| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 182,889 | C→T | 7.8% | L318L (CTA→TTA) | cap5I → | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 182,889 | 0 | C | T | 7.8% | 280.4 / 7.9 | 96 | L318L (CTA→TTA) | cap5I | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/47); new base T (5/3); total (46/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACGAAACCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACGGTTAG > CP000730/182750‑183027 | gACGAAACCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCt > 1:979823/1‑141 (MQ=255) aCGAAATCATTATTTATTCATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGCATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTa < 2:558629/141‑1 (MQ=255) aCGAAACCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTa < 1:838280/141‑1 (MQ=255) cGAAACCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTaa > 2:564055/1‑141 (MQ=255) cGAAACCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTaa > 2:235867/1‑141 (MQ=255) aaaCCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAg < 2:191729/141‑1 (MQ=255) ccAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGaa > 2:446940/1‑141 (MQ=255) cAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAg > 2:1033805/1‑141 (MQ=255) tATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTa < 1:989207/141‑1 (MQ=255) aTTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCg < 1:1078212/141‑1 (MQ=255) ttAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGt > 1:557922/1‑141 (MQ=255) ttAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGt > 1:810148/1‑141 (MQ=255) ttAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGt > 1:985759/1‑141 (MQ=255) tGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAAt > 2:497371/1‑141 (MQ=255) gAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAAtt > 1:601351/1‑141 (MQ=255) ataCAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGaaa > 1:519031/1‑141 (MQ=255) cAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAgg > 1:296628/1‑141 (MQ=255) cAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAgg > 1:296035/1‑141 (MQ=255) aGTATCTAATATAATTTTTGAATGTATACATGCTTGTTTACTAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTTAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGc < 2:873063/141‑1 (MQ=255) aGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGc < 2:424914/141‑1 (MQ=255) atataataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTAAAAAAAAAAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGt < 2:676651/138‑1 (MQ=255) aTCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGt < 2:726995/141‑1 (MQ=255) cTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTa < 1:987712/141‑1 (MQ=255) taataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAg < 2:605946/141‑1 (MQ=255) taataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAg < 2:931321/141‑1 (MQ=255) taataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAg < 2:1007875/141‑1 (MQ=255) taataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAg < 2:484833/141‑1 (MQ=255) taataaAATTTTTGAATATATACATGCTTGTTTAACAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGTATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTGCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAg < 2:630127/141‑1 (MQ=255) aataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGa < 1:81554/141‑1 (MQ=255) aataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTAAAATAAATAAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGa < 2:969118/141‑1 (MQ=255) aataaAATTCTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGa > 1:955395/1‑141 (MQ=255) ataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGaa < 1:864385/141‑1 (MQ=255) ataaAATTTTTGAATGTATACATGCTGGGTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTTAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATCAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAAAAATTAAAAAGTCGGTTAGaa > 2:431513/1‑141 (MQ=255) aaaaTTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGaaaa < 2:663544/141‑1 (MQ=255) ttttGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAag > 1:558220/1‑141 (MQ=255) tttGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAaga > 1:374652/1‑141 (MQ=255) tGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAgaga > 2:610575/1‑141 (MQ=255) tGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAgaga < 2:253201/141‑1 (MQ=255) caTGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCAGTGTTCTAAGGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAACATTCAGAGATa > 2:754073/2‑141 (MQ=255) aTGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATaa > 1:653362/1‑141 (MQ=255) gTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATc < 1:135992/141‑1 (MQ=255) tataCATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCa < 1:435444/141‑1 (MQ=255) taCATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACg < 2:954286/141‑1 (MQ=255) taCATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACg > 1:233123/1‑141 (MQ=255) aCATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGa < 2:557922/141‑1 (MQ=255) aTGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGAtt < 2:570136/141‑1 (MQ=255) gCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTg > 1:754598/1‑141 (MQ=255) gCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATAAAGAGATAATCACGATTTg > 1:554919/1‑141 (MQ=255) ggTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGttt < 1:545610/141‑1 (MQ=255) ggTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGttt < 1:170137/141‑1 (MQ=255) gTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTa > 2:870187/1‑141 (MQ=255) tttACCAGTAATTTTCCCTCGTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAAGATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTaa < 1:332687/141‑1 (MQ=255) cAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCAtt < 1:150739/141‑1 (MQ=255) aaTTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTgatccaatcgctttg > 1:805172/1‑127 (MQ=255) aTTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGt < 1:249517/141‑1 (MQ=255) tttATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCa > 1:251443/1‑141 (MQ=255) tttATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCa > 2:1072843/1‑141 (MQ=255) tttATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAACTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCa > 1:197783/1‑141 (MQ=255) ttATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCaa > 1:219806/1‑141 (MQ=255) tcCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGc < 1:966946/141‑1 (MQ=255) cTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGATCTAAAGGAGGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGAGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCaa > 1:593347/1‑141 (MQ=255) agagCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGc > 1:1047631/1‑141 (MQ=255) agCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGt < 1:1033805/141‑1 (MQ=255) agCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGt > 2:370504/1‑141 (MQ=255) gCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATTATATACGTCGAAATGCAATTAAGGCGTc < 2:1087273/141‑1 (MQ=255) gCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTc < 1:391460/141‑1 (MQ=255) gCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTc > 2:444037/1‑141 (MQ=255) atatTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTa > 1:493251/1‑141 (MQ=255) atatTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTa > 1:569750/1‑141 (MQ=255) atTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTaaa > 2:254673/1‑141 (MQ=255) aTCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAAttt < 2:558220/141‑1 (MQ=255) tcAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGa > 1:999432/1‑141 (MQ=255) cAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGaa > 2:129776/1‑141 (MQ=255) cAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGaa < 1:246728/141‑1 (MQ=255) aaTGANAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGNCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAAt < 1:438461/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGc < 1:546173/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGc < 2:110085/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGc < 1:799101/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGc < 2:955395/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGc > 2:641481/1‑141 (MQ=255) aaaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCaa > 2:88952/1‑141 (MQ=255) aaTATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCaaa > 1:37739/1‑141 (MQ=255) atatAAATTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAAt < 1:824637/141‑1 (MQ=255) tataAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATa < 1:780755/141‑1 (MQ=255) tataAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATa > 1:1035794/1‑141 (MQ=255) tataAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATa > 2:411979/1‑141 (MQ=255) tataAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTAAGACTAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATa > 1:556032/1‑141 (MQ=255) aaTTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATagaga > 1:101218/1‑141 (MQ=255) aTTTGGCATTGTTTTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATagaaag < 1:409908/141‑4 (MQ=255) cATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACg < 1:450197/141‑1 (MQ=255) aTTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACgg > 2:760839/1‑141 (MQ=255) aTTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACgg < 2:979823/141‑1 (MQ=255) ttGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACGGt < 2:1047631/141‑1 (MQ=255) ttCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACGGTtag < 1:873734/141‑1 (MQ=255) ttCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACGGTtag < 1:411979/141‑1 (MQ=255) ttCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACGGTtag < 2:61188/141‑1 (MQ=255) | GACGAAACCAGTATCTATTAATTTTGAATATACAGTATCTAATAAAATTTTTGAATGTATACATGCTGGTTTACCAGTAATTTTATCTCCTGTCAAAGAGCATATTTATCTCAATGAAAAATATAAATTTGGCATTGTTCTAAAGGAAGTTACGCCGTTAGAAATTGAAAAGGCGGTTAGAAAATTAAGAGATAATCACGATTTGTTTAATCATTTACGTCAAAATGCAATTAAGGCGTCTAAAATTTTGAATTGGCAAATAGAGAGTGAACGGTTAG > CP000730/182750‑183027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |