| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,079,751 | C→T | 5.0% | Q139Q (CAG→CAA) | bcrA ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,079,751 | 0 | C | T | 5.0% | 249.6 / 2.0 | 79 | Q139Q (CAG→CAA) | bcrA | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/42); new base T (2/2); total (35/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 | |||||||||||
AATAAAACCAGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCCTCTAATTG > CP000730/2079614‑2079890 | aaTAAAACCAGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGc > 2:678563/1‑141 (MQ=255) agaaaaCCAGTGACGAATCCTTGAGGAACGTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTGAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCACAAATGAACGTTAAAATATCCTGCa < 2:1042892/139‑1 (MQ=255) aTAAACGCAGTGAAGAATCCTTGAGGAACTTTGAGAGAGTTATTCTTTAAATTAAACTGATCACTGGAATAATTAACCTTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCa < 2:1042859/141‑1 (MQ=255) aTAAAACCAGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCa < 1:341946/141‑1 (MQ=255) aCCAGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTcc < 1:113359/141‑1 (MQ=255) ccAGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCt < 2:427480/141‑1 (MQ=255) aGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCa > 1:745251/1‑141 (MQ=255) aGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCa > 2:19651/1‑141 (MQ=255) gTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCaa > 1:404734/1‑141 (MQ=255) tGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAg < 2:717857/141‑1 (MQ=255) gACGAGTCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCGTCAAgg > 1:1042496/1‑140 (MQ=255) gACGAGTCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGt > 1:616056/1‑141 (MQ=255) aCGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTg < 1:687002/141‑1 (MQ=255) aTCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACAt > 2:851968/1‑141 (MQ=255) ccTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACAttt < 1:62712/141‑1 (MQ=255) ccTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACAttt > 2:906261/1‑141 (MQ=255) cTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTc > 2:557385/1‑141 (MQ=255) cTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTc < 2:179717/141‑1 (MQ=255) gAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGAt < 2:722315/141‑1 (MQ=255) ggAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCGTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATgg < 1:316556/141‑1 (MQ=255) ggAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATgg < 1:402578/141‑1 (MQ=255) gacccttGACAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGc < 1:1042753/136‑1 (MQ=255) tttGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTgc < 2:4650/141‑1 (MQ=255) tttGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTgc > 1:172333/1‑141 (MQ=255) tGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTgcgc < 2:172333/141‑1 (MQ=255) aaGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTc > 2:1076658/1‑141 (MQ=255) gagaTATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCTTGAAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCAt < 2:226457/141‑1 (MQ=255) gagaTATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCAt < 2:960770/141‑1 (MQ=255) gaTATTCTTTAAATTAATCTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTa < 2:338143/141‑1 (MQ=255) gaTATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTa < 1:342908/141‑1 (MQ=255) atTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAAcc > 2:570854/1‑141 (MQ=255) atTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGAATTCATGTTGATTCCTCCTCAGTAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAAca < 1:758305/141‑2 (MQ=255) tCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCaa > 2:579147/1‑141 (MQ=255) aaattaaaCTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCtt > 2:176457/1‑141 (MQ=255) attaaaCTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTa < 2:346909/141‑1 (MQ=255) attaaaCTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAAATGTTTa > 1:500942/1‑141 (MQ=255) aaCTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCa < 1:912090/141‑1 (MQ=255) aaCTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCa > 2:671634/1‑141 (MQ=255) tGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCTTGAAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAAt > 1:992926/1‑141 (MQ=255) cTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCaa > 1:286337/1‑141 (MQ=255) ttGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCTTGAAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAAt > 1:332064/1‑141 (MQ=255) tGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATg > 1:1112/1‑141 (MQ=255) gAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCTTGAAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATgg < 1:969625/141‑1 (MQ=255) gAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATgg < 2:719739/141‑1 (MQ=255) aataatTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGt < 2:998111/141‑1 (MQ=255) aataatTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGt < 1:223695/141‑1 (MQ=255) tatTAACAGTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAGCCAAACGTTCAATGGTaaa < 2:827418/140‑1 (MQ=255) atTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTaaaa > 2:528102/1‑141 (MQ=255) atTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTACTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTaaaa > 2:519671/1‑141 (MQ=255) aCATTACTTAATTCTATTGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCTATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAAtt < 1:396261/141‑1 (MQ=255) cATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTg < 1:318382/141‑1 (MQ=255) gcTTACTTCTATGGCCTACATGGTGATCCCTCCTGATAGATGAACGTTAAAATACCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTCACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTtc < 2:83789/140‑1 (MQ=255) cTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTtct < 1:162415/141‑1 (MQ=255) cTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTtct > 1:79516/1‑141 (MQ=255) tAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTctct < 2:114435/141‑1 (MQ=255) aaTTTTATGGGATTCATGATGATGTGTCATCGTAGATGGAGATTAAAATATCCTTCTAGACCTCAATTGACATTGCGCTGGCTTGCACCGCATTGACCAATTCTCTAACCAAGTTTTCAATGGTAAAAAATTGTGGCTCtt < 2:915836/141‑1 (MQ=255) aTTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCttt < 1:305658/141‑1 (MQ=255) ttCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCtttt > 2:773230/1‑141 (MQ=255) ttCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCtttt < 2:673827/141‑1 (MQ=255) aTGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTaaaa > 2:510433/1‑141 (MQ=255) aTGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTaaaa > 2:1086008/1‑141 (MQ=255) tGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAAt > 2:944933/1‑141 (MQ=255) tGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAAt > 1:849378/1‑141 (MQ=255) aTTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGaa > 1:84932/1‑141 (MQ=255) tCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTTTTTTAAAATAGAACt > 1:332625/1‑141 (MQ=255) cATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTa > 2:399618/1‑141 (MQ=255) tgatgaTTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATc < 1:76036/141‑1 (MQ=255) atgatTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATATTCAATAGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCtt < 2:438707/141‑1 (MQ=255) tgatTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTg > 2:242112/1‑141 (MQ=255) ttCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTc < 1:949821/141‑1 (MQ=255) tGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTcc < 2:152849/141‑1 (MQ=255) gAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTccc > 1:31956/1‑141 (MQ=255) aaCGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCt > 2:1046377/1‑141 (MQ=255) aaCGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCt > 1:45457/1‑141 (MQ=255) cGTTAAAATATCCTGCAGCTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCttt < 1:9166/141‑1 (MQ=255) aaaaTATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCACTTCCTATACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCct < 1:19651/141‑1 (MQ=255) aaaaTATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCct < 1:1044596/141‑1 (MQ=255) aaaTATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCctc < 2:984064/141‑1 (MQ=255) tCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCCTCTAAtt < 1:348487/141‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCCTCTAAttg > 2:408969/1‑141 (MQ=255) | AATAAAACCAGTGACGAATCCTTGAGGAACTTTGAAAGAGATATTCTTTAAATTAAACTGATCACTTGAATAATTAACATTACTTAATTCTATGGCATTCATGATGATTCCTCCTCATAAATGAACGTTAAAATATCCTGCAGTTCCTCAAGTGACATTTCGATGGCTTGCGCTTCATTAACCAATTCTTTAACCAAATTTTCAATGGTAAAAAATTGTTTCTCTTTTAAAATAGAACTATCTTGCTCCTTAACAAAGGTCCCTTTTCCTCTAATTG > CP000730/2079614‑2079890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |