| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2317464 | 123 (1.130) | 6 (0.070) +GCTCGGCACTAAAATGGTGTGCCGAGCT |
6/212 | 12.4 | 5.7% | intergenic (+117/+1999) | rhbC/asp23 | possible Iuc family aerobactin synthesis protein/alkaline shock protein 23 |
| ? | CP000730 | 2319448 = | 129 (1.180) | intergenic (+2101/+15) | rhbC/asp23 | possible Iuc family aerobactin synthesis protein/alkaline shock protein 23 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACATCTAAACCAGTAAT > CP000730/2319309‑2319588 | tAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCtt < 1:456309/141‑1 (MQ=33) aaTGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCttt > 1:1041958/1‑141 (MQ=34) ggCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTa < 2:413956/141‑1 (MQ=35) cTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGa > 2:703168/1‑141 (MQ=40) cTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGa > 1:1224277/1‑141 (MQ=39) cTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGa > 1:1135053/1‑141 (MQ=40) ttAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACGTTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATGGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGaa < 1:1006251/141‑1 (MQ=255) atatAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATaa > 1:1330429/1‑141 (MQ=255) taAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACtt > 2:64265/1‑141 (MQ=255) ggAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTAtt > 2:249435/1‑141 (MQ=255) ggAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTAtt > 2:1269169/1‑141 (MQ=255) ggAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTAtt > 1:734755/1‑141 (MQ=255) aaTAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAAc > 1:1147787/1‑132 (MQ=255) aaTAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAAc < 2:1147787/132‑1 (MQ=255) aTAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTaaa > 2:978293/1‑141 (MQ=255) gcagcTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCt < 1:410954/141‑1 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gCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTgg < 1:64265/141‑1 (MQ=255) gCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTgg > 2:327299/1‑141 (MQ=255) cTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGt < 2:182633/141‑1 (MQ=255) cTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGt > 2:1371471/1‑141 (MQ=255) tGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGtg > 1:139298/1‑140 (MQ=255) gTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTa < 1:1364859/141‑1 (MQ=255) aaaaaTTAGAAAATAAATATCAATAAAGCTGTTTTCTATCAAATAATTAATAGATATCAGCTTTTTTACATGGCCTAAGAATTTAATGTCCCTAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTa < 2:827972/137‑1 (MQ=21) tACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTAt > 2:235949/1‑141 (MQ=255) tACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTAt > 1:1077865/1‑141 (MQ=255) aTTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCATATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCACTTTTTATCGAATAACTTAGTGTAAACTTTGTCGTTCTTGGTTTTTGt > 2:1174252/1‑141 (MQ=18) aaaTACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGt > 1:393714/1‑141 (MQ=255) aaaTACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGt > 1:1384321/1‑141 (MQ=255) aaaTACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGt > 2:252037/1‑141 (MQ=255) aaaTACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGt > 2:199816/1‑141 (MQ=255) aaaTACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGt > 1:1323815/1‑141 (MQ=255) atatCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTAtttt < 1:614675/141‑1 (MQ=255) tatCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCGTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTAttttt > 1:1378674/1‑141 (MQ=255) tatCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTCTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTAttttt > 1:387996/1‑141 (MQ=255) tCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTAttttttt < 1:676074/141‑1 (MQ=255) tCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTAttttttt < 1:676243/141‑1 (MQ=255) aataaaGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGGAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTATACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCg < 2:294960/138‑1 (MQ=255) aaaaaaGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCg < 2:591275/141‑1 (MQ=255) aaaaaGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCgt < 2:865603/141‑1 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tATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCAc < 1:945101/141‑1 (MQ=255) aTCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCCTTGGTATTGTTTTCGTTATCTTTTTCGTATTTCTGCTTCCAcc > 2:1144513/1‑140 (MQ=25) tCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCActc > 2:885971/1‑141 (MQ=255) ataatTAATCGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCtttt > 1:1220819/1‑141 (MQ=255) ataatTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCtttt < 1:859940/141‑1 (MQ=255) taattaatAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCttttt < 2:605068/141‑1 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aGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCCACTCTTTTGGAGTCATTATTTCGTCTACTTGCATGTTTGCTTc > 2:1061984/1‑141 (MQ=255) ttAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTa < 1:633600/141‑1 (MQ=255) tAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAAcaca > 1:1076102/1‑138 (MQ=255) aaTGGCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACa < 2:1161523/141‑1 (MQ=255) aTGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCg < 2:80354/77‑1 (MQ=255) aTGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCg > 1:80354/1‑77 (MQ=255) gtgccgagcttttttATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCATTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCATTCTTTTTGAGTCATTACATCATCAACTTGCATGTTAACTTCAACAACATCTa > 2:964000/11‑141 (MQ=255) cccAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACATCTaa > 2:186204/1‑141 (MQ=255) ccAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACATCTaaa > 1:358409/1‑141 (MQ=255) ccAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACATCTaaa > 1:7141/1‑141 (MQ=255) cTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACt > 2:765083/1‑119 (MQ=255) tttttATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTTTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACATCTAAACCAGTAat > 2:91728/1‑141 (MQ=255) | TAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAATTTAATGTCCCAAGCCCTTTTTATCGAATAACTTATTGTAAACCTTGTCTTTCTTGGTTATTGTTTTCGTTATTTTTTTCGTGTTTTTGTTTCCACTCTTTTTGAGTCATTACATCGTCAACTTGCATGTTAACTTCAACTACATCTAAACCAGTAAT > CP000730/2319309‑2319588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |