| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,284,721 | T→G | 5.3% | intergenic (+6389/+1643) | mtlD → / ← glmM | mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase/phosphoglucosamine mutase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,284,721 | 0 | T | G | 5.3% | 362.1 / 8.5 | 117 | intergenic (+6389/+1643) | mtlD/glmM | mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase/phosphoglucosamine mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/59); new base G (4/3); total (55/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AATATTTTTAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCTTTTA > CP000730/2284582‑2284859 | aaTATTTTTAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGACGTTGTGACACTTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCGtt > 2:598617/1‑141 (MQ=255) tttttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGa > 1:850791/1‑141 (MQ=255) tttttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGa > 2:92095/1‑141 (MQ=255) tttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATc < 1:604712/141‑1 (MQ=255) tttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATc > 2:390154/1‑141 (MQ=255) ttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCa < 1:1000359/141‑1 (MQ=255) ttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCa < 2:868783/141‑1 (MQ=255) ttAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCa < 2:277536/141‑1 (MQ=255) aGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATa > 1:785520/1‑141 (MQ=255) gtATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTAACACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGCCACTTTATTTGCCTTTTGATTATAATTa > 2:467963/1‑141 (MQ=255) tCGATATTCGCAACATTAACTTGATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACa < 1:282746/141‑1 (MQ=255) aatTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCa > 1:1030789/2‑141 (MQ=255) atTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCat < 1:508153/141‑1 (MQ=255) atTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCat < 1:508050/141‑1 (MQ=255) atTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCat < 2:559444/141‑1 (MQ=255) atTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCat < 2:933366/141‑1 (MQ=255) tCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCatat > 1:504271/1‑141 (MQ=255) gCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTCTCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATAttt > 2:1062110/1‑141 (MQ=255) gCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATAttt < 2:1013050/141‑1 (MQ=255) cAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATAtttt < 1:1016348/141‑1 (MQ=255) cAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATAtttt > 2:1040057/1‑141 (MQ=255) cAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATAtttt > 2:50903/1‑141 (MQ=255) cATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCa < 1:922952/141‑1 (MQ=255) aTTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCaa < 2:748175/141‑1 (MQ=255) aCTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtact > 2:877010/1‑141 (MQ=255) tttATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgt < 1:967865/141‑1 (MQ=255) tataTGATAATTTTAAAGATTTATCTAGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtac > 2:123596/1‑141 (MQ=255) atatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATAtttttttttttttttct > 2:443998/1‑129 (MQ=255) atatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtact > 2:553997/1‑141 (MQ=255) atatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtact > 1:396652/1‑141 (MQ=255) atatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtact < 2:721759/141‑1 (MQ=255) atatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACGTCTGTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtact > 2:919372/1‑141 (MQ=255) tatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtactg < 2:15783/141‑1 (MQ=255) tatGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAAtactgtactg < 1:1040057/141‑1 (MQ=255) aTAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACGTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCtt > 2:500391/1‑141 (MQ=255) aaTTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCa < 1:1042766/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCAtt < 1:579442/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCAtt < 2:358077/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCAtt < 2:79690/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCAtt < 2:134157/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTATTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCAtt < 2:126620/141‑1 (MQ=255) tttAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTa > 1:140829/1‑141 (MQ=255) aaaGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCa > 1:330771/1‑141 (MQ=255) aaGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCGCGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCAt > 2:934557/1‑141 (MQ=255) aaGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCAt > 1:619528/1‑141 (MQ=255) aaGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCAt > 1:738332/1‑141 (MQ=255) aaGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCAt > 1:708827/1‑141 (MQ=255) gttttattcccagaTAAATCTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATCTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTa > 2:262758/14‑141 (MQ=255) gATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTa < 2:1023130/141‑1 (MQ=255) aTTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAg < 2:954858/141‑1 (MQ=255) aTTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAg < 2:485304/141‑1 (MQ=255) tttATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCAGTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCAttccctaatgg < 1:558634/141‑10 (MQ=255) ttATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAggg < 1:923562/141‑1 (MQ=255) ttATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAggg < 2:357769/141‑1 (MQ=255) ttATCTGGGAAAAAAACTGCTTTAGTGTGAGTACAACGTGCCGGTGTGACATCTTGTCGGGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATCTTTATCAATACTTTACAGTCGTCAGTACGATTAggg > 2:648250/1‑141 (MQ=255) aTCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGTTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGaa < 1:237376/141‑1 (MQ=255) aTCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGaa < 2:174361/141‑1 (MQ=255) tGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAAtgt < 2:383555/141‑1 (MQ=255) tGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAAtgt < 2:1077261/141‑1 (MQ=255) aaaaCTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGtt < 2:785520/141‑1 (MQ=255) aaCTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTaa > 2:371526/1‑141 (MQ=255) gtgtgtgtACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAAttatta > 2:203126/1‑141 (MQ=255) tgtgtACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACg < 1:33440/141‑1 (MQ=255) gtgtACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGt < 2:864100/141‑1 (MQ=255) gtACCACGTGCCTCTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTaa > 2:496382/1‑141 (MQ=255) aCCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGt < 2:467937/141‑1 (MQ=255) ccACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGtt > 2:797738/1‑141 (MQ=255) ccACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGtt < 2:774077/141‑1 (MQ=255) ccACGTGCCGTTATCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATATTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGtt > 2:837953/1‑141 (MQ=255) aCGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTac > 2:571489/1‑141 (MQ=255) aCGTGCAGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTATCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTac > 2:85459/1‑141 (MQ=255) cGTGCCGGTGACGCACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTATGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTaca > 2:282908/1‑141 (MQ=255) gCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCt > 2:880744/1‑141 (MQ=255) gCCGATGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGATGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCt > 1:1004996/1‑141 (MQ=255) gTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTCACTTTATTTGCATTTTGATAATAATTAACAGTCATATTTATCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTtgt < 1:169200/141‑1 (MQ=255) gTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTtgt > 2:192832/1‑141 (MQ=255) cacaCCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTaa < 2:195490/141‑1 (MQ=255) ccTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGtt < 2:248508/141‑1 (MQ=255) ggCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACtt > 2:316200/1‑141 (MQ=255) gCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGt > 2:675730/1‑117 (MQ=255) gCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGt < 1:675730/117‑1 (MQ=255) tGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTaaa > 1:110561/1‑141 (MQ=255) tGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATAAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTaaa < 2:581096/141‑1 (MQ=255) gTAACTTTATTTGCAGTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATCATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAAt > 1:965894/1‑141 (MQ=255) tAACTTTATTTGCATCTTGATCATAATTAACAGTAATATTTTTCAATCCTGTACTGTCTTCATTACCATTAGAGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTGGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAttt > 2:208364/1‑141 (MQ=255) aaCTTTATTTGCAGTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATCATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTg < 2:319043/141‑1 (MQ=255) cTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGAt < 1:265463/141‑1 (MQ=255) tttATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATc > 1:114813/1‑141 (MQ=255) tttATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATc > 1:114716/1‑141 (MQ=255) tttATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATc < 1:1085005/141‑1 (MQ=255) tttATTTGCAGTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATCATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATc > 2:764832/1‑141 (MQ=255) ttATTTGCATTTTGCTCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCt < 2:44257/141‑1 (MQ=255) ttATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCt > 2:558391/1‑141 (MQ=255) tATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTg < 2:1029490/141‑1 (MQ=255) ttttGCATGTTTATCATAAGTAACATTCAGATCGGCCAACACTGTACTGTCGTCATTACCATGAGGTAAGGTTGTAGTTAATGCATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGc < 1:98856/140‑1 (MQ=255) tttGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCt > 1:390718/1‑141 (MQ=255) tttGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCt > 2:66374/1‑141 (MQ=255) gCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCtttt < 1:571489/141‑1 (MQ=255) cATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCTTTTa < 2:1000261/141‑1 (MQ=255) cATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCTTTTa < 2:1000032/141‑1 (MQ=255) | AATATTTTTAGGTGTATCGATATTCGCAACATTAACTTTATATGATAATTTTAAAGATTTATCTGGGAATAAAACTTCTTTAGTGTGTGTACCACGTGCCGTTGTCACACCTTGGCTTGTAAATGTAACTTTATTTGCATTTTGATCATAATTAACAGTCATATTTTTCAATACTGTACTGTCTTCATTACCATTAGGGAATGTTGTAGTTAATGAATTATTAACGTAAGTTACACCTTGTGGTAATGTTACTTCATATTTAAATTGATCTGCTTTTA > CP000730/2284582‑2284859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |