| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913_3_pae_pgi | 1,678,015 | Δ73 bp | intergenic (‑112/‑340) | pntA ← / → ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 1678088 = | 0 (0.000) | intergenic (‑185/‑339) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
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3:554690‑M1/150‑149 (MQ=255) | TTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACGG > NC_000913_3_pae_pgi/1677865‑1678162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |