Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 2,622,662 | A→G | 5.9% | Y3Y (TAT→TAC) | USA300HOU_2485 ← | MFS family major facilitator transporter, cation symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 2,622,662 | 0 | A | G | 5.9% | 253.4 / 5.0 | 85 | Y3Y (TAT→TAC) | USA300HOU_2485 | MFS family major facilitator transporter, cation symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/47); new base G (3/2); total (36/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 |
GATAATTTTAAAGATGATTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCGAAATA > CP000730/2622525‑2622802 | aaTAATTTTAAATATGATTGGATTGTAAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATac < 2:758549/140‑1 (MQ=255) aaaGATGATTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATAttt < 2:1005660/141‑1 (MQ=255) aaGATGATTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTa < 1:913041/141‑1 (MQ=255) aGATGATTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTAt > 1:271678/1‑141 (MQ=255) aGATGATTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTAt > 1:500366/1‑141 (MQ=255) gatgatTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACACAACGACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATc < 1:565473/141‑1 (MQ=255) gatTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCAcc > 1:406134/1‑141 (MQ=255) gTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCa > 2:347694/1‑141 (MQ=255) gTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCa < 2:420490/141‑1 (MQ=255) gTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATaaa > 2:681847/1‑141 (MQ=255) cAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATaaaaa < 2:126841/141‑1 (MQ=255) cAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCACTCATaaaaa > 1:1077455/1‑141 (MQ=255) ttCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAaataa > 1:670769/1‑141 (MQ=255) aaCAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTg < 1:335535/141‑1 (MQ=255) cAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGaa > 2:297464/1‑141 (MQ=255) cAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGaa < 1:462026/141‑1 (MQ=255) cAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGaa < 2:807402/141‑1 (MQ=255) aGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAAt < 1:272204/141‑1 (MQ=255) gTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTTTTATCTTCTAAATACAACATATTTATTACCTCTTATAAAAATAATTTAAta > 2:749048/1‑140 (MQ=255) tAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGc < 1:540153/141‑1 (MQ=255) tAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGc > 1:816343/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) gTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑Cttttt > 1:176949/1‑141 (MQ=255) gTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑Cttttt < 1:402624/141‑1 (MQ=255) gTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑Cttttt < 1:476265/141‑1 (MQ=255) tAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑Ctttttt > 1:694734/1‑141 (MQ=255) gAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGAc > 2:703628/1‑141 (MQ=255) aaaCAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACct < 1:790486/141‑1 (MQ=255) aaCAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACctt < 1:533085/141‑1 (MQ=255) aaCAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAACTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACctt > 1:201454/1‑141 (MQ=255) gCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCttcttc > 2:396784/1‑141 (MQ=255) gCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCttcttc < 2:371064/141‑1 (MQ=255) acaAAGCAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAGTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAGCCTTTTTTAGACCTtcttct < 1:84166/141‑1 (MQ=255) acaAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTa < 2:318480/141‑1 (MQ=255) acaAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTCAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTa > 2:843895/1‑141 (MQ=255) agcaacTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAGTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAGCCTTTTTTAGACCTTCTTCTAAAc > 1:440213/3‑141 (MQ=255) acTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAActctct > 2:10433/1‑141 (MQ=255) acTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAActctct < 1:208387/141‑1 (MQ=255) acTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAActctct > 2:81073/1‑141 (MQ=255) cGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCa > 1:808307/1‑141 (MQ=255) aaGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAg < 2:680749/141‑1 (MQ=255) aaaaTTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAgcg < 1:569508/140‑1 (MQ=255) aaaTTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAgcgc < 1:683980/141‑1 (MQ=255) aaaTTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAgcgc < 2:408240/141‑1 (MQ=255) aaaTTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATAGTTATCACCTCTCATAAGAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAgcgc < 2:459379/141‑1 (MQ=255) ttACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAGTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAGCCTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCaa > 1:124994/1‑141 (MQ=255) ttACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCaat < 1:946265/141‑1 (MQ=255) ttACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCaat < 1:324452/141‑1 (MQ=255) ttACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCaat < 1:297852/141‑1 (MQ=255) aatcaatAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCaattaatt > 1:79376/1‑141 (MQ=255) tcaatAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCt < 2:592932/141‑1 (MQ=255) aataaataTGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTaa < 2:787519/141‑1 (MQ=255) taaataTGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAata < 1:746963/141‑1 (MQ=255) aataTGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAGTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAGCCTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAataa > 1:740635/1‑140 (MQ=255) aataTGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAAtata > 2:453281/1‑141 (MQ=255) aataTGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAAtata < 2:591771/141‑1 (MQ=255) atGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAAtt < 1:437884/141‑1 (MQ=255) tAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCTACCAC‑CTATCCTCGACATTCTTCTACACTCTCTTTATCAAAAACGCCATTAATTCTAATATAATTTaa > 2:672031/1‑140 (MQ=255) tAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAg > 2:872120/1‑141 (MQ=255) tAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAg < 1:87416/141‑1 (MQ=255) tAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAg < 1:703628/141‑1 (MQ=255) tCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTa < 1:966559/141‑1 (MQ=255) tATTTTTCAAAACTTCTAAGTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAGCCTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATAAAATTAAGTCAGTTaa < 1:7775/141‑1 (MQ=255) tATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTaaa < 1:438497/141‑1 (MQ=255) tATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTaaa > 1:471751/1‑141 (MQ=255) tATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTaaa > 1:706897/1‑141 (MQ=255) tATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCGCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATAAACTTTAGTCAGTTaaa > 2:236559/1‑141 (MQ=255) aTTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTTTTTTTTTTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAat > 2:402296/1‑141 (MQ=255) tttttCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGCCATTTAGGTGAACTCTCTTTATCCAAAGCGCACTTAATTCTAATATAATTTAGTCATTTAAata > 1:836145/1‑141 (MQ=255) tttttCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAata > 1:176987/1‑141 (MQ=255) tttCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATc < 1:599164/141‑1 (MQ=255) tttCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATc < 2:694734/141‑1 (MQ=255) cAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAat < 1:317751/141‑1 (MQ=255) cAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAat < 2:454798/141‑1 (MQ=255) aaCTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAattat > 1:72357/1‑141 (MQ=255) aaCTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAattat > 1:72368/1‑141 (MQ=255) aCTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAattatt > 1:1079574/1‑141 (MQ=255) tCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCg < 1:579539/141‑1 (MQ=255) cTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCGa < 2:68913/141‑1 (MQ=255) cTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCGa < 2:375442/141‑1 (MQ=255) aTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCGAAata > 2:808325/1‑141 (MQ=255) aTACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCGAAata > 1:1029786/1‑141 (MQ=255) | GATAATTTTAAAGATGATTGGTTTGTCAATTCAACAGTAAACCAAATTATTTGTAACGAAAACAGCACAAAACAACTCCGACGTAAGAAATTACCAATCAATAAATATGTAAAGTTTCTATTTTTCAAAACTTCTAAATACAACATATTTATCACCTCTCATAAAAATAATTGAATGCATCCACCAG‑CTTTTTTAGACCTTCTTCTAAACTCTCTTTATCCAAAGCGCAATTAATTCTAATATAATTTAGTCAGTTAAATATCAATTATTTCGAAATA > CP000730/2622525‑2622802 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |