| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 774,414 | G→A | G555D (GGT→GAT) | fruA → | PTS family fructose/mannitol (fru) porter component IIABC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 774,414 | 0 | G | A | 97.4% | 252.8 / ‑1.7 | 77 | G555D (GGT→GAT) | fruA | PTS family fructose/mannitol (fru) porter component IIABC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (29/46); total (30/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
AGGTAATGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGGTATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTGCGCCACATG > CP000730/774277‑774551 | aGGTAATGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGatat > 2:200334/1‑141 (MQ=255) gTAATGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGt < 2:535791/141‑1 (MQ=255) gTAATGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGt < 1:651212/141‑1 (MQ=255) aTGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCAt > 2:663262/1‑141 (MQ=255) aTGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCAt > 1:634167/1‑141 (MQ=255) agcaCCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATttat < 2:599762/141‑1 (MQ=255) gcaCCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATttatt > 2:235640/1‑141 (MQ=255) aCCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTAc > 1:711151/1‑141 (MQ=255) ccAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACa > 1:696813/1‑141 (MQ=255) ccAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACa > 1:639822/1‑141 (MQ=255) cAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAg < 2:573980/141‑1 (MQ=255) cAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAg > 2:22288/1‑141 (MQ=255) tACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAgg < 2:225542/141‑1 (MQ=255) aCAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGt > 1:437072/1‑141 (MQ=255) cAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTg < 2:442746/141‑1 (MQ=255) cAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTg > 2:537566/1‑141 (MQ=255) cAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTg > 1:107455/1‑141 (MQ=255) cAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATCTATTACAGAAGGTg > 1:492262/1‑141 (MQ=255) gCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCg < 1:484836/141‑1 (MQ=255) gCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCg < 1:33691/141‑1 (MQ=255) cTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGa > 2:25493/1‑141 (MQ=255) tGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGAt > 1:152936/1‑141 (MQ=255) gATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCAtt < 2:469877/141‑1 (MQ=255) aTGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTg < 2:711849/139‑1 (MQ=255) aTGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTg > 1:711849/1‑139 (MQ=255) tGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCg < 1:25791/141‑1 (MQ=255) tGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCg < 2:92444/141‑1 (MQ=255) aTTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGCTGTTAACTTTTAGACGTAAATTTACACAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCAATTTGCACATGCCGAt > 2:667459/1‑141 (MQ=255) aTTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGAt < 1:291988/141‑1 (MQ=255) aTTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGAt < 2:639822/141‑1 (MQ=255) aTTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTACATTTGCAGCTGCCGAt > 2:667447/1‑141 (MQ=255) aCCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGGTATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCAtt > 2:273342/1‑141 (MQ=255) cGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTAc < 1:38555/141‑1 (MQ=255) tAGCACTTGCGACAGCGATGTTGATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAGCGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACgtg < 1:721090/141‑1 (MQ=255) cAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTa > 2:67646/1‑141 (MQ=255) aaTTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTAt < 1:366368/141‑1 (MQ=255) aaTTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATATACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTAt > 2:189733/1‑141 (MQ=255) ttGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTTAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTc < 1:251753/141‑1 (MQ=255) gACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTc < 1:683365/141‑1 (MQ=255) aCAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCa < 2:1650/141‑1 (MQ=255) cAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACTACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCaa < 2:376937/141‑1 (MQ=255) gcaaTGTTATATTTTAGTCGTAAATTTACAAAAGAACTACGTGGTTCAATTGTCCCTTACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCGATTTGCAGCTTACGATCCATTACGTGTTATTCCTTcgctg < 2:152936/138‑5 (MQ=255) gCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCAGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAatg < 2:711151/141‑1 (MQ=255) tGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAAtgatga < 2:144831/141‑1 (MQ=255) tGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAAtgatga < 1:580966/141‑1 (MQ=255) tGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAAtgatga < 2:107455/141‑1 (MQ=255) gTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATgatgat < 1:448895/141‑1 (MQ=255) gTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATgatgat > 1:534372/1‑141 (MQ=255) tAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTg > 1:664242/1‑141 (MQ=255) aTTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGt < 1:657010/141‑1 (MQ=255) tttttAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGtt < 2:171911/141‑1 (MQ=255) ttttAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTc > 1:568586/1‑141 (MQ=255) ttAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCCATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAg < 1:730974/141‑1 (MQ=255) gACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGta < 1:235640/141‑1 (MQ=255) aCGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGtat > 1:488824/1‑141 (MQ=255) aCGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGtat < 1:200969/141‑1 (MQ=255) aCGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGtat > 2:366024/1‑141 (MQ=255) aaGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTg < 2:534372/141‑1 (MQ=255) gAACAACGTGGTTCAATTATTCCAAACTAGGTGAGGGAGATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTACAATGAAGAGTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCt > 2:201508/1‑141 (MQ=255) aacaacGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCtt < 2:696568/141‑1 (MQ=255) aacaacGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCtt < 1:153578/141‑1 (MQ=255) acGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAgg > 2:572958/1‑141 (MQ=255) cGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTTCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGc < 1:122207/141‑1 (MQ=255) cGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGc < 1:663262/141‑1 (MQ=255) tCAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGt > 1:559920/1‑141 (MQ=255) cAATTATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGtt < 2:122823/141‑1 (MQ=255) tATCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACg < 2:437436/141‑1 (MQ=255) tCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGaa < 2:186987/141‑1 (MQ=255) tCCCTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGaa < 1:263963/141‑1 (MQ=255) cccTAACTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAAt < 2:764139/141‑1 (MQ=255) aaCTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACt > 1:318773/1‑141 (MQ=255) cTATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTgc < 2:229488/141‑1 (MQ=255) tATGTGATGGGTATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTgcg < 1:273342/141‑1 (MQ=255) tATGTGATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTgcg < 1:337494/141‑1 (MQ=255) tgATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTGCGCcac < 1:36145/141‑1 (MQ=255) tgATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTGCGCcac > 2:94318/1‑141 (MQ=255) tgATGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGGTCACGAATTACTGCGCcac > 1:524843/1‑141 (MQ=255) tGGATATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTGCGCCACAtg < 2:314001/141‑1 (MQ=255) | AGGTAATGCAGCACCAATTACAGCTGCAATGATTGGTGGTATGATTCCACCGTTAGCAATTGCGACAGCGATGTTAATTTTTAGACGTAAATTTACAAAAGAACAACGTGGTTCAATTATCCCTAACTATGTGATGGGTATGTCATTTATTACAGAAGGTGCGATTCCATTTGCAGCTGCCGATCCATTACGTGTTATTCCTTCAATGATGATTGGTTCAGGTATAGGTGGCGCAATTGCTTTAGGCTTAGGTTCACGAATTACTGCGCCACATG > CP000730/774277‑774551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |