| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,668,042 | A→G | 6.3% | Y50Y (TAT→TAC) | USA300HOU_2523 ← | transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,668,042 | 0 | A | G | 6.3% | 334.0 / 9.5 | 113 | Y50Y (TAT→TAC) | USA300HOU_2523 | transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/65); new base G (5/2); total (46/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TAAACCAACAATGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCTACACCTAACA > CP000730/2667904‑2668181 | tAAACCAACAATGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATa > 2:1046899/1‑141 (MQ=255) aaaCCAACAATGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATaa < 1:528838/141‑1 (MQ=255) aaaCCAACAATGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATaa < 2:179019/141‑1 (MQ=255) aCCAACAATGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACt < 2:46342/141‑1 (MQ=255) aCCAACAACGACCGCGAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTNCGATNCCTCTNAAACTTNTTGCTNATTCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCTTTACt > 2:23953/1‑141 (MQ=255) acaaTGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAg < 2:198433/141‑1 (MQ=255) caaTGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGa < 1:799233/141‑1 (MQ=255) caaTGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGa < 1:799142/141‑1 (MQ=255) aaTGACCACAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATACCTCGTAGAAATTTAATATCACATACGCCACCAATAGCAAAACTTAAGaa > 2:987846/1‑141 (MQ=255) gACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGc > 1:16854/1‑141 (MQ=255) aaCCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCGTAACTTAAGAATGc > 2:29784/2‑141 (MQ=255) aCCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGCAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCt < 2:326410/141‑1 (MQ=255) aCCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCt < 1:135987/141‑1 (MQ=255) ccGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCtt > 1:319217/1‑141 (MQ=255) aTACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTa < 2:581693/141‑1 (MQ=255) tACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCGTAACTTAAGAATGCTTGTGGTAg > 1:703807/1‑141 (MQ=255) tACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAg < 1:25478/141‑1 (MQ=255) tcTGGTGCAACTCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAATCTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGa < 2:786767/140‑1 (MQ=255) aCTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGa < 1:462359/141‑1 (MQ=255) tGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGaaa > 1:606043/1‑141 (MQ=255) tGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGaaa > 2:632359/1‑141 (MQ=255) gTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATg > 2:959511/1‑141 (MQ=255) gCAACGCCTAAGTTTAAGAACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTc < 1:689582/141‑1 (MQ=255) aCGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGca < 2:820708/141‑1 (MQ=255) cGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGcac < 2:829540/141‑1 (MQ=255) gCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGcaca < 2:977681/141‑1 (MQ=255) cTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAg > 2:12833/1‑141 (MQ=255) cTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAg > 2:272657/1‑141 (MQ=255) tAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGc < 2:319217/141‑1 (MQ=255) aaGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCt > 2:372330/1‑141 (MQ=255) tttAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTAGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCa > 2:1041282/1‑141 (MQ=255) tAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCAcc < 1:321389/141‑1 (MQ=255) aaGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCg > 1:836192/1‑141 (MQ=255) aGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCgg < 1:275305/141‑1 (MQ=255) aGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCgg > 1:142888/1‑141 (MQ=255) gCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGa < 2:195955/141‑1 (MQ=255) gCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGa < 2:528487/141‑1 (MQ=255) gCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTAGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGa > 2:787211/1‑141 (MQ=255) cGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATaa > 1:726347/1‑141 (MQ=255) cGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATaa < 2:327690/141‑1 (MQ=255) aGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCt < 1:628300/141‑1 (MQ=255) gAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCtt < 1:509426/141‑1 (MQ=255) aTACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGt < 1:929587/141‑1 (MQ=255) aTACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGt < 1:802154/141‑1 (MQ=255) tACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTa < 1:818542/141‑1 (MQ=255) tACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTa < 1:935641/141‑1 (MQ=255) ccTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGt < 1:593439/141‑1 (MQ=255) ccTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGt < 2:905960/141‑1 (MQ=255) aCTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCt > 2:741553/1‑141 (MQ=255) cTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCtt > 2:331828/1‑141 (MQ=255) cGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCGTAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGtt < 2:388084/141‑1 (MQ=255) aTACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTa < 2:831486/141‑1 (MQ=255) aTACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTa < 2:971708/141‑1 (MQ=255) ccGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCg < 1:307077/141‑1 (MQ=255) cGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGt < 1:286181/141‑1 (MQ=255) aaaCTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGt < 1:720669/141‑1 (MQ=255) aCTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGc < 1:777834/141‑1 (MQ=255) cTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCa < 2:415846/141‑1 (MQ=255) ccTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATAc < 1:778990/141‑1 (MQ=255) cTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACt < 1:292764/141‑1 (MQ=255) tGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACtt < 1:753199/141‑1 (MQ=255) tGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACtt < 2:264876/141‑1 (MQ=255) gCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCGTAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACttt > 1:516051/1‑141 (MQ=255) gCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCGTAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACttt > 1:828558/1‑141 (MQ=255) gCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACttt > 1:198893/1‑141 (MQ=255) tCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAAt < 1:646507/141‑1 (MQ=255) cccAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAg > 2:288770/1‑141 (MQ=255) ccAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGc < 2:637049/141‑1 (MQ=255) ccAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACAAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGc > 2:644042/1‑141 (MQ=255) cAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAACTAGCg > 1:889505/1‑141 (MQ=255) cAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCg < 1:86051/141‑1 (MQ=255) aaTATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGt < 2:904089/141‑1 (MQ=255) aaTATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGt > 2:346208/1‑141 (MQ=255) aaTATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGt < 1:995259/141‑1 (MQ=255) aaTATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGt > 1:257022/1‑141 (MQ=255) tCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATg > 1:541344/1‑141 (MQ=255) cTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGa < 1:137372/141‑1 (MQ=255) ttGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGAt < 1:597571/141‑1 (MQ=255) ttGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGAt < 1:597858/141‑1 (MQ=255) tAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCAc < 1:495706/141‑1 (MQ=255) tAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCAc < 1:959511/141‑1 (MQ=255) aaTATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCaa < 1:694379/141‑1 (MQ=255) aaTATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCaa > 2:524213/1‑141 (MQ=255) aaTATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCaa > 2:268773/1‑141 (MQ=255) atatCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAg < 2:1052219/141‑1 (MQ=255) tatCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGa > 1:289711/1‑141 (MQ=255) atCAAATACGCCACCAATAGCGTAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGAc > 1:443054/1‑141 (MQ=255) atCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGAc < 1:552799/141‑1 (MQ=255) atCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGAc > 1:685142/1‑141 (MQ=255) atCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGAc < 2:706507/141‑1 (MQ=255) atCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGAc > 2:645590/1‑141 (MQ=255) atCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGAc > 1:658127/1‑141 (MQ=255) cacaTACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAAAGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTa > 2:636487/4‑141 (MQ=255) cAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTa < 1:574484/141‑1 (MQ=255) cGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGc > 1:1058230/1‑141 (MQ=255) ccaccaATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCt > 2:745499/1‑141 (MQ=255) caccaATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCTa > 2:256286/1‑141 (MQ=255) ccaATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCGCAAGCCGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCTaca < 1:288416/141‑1 (MQ=255) aaTAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCTACAcc < 1:378462/141‑1 (MQ=255) cATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCTACACCTAACa < 2:949757/141‑1 (MQ=255) | TAAACCAACAATGACCGCAAATACTGGTGCAACGCCTAAGTTTAAGCACGTTAGAATACCTACTGCGATACCGCTTAAACTTCCTGCTAAATCCCCAATATCTTGTAGAAATTTAATATCAAATACGCCACCAATAGCATAACTTAAGAATGCTTGTGGTAGAAATGTCGCACAAGCTGCACCGGATAATGCTTGTAGTCCTTGTTTACCGTACGGTGCATACTTTAAAAATAGCGTCATGATCACTAAAACCAAGACTAATGTGCCTACACCTAACA > CP000730/2667904‑2668181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |