141 (MQ=255) tGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGACCTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTCTTACACCAGCAAGTTTTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCa > 1:255223/1‑141 (MQ=255) tttAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAAc < 2:57690/141‑1 (MQ=255) ttAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACt < 2:922762/141‑1 (MQ=255) atatCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGa > 2:757450/1‑141 (MQ=255) atCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAAt > 2:773356/1‑141 (MQ=255) atCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAAt > 1:763892/1‑141 (MQ=255) atCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACATGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAAt < 2:324112/141‑1 (MQ=255) aCCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAgg > 2:464904/1‑141 (MQ=255) ccGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGt > 2:378058/1‑141 (MQ=255) cGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGtt < 2:975470/141‑1 (MQ=255) ttACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAacac < 2:602168/141‑1 (MQ=255) tACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACAcc < 2:596704/141‑1 (MQ=255) aCTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCt > 1:379273/1‑141 (MQ=255) cTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTa > 1:480596/1‑141 (MQ=255) tcttctGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACg < 2:108927/141‑1 (MQ=255) tcttctGCATCGCGAATTGTTAAATCAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGGTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACg > 1:183109/1‑141 (MQ=255) ctGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTaa > 2:76910/1‑141 (MQ=255) cATCGCGAATTGTTAAAGTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAacac > 2:248540/1‑141 (MQ=255) gcgAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAACACGTTAACCCGCtt > 2:596468/1‑141 (MQ=255) gcgAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGAtt < 1:281707/141‑1 (MQ=255) cgAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGAttt > 1:894435/1‑141 (MQ=255) aTTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCt < 1:1053589/141‑1 (MQ=255) aTTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCt > 1:291624/1‑141 (MQ=255) ttGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTa > 1:398173/1‑141 (MQ=255) ttGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTa > 1:396400/1‑141 (MQ=255) ttGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTa < 1:1065321/141‑1 (MQ=255) ttGTTAAATTAGCTGGCGAAGATAAACTTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACGCCAGCAGGTTGTACTCTAATTCTAGTAGGCTCTTCAACTTGAATGTTAGGTTCCGACACACCAAAACCATTAccacactttcggg > 2:91866/1‑132 (MQ=255) tGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTaa > 2:1057293/1‑141 (MQ=255) gTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAACCGTTAACACGATTTTTTAAt > 2:856384/1‑141 (MQ=255) ttAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATg > 1:870342/1‑141 (MQ=255) tAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACAAGATTTTCTAATGt > 1:710075/1‑141 (MQ=255) cTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTCATCTCTGCGCtt > 2:585565/1‑140 (MQ=255) agaagaTAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGa > 1:151016/1‑141 (MQ=255) agaTAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTg < 1:204456/141‑1 (MQ=255) gaTAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGt > 1:837654/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTaa < 1:885622/141‑1 (MQ=255) aaTTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGc < 1:1049709/141‑1 (MQ=255) aTTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCt > 2:361687/1‑141 (MQ=255) aTTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCt < 1:645823/141‑1 (MQ=255) ttttACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtt > 1:578311/1‑141 (MQ=255) tttACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCttt > 2:111272/1‑141 (MQ=255) ttACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtttt > 2:688797/1‑141 (MQ=255) ttACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtttt > 1:751912/1‑141 (MQ=255) ttACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtttt < 1:1608/141‑1 (MQ=255) ttACGGGCTTCATTCGGGCCTGTTACACCAGCAAGTTTTACTCTAATTCTGGCAGGGTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCGTTTGATTGTATGGCtttt > 2:918409/1‑141 (MQ=255) aCGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtttttt > 1:418137/1‑141 (MQ=255) aCGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtttttt < 2:717230/141‑1 (MQ=255) aCGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCtttttt > 2:100941/1‑141 (MQ=255) cGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCttttttt > 2:878681/1‑140 (MQ=255) cGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTa < 2:705276/141‑1 (MQ=255) cTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTa > 2:717504/1‑141 (MQ=255) cTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTa > 2:717575/1‑141 (MQ=255) tCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTAtt < 1:86919/141‑1 (MQ=255) tGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTTTCTTTTTTGTCg > 2:624506/1‑141 (MQ=255) tGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCg > 1:100160/1‑141 (MQ=255) ggTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGc < 2:905647/141‑1 (MQ=255) ggTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGtt > 2:230956/1‑42 (MQ=255) ggTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGtt < 1:230956/42‑1 (MQ=255) gTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGcc > 2:820681/1‑141 (MQ=255) tCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCt < 2:713022/141‑1 (MQ=255) cTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCtt < 1:367065/141‑1 (MQ=255) cTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTGCCTAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCtt < 1:43169/141‑1 (MQ=255) tGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCttt > 1:264854/1‑141 (MQ=255) tACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACt > 2:399016/1‑43 (MQ=255) tACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACt < 1:399016/43‑1 (MQ=255) acacCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCtttattt > 1:306908/1‑141 (MQ=255) aGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAgg > 1:963356/1‑141 (MQ=255) aGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAAATTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAgg < 1:802365/141‑1 (MQ=255) ttGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGAc > 2:735250/1‑141 (MQ=255) ttGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGAc > 1:165217/1‑141 (MQ=255) tGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACt < 1:825166/141‑1 (MQ=255) tGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACt < 2:379273/141‑1 (MQ=255) tACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTg < 1:757450/141‑1 (MQ=255) | TAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTG > CP000730/1749031‑1749310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |