Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913_3_bme_pgi | 2,665,522 | A→G | 6.8% | T30A (ACC→GCC) | csiE → | stationary phase inducible protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913_3_bme_pgi | 2,665,522 | 0 | A | G | 6.8% | 129.1 / 3.7 | 60 | T30A (ACC→GCC) | csiE | stationary phase inducible protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/32); new base G (2/2); total (26/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.29e-02 |
CGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGTTGAAGGTA > NC_000913_3_bme_pgi/2665374‑2665669 | cGCCAGTTCCTTGAGCTAACTTCCGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGCTCTACAGATGATGCCTACGGTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGa < 2:83959/149‑1 (MQ=255) gCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGCCGCTCTTTCAGCCGAGGTTGAc > 2:125013/1‑149 (MQ=255) gCCATTTCCGTGAGCAAACTTTTGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACTATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGAc < 2:766193/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGccacca > 1:595875/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGGTGACCGccacca > 2:630274/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCGTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCAACTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCACTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGCCCGacacca > 2:217769/1‑149 (MQ=255) tGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGTGTTGACCGCCACCATg < 1:783568/149‑1 (MQ=255) gCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATCGCa > 1:294447/1‑149 (MQ=255) cAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCaa > 1:367245/1‑149 (MQ=255) aaaCTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAAc < 1:898084/149‑1 (MQ=255) aGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGc > 1:572328/1‑149 (MQ=255) cTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATTATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGa < 1:501024/149‑1 (MQ=255) cTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCTGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGa > 1:750236/1‑149 (MQ=255) ttCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCt > 1:779408/1‑149 (MQ=255) ttCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCt < 1:738821/149‑1 (MQ=255) ttCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCCCTCCCAGATCTTGCTCACGCCGCTTCAGCCGGCGTTGACCCCCCCCATGGCCACCCTCAGCgccct > 2:96900/1‑145 (MQ=255) aaTTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGgtg < 1:309297/149‑1 (MQ=255) aTGGTTATGGGTGATCCACAGAGCAGGCGTACATTTGCTTTAGCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTGGCTGACGCTCTTTCTGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGTAATCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGga < 2:72497/149‑1 (MQ=255) aTGCTTATGGGAGATCTACAGAGGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGAGCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGga < 2:228923/149‑1 (MQ=255) tGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGTAACCTGCAGCGAGCTTAATGGTGTGgat‑gatgat < 2:643460/149‑1 (MQ=255) gggAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGata < 2:796411/149‑1 (MQ=255) tACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTTCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCTAGt > 1:725058/1‑149 (MQ=255) cAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑AATGATATTGCCAGTCt > 1:493231/1‑149 (MQ=255) atgatgCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGTCAGTCTTgt > 1:740556/1‑148 (MQ=255) atgatgCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGa < 1:505760/149‑1 (MQ=255) aggctgCCTTGGCTGGCTGCAACATCTGGCCATTCGGGTCCCCAGCGCCGCTGACAGATCCTGCTGACGCTCTTTGAGCCGGGGTTGATCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTTGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGa < 2:204890/145‑1 (MQ=255) gCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCa < 1:744155/149‑1 (MQ=255) tACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTATCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGAGGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTGCAACGAGCTTAATGGGGCGGCT‑GATGCTGTTCCCAGTCTTGACATCAGCg > 2:39923/1‑149 (MQ=255) gCTTGCTCCGCCAGTTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGaaa < 1:876383/149‑1 (MQ=255) cTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGa < 1:718524/149‑1 (MQ=255) tCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGGCCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGAc > 1:116394/1‑149 (MQ=255) tCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGGCCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGAGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGAc > 1:118736/1‑149 (MQ=255) aTCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGgaga < 1:601044/149‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGGCCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGAt < 2:116394/149‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGGCCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGAt < 2:118736/149‑1 (MQ=255) cTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATc < 2:635567/149‑1 (MQ=255) cTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATc < 2:294447/149‑1 (MQ=255) tGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCTTCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATcc > 1:127380/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCATCGAAACAGGACGGGAGATCCTg > 1:730946/1‑149 (MQ=255) tttCGGCTCCCCAGCGCTGCTGCCCGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGTCACCATGGCAACCTTTAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTgcgc < 2:816779/149‑1 (MQ=255) cTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCTGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTatcat < 1:852052/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACTCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCATCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAAc < 2:177357/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAAc > 1:7762/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGAACGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAAc > 2:4413/1‑149 (MQ=255) gggccgtTGCCAGATCTTGCTGATGCTCTTTTAGCCGGGGTTGACCGCCATCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAAGGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTca < 1:415316/147‑1 (MQ=255) ccgcTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAACGAAACAGGAAGGGAGATCCTGCCCCATCCTCAACTcaccc > 2:202779/1‑147 (MQ=255) cTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTga < 1:892706/149‑1 (MQ=255) cTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTga < 1:554786/149‑1 (MQ=255) tGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGTTGTGATCTCCATCATTGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTgac < 1:52486/149‑1 (MQ=255) gATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTg < 1:468843/149‑1 (MQ=255) aTCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGCGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTgg > 1:24581/1‑149 (MQ=255) ttGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTa < 1:832349/149‑1 (MQ=255) gCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAAATCGCACTGACGATTGGTTATGACGGTa > 1:556586/1‑149 (MQ=255) tttCAGCCGGGGTTCACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGATTATGACGGTCGCTa > 1:778672/1‑149 (MQ=255) ccGGGGTTGACCCCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGt < 2:742648/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGTGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGTTGaa < 2:308343/149‑1 (MQ=255) gTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGTTGAAg < 2:779408/149‑1 (MQ=255) gTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCAAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGATGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCAAACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACAGGGTTGacg > 2:838143/1‑147 (MQ=255) gTTGACCGCCAACAGGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGTTGAAg < 2:737159/149‑1 (MQ=255) ttGACAGCCACCATGACAAAATTCAGCGAAATTAAAAGTATGAATGGATG‑TATAGCCAGGGTGAATAGCAGCGGGACAGGACGGGTGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACAACTGGTTATAACGGTAGCTAACGGGTTGaacg > 2:81266/1‑147 (MQ=255) gACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGTTGAAGGTa < 2:127380/149‑1 (MQ=255) | CGCCATTTCCTTGAGCAAACTTTAGCTATTCTTATCAATTATGCTTATGGGAGATCTACAGATGATGCCTACGCTTGCTCCACCATCTGTCCTTTCGGCTCCCCAGCGCCGCTGCCAGATCTTGCTGACGCTCTTTCAGCCGGGGTTGACCGCCACCATGGCAACCTTCAGCGAGCTTAATGGTGTGGAT‑GATGATATTGCCAGTCTTGATATCAGCGAAACAGGACGGGAGATCCTGCGCTATCATCAACTCACACTGACGACTGGTTATGACGGTAGCTACCGGGTTGAAGGTA > NC_000913_3_bme_pgi/2665374‑2665669 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |