| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2508438 = | 157 (1.220) | 9 (0.080) | 7/232 | NT | 6.4% | intergenic (+670/+81) | sarZ/narK | transcriptional regulator/MFS family major facilitator transporter, nitrate:nitrite antiporter |
| ? | CP000730 | 2508486 = | 119 (1.010) | intergenic (+718/+33) | sarZ/narK | transcriptional regulator/MFS family major facilitator transporter, nitrate:nitrite antiporter | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
CATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAATGACTTGATCC > CP000730/2508346‑2508626 | cattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTg > 2:1564831‑M1/93‑141 (MQ=255)cattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTg > 1:1657285‑M1/93‑141 (MQ=255) aTTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGt < 1:127228/141‑1 (MQ=255) aCCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtt < 1:342250/141‑1 (MQ=255) tGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAAc < 2:202926/141‑1 (MQ=255) ccTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTa > 2:1156142/1‑141 (MQ=255) ccTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTa > 1:59240/1‑141 (MQ=255) cTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTaa < 1:1097828/141‑1 (MQ=255) aaaaTCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaat < 2:598919/141‑1 (MQ=255) aaaTCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatg < 2:425961/141‑1 (MQ=255) aaTCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatga > 1:382188/1‑141 (MQ=255) cAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatg < 1:863206/141‑1 (MQ=255) cAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatg < 1:682812/141‑1 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGTGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatgt > 1:1404283/1‑140 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGTGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatgt < 2:521880/141‑2 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATgg < 1:564968/141‑1 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATgg < 2:1417661/141‑1 (MQ=255) aaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGc > 1:81102/1‑141 (MQ=255) aaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGc > 2:1274763/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGTATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCa > 1:658030/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATTTTAATGCTTTGTATTTAACTAAATGATTGGCa > 2:509819/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCa > 1:58573/1‑141 (MQ=255) ccAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCAt < 1:746063/141‑1 (MQ=255) ccAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCAt < 2:955036/141‑1 (MQ=255) cAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATg < 1:40591/141‑1 (MQ=255) aGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTa < 1:278204/141‑1 (MQ=255) gCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAt > 1:862533/1‑141 (MQ=255) cAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAtt < 1:636465/141‑1 (MQ=255) aTGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTAc > 1:1011130/1‑141 (MQ=255) aaaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACata < 1:457004/141‑1 (MQ=255) aaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACatat < 1:1595703/141‑1 (MQ=255) aaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACatat > 1:166189/1‑141 (MQ=255) aaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACatat > 1:1176699/1‑141 (MQ=255) ctactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCa < 2:1095391/141‑1 (MQ=255) ctactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCa < 2:1175890/141‑1 (MQ=255) tactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGTTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCaa < 2:1590170/141‑1 (MQ=255) ctTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAAcc > 2:797858/1‑141 (MQ=255) ttCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCg > 1:623697/1‑141 (MQ=255) tcaACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGtttt > 1:79036/1‑141 (MQ=255) caACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGttttt < 2:1036252/141‑1 (MQ=255) aTTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtt > 2:582196/1‑93 (MQ=255) tCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGTGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGTCATGTATTACATATCAACTGTGTTTCAATGAACCa < 2:281845/141‑1 (MQ=255) ccAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCat < 1:1473541/141‑1 (MQ=255) ccAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATAGCAACCGTTTTTCAATGAGCCat < 1:776996/141‑1 (MQ=255) cAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACGCTACTACAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACACATCATCCGTTTTTCAATGAGCCata < 2:1349109/141‑1 (MQ=255) cAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCata < 2:369210/141‑1 (MQ=255) cATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCttt > 1:438222/1‑141 (MQ=255) cATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCttt > 1:337374/1‑141 (MQ=255) aTAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCtttt < 2:777064/141‑1 (MQ=255) tAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCttttt > 2:752741/1‑141 (MQ=255) gTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTgg < 1:1511595/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATACCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGtat > 2:101206/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATaa > 2:624808/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATaa < 1:503592/141‑1 (MQ=255) aaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATg > 1:1628849/1‑139 (MQ=255) aaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATg < 2:1628849/139‑1 (MQ=255) aaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACg < 2:625434/141‑1 (MQ=255) aaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACg < 2:381103/141‑1 (MQ=255) aTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGc > 2:16017/1‑141 (MQ=255) gAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCAt > 1:81949/1‑141 (MQ=255) gAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCAt > 1:203325/1‑141 (MQ=255) aTACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATgg < 1:1563960/141‑1 (MQ=255) aTACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCGTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATgg < 1:1028830/141‑1 (MQ=255) acacTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTa > 1:312780/1‑141 (MQ=255) ctaAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGc > 1:744112/1‑103 (MQ=255) caaagccttaatatcatgcgcaatattcgtagcatgacattaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATg > 2:1564831‑M2/50‑141 (MQ=255) caaagccttaatatcatgcgcaatattcgtagcatgacattaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATg > 1:1657285‑M2/50‑141 (MQ=255) AAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGc < 1:1218012‑M1/141‑1 (MQ=255) gccttaatatcatgcgcaatattcgtagcatgacattaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAAt > 1:1414759‑M2/46‑141 (MQ=255) GCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAAt > 1:1102567‑M1/1‑141 (MQ=255) GCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAAt < 2:321757‑M1/141‑1 (MQ=255) CTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACGTATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATAc > 1:827127‑M1/1‑141 (MQ=255) TTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACa > 2:1218012‑M1/1‑141 (MQ=255) aatatcatgcgcaatattcgtagcatgacattaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCg < 1:1240802‑M2/40‑1 (MQ=255) aatatcatgcgcaatattcgtagcatgacattaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCg > 2:1240802‑M2/41‑80 (MQ=255) aatatcatgcgcaatattcgtagcatgacattaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATc > 1:1582200‑M2/41‑141 (MQ=255) AATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATc > 1:1156142‑M1/1‑141 (MQ=255) ATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATcc < 1:533128‑M1/141‑1 (MQ=255) TGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCata > 2:1333‑M1/1‑95 (MQ=255) TGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCata < 1:1333‑M1/95‑1 (MQ=255) tCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCaaa < 2:599292/141‑1 (MQ=255) cTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCg > 2:1065417/1‑141 (MQ=255) tACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGc < 2:166125/141‑1 (MQ=255) tACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGc < 1:796561/141‑1 (MQ=255) aaTATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAg < 2:1143309/141‑1 (MQ=255) aaTATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAg < 2:364100/141‑1 (MQ=255) aaTATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATACAAATACCGCTAAg > 2:729278/1‑141 (MQ=255) atatTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGa > 2:1527080/1‑141 (MQ=255) tatTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTCTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAATTACCGCTAAGaa > 2:487691/1‑141 (MQ=255) atTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGaaa < 2:491812/141‑1 (MQ=255) ttGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGt < 2:693097/106‑1 (MQ=255) gcATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAaaataaa > 1:952609/1‑141 (MQ=255) cATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAaaataaat < 2:38372/141‑1 (MQ=255) atcttaatgctttGTATATAACTAAACGAATGTCACGTATTCTCTATCAACCGTTTTTCAATGATCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCAGGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTa < 1:1306627‑M2/128‑1 (MQ=255) attaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTaaa > 2:110645‑M2/12‑141 (MQ=255) ttaaggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAAt < 1:272443‑M2/131‑1 (MQ=255) aggctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAATGAc > 2:1492667‑M2/8‑141 (MQ=255) gctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAATGACtt < 2:828362‑M2/136‑1 (MQ=255) gctttGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAATGACtt < 2:828368‑M2/136‑1 (MQ=255) tGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAATGACTTGATc < 1:690191‑M2/140‑1 (MQ=255) | CATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGCAATACATCCAAATACCGCTAAGAAAATAAATGCTAAATGACTTGATCC > CP000730/2508346‑2508626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |