| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 181,798 | T→G | 6.5% | G164G (GGT→GGG) | cap5H → | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 181,798 | 0 | T | G | 6.5% | 221.2 / 6.4 | 76 | G164G (GGT→GGG) | cap5H | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/35); new base G (2/3); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 | |||||||||||
GCCGTACAACAATTAAAAATGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGAT > CP000730/181659‑181937 | gCCGTACAACAATTAAAAATGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGgtggtg > 2:612565/1‑141 (MQ=255) cGTACAACAATTAAAAATGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGtt < 2:78176/141‑1 (MQ=255) cGTACAACAATTAAAAATGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGATTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGGGtt < 2:409042/141‑1 (MQ=255) gTACAACAATTAAAAATGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTc > 2:660270/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaTGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGAATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGAt > 2:1021294/1‑141 (MQ=255) aaTGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGAtt < 1:1059732/141‑1 (MQ=255) aaTGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGAtt < 1:936980/141‑1 (MQ=255) gatgTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTaag < 2:212354/141‑1 (MQ=255) atgTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTaaga > 2:882069/1‑141 (MQ=255) atgTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTaaga > 2:540238/1‑141 (MQ=255) tgtgtgGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTaagaa < 2:485005/141‑1 (MQ=255) tgtgtgGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTaagaa < 1:344924/141‑1 (MQ=255) tgtgtgGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTaagaa > 2:421182/1‑141 (MQ=255) tgtgGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGc > 1:773091/1‑141 (MQ=255) tgtgGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGATTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGGGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGc < 1:180991/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACa < 1:1015900/141‑1 (MQ=255) tattatGGATGGTTTAACCATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTACCAGTGTTGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGa < 1:376760/141‑1 (MQ=255) tattatGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGa < 1:434200/141‑1 (MQ=255) tattatGGATGGATTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGGGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGa < 1:90792/141‑1 (MQ=255) ttAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGaa < 1:950850/141‑1 (MQ=255) cAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCa > 2:781509/1‑141 (MQ=255) cAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCa < 1:797897/141‑1 (MQ=255) aataaataCTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCaa < 1:656834/141‑1 (MQ=255) aataCTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAgtgg > 1:850431/1‑141 (MQ=255) aataCTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTACCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAgtgg < 1:294215/141‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTggg < 2:290676/141‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTggg < 1:178707/141‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGGGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTggg > 1:564828/1‑141 (MQ=255) cTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGGGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTggg > 1:564927/1‑141 (MQ=255) tGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGga > 2:117289/1‑141 (MQ=255) tGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTCGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGaa < 1:801197/141‑1 (MQ=255) gCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGAGATTAAGAAGCGATTTCACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGaaa < 1:1030439/141‑1 (MQ=255) gTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACg < 2:435492/141‑1 (MQ=255) gTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACg > 2:239930/1‑141 (MQ=255) tCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGc < 2:73746/141‑1 (MQ=255) tCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGc < 1:170043/141‑1 (MQ=255) cATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGcc < 2:617430/141‑1 (MQ=255) tAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTg > 1:958352/1‑141 (MQ=255) gcagcCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGAc < 1:941585/141‑1 (MQ=255) agcCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACaa > 2:432816/1‑141 (MQ=255) agcCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACaa > 1:67119/1‑141 (MQ=255) gcCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACaaa > 2:160845/1‑141 (MQ=255) ccGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAAc > 1:564397/1‑141 (MQ=255) ggCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTa > 2:17987/1‑141 (MQ=255) gCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTaa > 1:479545/1‑141 (MQ=255) gCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTaa > 1:563600/1‑141 (MQ=255) cTCAGTTGTTGCTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTaaa < 2:940283/141‑1 (MQ=255) tCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCa > 2:108169/1‑54 (MQ=255) tCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCa < 1:108169/54‑1 (MQ=255) aGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAgg > 1:1064916/1‑141 (MQ=255) ttgttACTAACAATGTAGGAGAATCTGCGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAACGTGCTTAAGAAGAGATTTGACAATACAACACTTGACAAACTTTTGGCACGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACACACTAACGGGAt < 2:542284/141‑1 (MQ=255) gttACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGAttt < 2:272305/141‑1 (MQ=255) aaaTGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGa > 2:61262/1‑141 (MQ=255) aaTGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGaa > 1:1071794/1‑141 (MQ=255) aTGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAat > 1:333410/1‑141 (MQ=255) gTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAatat > 1:64657/1‑141 (MQ=255) tAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATAtt > 1:935618/1‑141 (MQ=255) aGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATAttt > 1:641539/1‑141 (MQ=255) aGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATAttt > 1:870428/1‑141 (MQ=255) ggAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTta < 1:794109/141‑1 (MQ=255) gAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAGTATTtaa < 2:638995/141‑1 (MQ=255) gAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTtaa > 2:563946/1‑141 (MQ=255) tGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATaaaaa > 2:105981/1‑141 (MQ=255) tGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATaaaaa < 2:392839/141‑1 (MQ=255) gtgggggTGATCCTGCAAAGGAGAGTAAGGGGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAACAAGGATACtt > 2:133144/2‑141 (MQ=255) tggtgTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATg > 2:188694/1‑141 (MQ=255) ggtgTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGa > 1:679380/1‑141 (MQ=255) ggtgTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATGTAAATAAAAAGGATACTTAATGa > 2:705343/1‑141 (MQ=255) gtgtTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGat < 2:187043/141‑1 (MQ=255) gtgtTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGat > 2:610723/1‑141 (MQ=255) | GCCGTACAACAATTAAAAATGATGTGTGGATTGGTGCAAATGTAATTATTATGGATGGTTTAACAATAAATACTGGTGCAGTCATAGCAGCCGGCTCAGTTGTTACTAAAAATGTAGGAGCATATGAGGTTGTTGGTGGTGTTCCTGCAAAAGTGATTAAGAAGCGATTTGACAATAAAACAATTGAAAAACTTTTGGAAAGCAAGTGGTGGGAGAAAACGCCTGACAAACTAAAAGGATTTTCGGTTGAATATTTAAATAAAAAGGATACTTAATGAT > CP000730/181659‑181937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |