| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,870,578 | G→A | 5.2% | intergenic (‑46/+21) | gidA ← / ← mnmE | glucose inhibited division protein A/GTP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,870,578 | 0 | G | A | 5.2% | 368.9 / 5.1 | 117 | intergenic (‑46/+21) | gidA/mnmE | glucose inhibited division protein A/GTP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/55); new base A (4/2); total (60/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
ATTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATCC > CP000730/2870438‑2870716 | aTTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACgg < 1:79667/141‑1 (MQ=255) ttAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGt < 1:244118/141‑1 (MQ=255) ttAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGt < 1:509338/141‑1 (MQ=255) tAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACggaa < 1:544088/141‑3 (MQ=255) tGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTc < 2:673868/141‑1 (MQ=255) tttAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACATCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGt < 2:623035/141‑1 (MQ=255) tttAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGt < 1:291214/141‑1 (MQ=255) tttAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGt < 2:538480/141‑1 (MQ=255) ttAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTc > 2:128742/1‑141 (MQ=255) aGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTa < 1:385769/141‑1 (MQ=255) accacGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATCAACCTCCTTATTTGATACCTTACTAGCCTTTTTAACACGGTATTCCGGCTAttt > 1:793724/1‑141 (MQ=255) accacGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGAATACCGTCttaag < 2:81734/141‑5 (MQ=255) cacGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCa > 1:461325/1‑141 (MQ=255) tCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTa > 2:633463/1‑141 (MQ=255) tGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTa < 1:205917/141‑1 (MQ=255) tGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTa > 1:908709/1‑141 (MQ=255) tGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAAGTACTa > 1:908662/1‑141 (MQ=255) gCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTAt > 1:225871/1‑141 (MQ=255) cAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTAtt < 1:890143/141‑1 (MQ=255) cAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTAtt > 1:62149/1‑141 (MQ=255) aGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATAACTTACTAGCATTATTAAGAAGATAGTCCGTCTATTTCAATTAGTAttt > 1:1024651/1‑141 (MQ=255) aaaCCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAg < 1:270513/141‑1 (MQ=255) aaaCCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAg < 2:81083/141‑1 (MQ=255) aaCCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGc > 2:58543/1‑141 (MQ=255) aCCTGCTTCTACACCGGCATGTCCCGCACCTAGAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCa < 2:25089/141‑1 (MQ=255) aCCTGCTTATACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCa < 1:1001355/141‑1 (MQ=255) gCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATAACTTACGAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAAt > 1:237948/1‑141 (MQ=255) gCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATAATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTAAATTACTATTTACCTAAGCAGAAt > 2:644310/1‑141 (MQ=255) acacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTg > 1:216430/1‑141 (MQ=255) acacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTg > 1:748195/1‑141 (MQ=255) acacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTg > 1:320623/1‑141 (MQ=255) acacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGATATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTg > 2:402644/1‑141 (MQ=255) acacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGATATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTg > 2:402655/1‑141 (MQ=255) cacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGa > 2:266776/1‑141 (MQ=255) cacCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGa < 1:4176/141‑1 (MQ=255) cTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATa < 1:401661/141‑1 (MQ=255) tGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATaa < 1:1027552/141‑1 (MQ=255) cATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACt < 1:140580/141‑1 (MQ=255) tGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGa > 2:470429/1‑141 (MQ=255) tGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGa > 2:470065/1‑141 (MQ=255) ccGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGa > 1:304969/1‑141 (MQ=255) gCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATg < 1:729156/141‑1 (MQ=255) cACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGa > 2:730013/1‑141 (MQ=255) cACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGa < 2:563722/141‑1 (MQ=255) cACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGa > 1:165797/1‑141 (MQ=255) cACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGa < 2:50735/141‑1 (MQ=255) ccTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGt < 2:574342/141‑1 (MQ=255) ataACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTtca > 2:457536/1‑141 (MQ=255) taACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTTCTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTtcat > 2:904337/1‑141 (MQ=255) taACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTtcat > 2:1072546/1‑141 (MQ=255) aCATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCa > 1:1018079/1‑141 (MQ=255) aCATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCa > 2:824164/1‑141 (MQ=255) catATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGtct > 1:534933/1‑141 (MQ=255) atatTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGATATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGGTGAGTTCATCACTTGCAGtctc > 2:716378/1‑141 (MQ=255) tCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTGTTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCa < 2:858787/141‑1 (MQ=255) cTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTTAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCaa < 2:932875/141‑1 (MQ=255) cTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCATTTGCAGTCTCACCaa > 1:900404/1‑141 (MQ=255) cTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCaa > 2:727432/1‑141 (MQ=255) ttGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCaat > 1:290406/1‑141 (MQ=255) ccACAATATAAACCTCCTTATTTGATCTCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAAttt > 2:456546/1‑141 (MQ=255) acaATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGtatctatcaaacttgct > 2:39501/1‑128 (MQ=255) tataAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTa > 2:426799/1‑141 (MQ=255) taAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAat < 2:309088/141‑1 (MQ=255) aaaCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAata > 2:442644/1‑141 (MQ=255) aaCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAatat > 1:713375/1‑141 (MQ=255) aaCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAatat > 1:651813/1‑141 (MQ=255) aaCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAatat > 2:210310/1‑141 (MQ=255) aCCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATAtt > 1:182722/1‑141 (MQ=255) cctcctTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATAttt > 2:660329/1‑141 (MQ=255) cctTATTTGATATCTTACTCGCCTTCTTCAGACGGCATTCCGTCTATCTCAATTACTTTTTCGATGCGCTGGCTTGCCTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTccc < 1:812957/141‑1 (MQ=255) cctTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTccc < 1:991520/141‑1 (MQ=255) ttATTTGATATCTTAATCGCATTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTAAATTACTATTTACCAAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCaa < 2:462710/141‑1 (MQ=255) aTTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGt > 2:934526/1‑141 (MQ=255) aTTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGt < 1:456228/141‑1 (MQ=255) tttGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGtt < 1:746060/141‑1 (MQ=255) tttGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGtt < 2:807169/141‑1 (MQ=255) tttGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGtt < 1:612973/141‑1 (MQ=255) tGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCt > 2:31017/1‑141 (MQ=255) tGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCt > 2:425437/1‑141 (MQ=255) atCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGtt < 1:829640/141‑1 (MQ=255) tCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTa < 2:867866/141‑1 (MQ=255) tCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTa < 1:1077814/141‑1 (MQ=255) cTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTaa > 1:423419/1‑141 (MQ=255) cTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTaa > 1:1055751/1‑141 (MQ=255) tACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAAt < 2:910954/141‑1 (MQ=255) tACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAAt < 1:361056/141‑1 (MQ=255) tACTAGCCTTCTTAAGACGATATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAAt < 1:402655/141‑1 (MQ=255) tACTAGCCTTCTTAAGACGATATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAAt < 1:402644/141‑1 (MQ=255) aCTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCGCCAATAATTTCGCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATc < 2:415432/141‑1 (MQ=255) aCTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATc > 1:484208/1‑141 (MQ=255) aCTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATc > 1:484280/1‑141 (MQ=255) cTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAGTAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCa < 1:620036/141‑1 (MQ=255) cTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCa < 2:707226/141‑1 (MQ=255) cttcttAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTg > 2:61803/1‑141 (MQ=255) tctgAAGACAGTATTCCGGCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCATTCTCACCAATAATTTCGCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTa < 2:593582/141‑1 (MQ=255) ttAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTAcc < 2:58859/141‑1 (MQ=255) aaGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCGTCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCat < 2:742104/141‑1 (MQ=255) gACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCatat > 1:680278/1‑141 (MQ=255) aCGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATc < 1:159589/141‑1 (MQ=255) cGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATcc > 1:842590/1‑141 (MQ=255) | ATTAATGTTTTAGCACCACGTCTTGCAGATGCTAAACCTGCTTCTACACCTGCATGTCCCGCACCTATAACGATTACATCATATTCTTGAACCACAATATAAACCTCCTTATTTGATATCTTACTAGCCTTCTTAAGACGGTATTCCGTCTATTTCAATTACTATTTACCTAAGCAGAATTGACTGAATAACTGATCGATGAGTTCATCACTTGCAGTCTCACCAATAATTTCTCCTAATATTTCCCAAGTTCTAGTTAAATCAATTTGTACCATATCC > CP000730/2870438‑2870716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |