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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 51.1% | 1.1 / inf | 572 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 576 total aligned reads displayed.
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tatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagcttat > 1:486459/1‑134 (MQ=11) gCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACa < 1:658802/141‑1 (MQ=40) gAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAATGGAGCGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATgg < 2:589499/141‑1 (MQ=255) cGTGATATATCCGCCGTGTGATGGGAACGTGGGGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATtg < 1:58240/141‑1 (MQ=14) tctgaaataTTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTAAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAACGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGt > 1:408865‑M2/10‑141 (MQ=255) tgaaataTTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAg < 2:471806‑M2/93‑1 (MQ=255) 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ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATA > CP000730/76182‑76459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |