| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 46.5% | 118.7 / inf | 447 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (134/105); new base A (134/74); total (268/179) | |||||||||||
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Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
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2:517680‑M2/6‑141 (MQ=255) aataTTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATG‑CCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGTCGTATTGATGAGACGTACATc < 1:740236‑M2/137‑1 (MQ=255) aataTTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATG‑CCCCAATTTTATATCAAAAAAAAAAAAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATc < 2:682153‑M2/137‑1 (MQ=255) ttAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATG‑CCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTACTGATGAGACGTANATCaaca > 2:814218/1‑139 (MQ=255) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAACATG‑CCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATa > 1:248197/1‑141 (MQ=255) cGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATG‑CCCCAATTTTATGTCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAATGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGaa > 1:319430/1‑141 (MQ=255) 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2:232842/1‑141 (MQ=40) tCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATG‑CCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTg > 1:648918/1‑141 (MQ=40) | GTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATG‑CCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATA‑AAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATTG > CP000730/76213‑76493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |